More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0279 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0279  hypothetical protein  100 
 
 		 423 aa  810    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0267805 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0322  hypothetical protein  85.12 
 
 		 487 aa  659    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.084246  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0238  hypothetical protein  50.42 
 
 		 421 aa  317  2e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.817468 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0169  hypothetical protein  49.86 
 
 		 381 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0457  hypothetical protein  48.84 
 
 		 383 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0178  hypothetical protein  49.86 
 
 		 381 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0159  hypothetical protein  49.86 
 
 		 381 aa  303  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0479062 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0978  hypothetical protein  45.29 
 
 		 452 aa  292  8e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.42646  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1164  hypothetical protein  46.29 
 
 		 457 aa  292  9e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.23073  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4482  protein of unknown function UPF0118  51.01 
 
 		 390 aa  290  5.0000000000000004e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255906  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5305  hypothetical protein  45.83 
 
 		 464 aa  289  8e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.111321  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0195  hypothetical protein  48.71 
 
 		 384 aa  282  7.000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1236  protein of unknown function UPF0118  46.57 
 
 		 439 aa  278  2e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000518014 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7052  protein of unknown function UPF0118  51.17 
 
 		 402 aa  271  1e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10207  transmembrane protein  47.98 
 
 		 367 aa  270  5e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39490  predicted permease  49.18 
 
 		 403 aa  268  1e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.233759  normal  0.317185 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1161  hypothetical protein  43.91 
 
 		 415 aa  262  8.999999999999999e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0938  protein of unknown function UPF0118  46.42 
 
 		 420 aa  261  2e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08190  predicted permease  44.92 
 
 		 455 aa  259  9e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0210651 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2637  protein of unknown function UPF0118  47.65 
 
 		 421 aa  256  6e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4772  protein of unknown function UPF0118  50.43 
 
 		 475 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.808425  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1098  protein of unknown function UPF0118  47.58 
 
 		 396 aa  237  3e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.370016  normal  0.531721 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1895  protein of unknown function UPF0118  43.02 
 
 		 483 aa  235  1.0000000000000001e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23100  predicted permease  41.38 
 
 		 477 aa  231  3e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.741637  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05050  predicted permease  43.22 
 
 		 405 aa  227  2e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.187674  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1700  hypothetical protein  38.99 
 
 		 429 aa  223  3e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039584 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2291  hypothetical protein  40.91 
 
 		 407 aa  212  1e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.370535  normal  0.257699 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1468  protein of unknown function UPF0118  40.06 
 
 		 368 aa  210  4e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.916675  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08290  predicted permease  40.52 
 
 		 367 aa  202  7e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2203  protein of unknown function UPF0118  39.81 
 
 		 397 aa  196  5.000000000000001e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0681126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21060  predicted permease  37.36 
 
 		 436 aa  192  9e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.152627  normal  0.29168 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2806  protein of unknown function UPF0118  38.76 
 
 		 387 aa  188  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00669184 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2286  protein of unknown function UPF0118  35.1 
 
 		 418 aa  186  6e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0673264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1881  hypothetical protein  35.42 
 
 		 435 aa  180  4e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2026  protein of unknown function UPF0118  35.31 
 
 		 398 aa  178  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2803  protein of unknown function UPF0118  35.84 
 
 		 441 aa  177  4e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.168707  normal  0.0979616 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0907  protein of unknown function UPF0118  37.61 
 
 		 423 aa  174  2.9999999999999996e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00600861  normal  0.0221352 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3105  hypothetical protein  38.34 
 
 		 389 aa  174  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6766  permease-like protein  41.69 
 
 		 432 aa  174  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3393  protein of unknown function UPF0118  30.71 
 
 		 426 aa  172  9e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.334585  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1050  protein of unknown function UPF0118  40.2 
 
 		 384 aa  171  2e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1252  hypothetical protein  33.33 
 
 		 376 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2128  protein of unknown function UPF0118  35.26 
 
 		 444 aa  158  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.813628  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4850  hypothetical protein  34.35 
 
 		 394 aa  158  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3110  protein of unknown function UPF0118  35.99 
 
 		 414 aa  155  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3823  protein of unknown function UPF0118  35.65 
 
 		 390 aa  155  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0609806  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1226  hypothetical protein  36.05 
 
 		 376 aa  153  5e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1243  hypothetical protein  36.05 
 
 		 376 aa  153  5e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.597847 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0503  protein of unknown function UPF0118  32.07 
 
 		 416 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14120  predicted permease  34.65 
 
 		 476 aa  144  3e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.209203  normal  0.521602 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4624  protein of unknown function UPF0118  39.33 
 
 		 393 aa  137  5e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  32.93 
 
 		 529 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2613  protein of unknown function UPF0118  32.86 
 
 		 392 aa  134  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.047245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6257  protein of unknown function UPF0118  35.52 
 
 		 389 aa  129  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.707833  normal  0.194644 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7599  hypothetical protein  33.75 
 
 		 355 aa  124  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0354819  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  28.16 
 
 		 405 aa  121  3e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  29.63 
 
 		 358 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2165  hypothetical protein  29.82 
 
 		 414 aa  112  9e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.128502  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  28.05 
 
 		 402 aa  111  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  28.05 
 
 		 402 aa  111  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2641  protein of unknown function UPF0118  29.91 
 
 		 408 aa  109  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.517547  normal  0.208528 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  30.39 
 
 		 354 aa  108  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7547  protein of unknown function UPF0118  26.74 
 
 		 392 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43907  normal  0.494892 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0120  protein of unknown function UPF0118  25.24 
 
 		 436 aa  104  3e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8629  permease-like protein  29.47 
 
 		 423 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1485  protein of unknown function UPF0118  29.6 
 
 		 455 aa  102  1e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.823858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1247  protein of unknown function UPF0118  27.84 
 
 		 388 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1352  protein of unknown function UPF0118  27.27 
 
 		 438 aa  100  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3615  hypothetical protein  29.45 
 
 		 412 aa  100  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0558  hypothetical protein  27.33 
 
 		 362 aa  100  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0561744  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0221  protein of unknown function UPF0118  27.22 
 
 		 364 aa  99.8  9e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795849 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2485  hypothetical protein  28.76 
 
 		 435 aa  98.6  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.957524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0518  protein of unknown function UPF0118  30.93 
 
 		 397 aa  98.6  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.318359  normal  0.0533128 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  28.93 
 
 		 390 aa  97.4  4e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4060  hypothetical protein  27.06 
 
 		 404 aa  96.3  8e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000137982  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0061  hypothetical protein  27.27 
 
 		 383 aa  95.9  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  27.22 
 
 		 373 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1973  hypothetical protein  28.48 
 
 		 369 aa  95.1  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0953876  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1762  hypothetical protein  27.76 
 
 		 329 aa  94.7  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1731  protein of unknown function UPF0118  29.64 
 
 		 373 aa  95.1  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3565  hypothetical protein  27.99 
 
 		 356 aa  95.1  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  27.53 
 
 		 361 aa  95.5  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0708  protein of unknown function UPF0118  31.47 
 
 		 429 aa  94.7  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  27.22 
 
 		 348 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  27.22 
 
 		 361 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  27.59 
 
 		 361 aa  93.6  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  27.59 
 
 		 361 aa  93.6  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  27.59 
 
 		 361 aa  93.6  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  27.59 
 
 		 348 aa  94  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4001  hypothetical protein  27.51 
 
 		 368 aa  94  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.591053 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  27.6 
 
 		 341 aa  93.6  6e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2868  protein of unknown function UPF0118  30.61 
 
 		 400 aa  93.6  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  29.03 
 
 		 363 aa  93.6  7e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15290  predicted permease  26.79 
 
 		 415 aa  93.2  8e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1781  protein of unknown function UPF0118  28.22 
 
 		 368 aa  93.2  9e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.836553  hitchhiker  0.00769603 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  28.17 
 
 		 344 aa  93.2  9e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  25.88 
 
 		 361 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  25.88 
 
 		 361 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2329  protein of unknown function UPF0118  31.07 
 
 		 436 aa  91.3  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000385102 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2839  protein of unknown function UPF0118  27.61 
 
 		 363 aa  90.9  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0111296  normal  0.2349 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>