More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1315 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_1315  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 
369 aa  704    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.494628  normal  0.216518 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2478  hypothetical protein  55.83 
 
 
369 aa  335  5e-91  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3012  protein of unknown function UPF0118  51.22 
 
 
369 aa  315  9.999999999999999e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2477  hypothetical protein  48.28 
 
 
378 aa  282  7.000000000000001e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  40.6 
 
 
371 aa  263  3e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  26.63 
 
 
343 aa  134  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  27.42 
 
 
351 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4001  hypothetical protein  29.46 
 
 
368 aa  132  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.591053 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  30.15 
 
 
344 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  29.41 
 
 
354 aa  130  3e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1242  protein of unknown function UPF0118  32.67 
 
 
374 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  hitchhiker  0.00297495 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1096  protein of unknown function UPF0118  30.96 
 
 
374 aa  126  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.771823  hitchhiker  0.00624948 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  32.22 
 
 
379 aa  125  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1164  hypothetical protein  32.98 
 
 
457 aa  124  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.23073  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0793  hypothetical protein  32.52 
 
 
379 aa  124  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114477  normal  0.678459 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  27.9 
 
 
341 aa  123  5e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  26.28 
 
 
396 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  27.02 
 
 
369 aa  120  3e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  26.32 
 
 
405 aa  120  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  31.48 
 
 
345 aa  119  7e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  24.22 
 
 
351 aa  119  9e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2291  hypothetical protein  29.79 
 
 
424 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  27.97 
 
 
349 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  26.25 
 
 
390 aa  117  1.9999999999999998e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  29.85 
 
 
370 aa  117  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  31.41 
 
 
374 aa  116  6e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  26.73 
 
 
402 aa  116  6.9999999999999995e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  26.73 
 
 
402 aa  116  6.9999999999999995e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  31.07 
 
 
363 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0961  protein of unknown function UPF0118  30.6 
 
 
382 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685895 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2491  protein of unknown function UPF0118  25.96 
 
 
353 aa  114  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2485  hypothetical protein  29.66 
 
 
435 aa  114  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.957524  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0657  permease  29.01 
 
 
384 aa  113  4.0000000000000004e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.036358  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  29.45 
 
 
393 aa  113  5e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  28.08 
 
 
529 aa  113  5e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2050  hypothetical protein  28.61 
 
 
368 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116574  hitchhiker  0.00000000347502 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  27.48 
 
 
361 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1156  permease  27.46 
 
 
382 aa  112  1.0000000000000001e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0866214  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1781  protein of unknown function UPF0118  25.61 
 
 
368 aa  112  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.836553  hitchhiker  0.00769603 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0749  protein of unknown function UPF0118  29.7 
 
 
417 aa  110  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0457  hypothetical protein  30.08 
 
 
383 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0960  protein of unknown function UPF0118  31.33 
 
 
353 aa  109  6e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02243  permease  31.74 
 
 
388 aa  109  8.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0224  protein of unknown function UPF0118  25.84 
 
 
345 aa  108  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000072412  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3129  hypothetical protein  31.18 
 
 
418 aa  108  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  25.54 
 
 
355 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_002978  WD1144  hypothetical protein  25.92 
 
 
354 aa  107  2e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  unclonable  0.00155039  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  25.54 
 
 
355 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  25.54 
 
 
355 aa  108  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  25.54 
 
 
355 aa  108  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  25.54 
 
 
355 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1113  hypothetical protein  30.09 
 
 
363 aa  107  3e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0939063  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  25.79 
 
 
355 aa  106  5e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  22.84 
 
 
349 aa  106  6e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  28.49 
 
 
354 aa  106  7e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  24.27 
 
 
361 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  24.27 
 
 
361 aa  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  24.27 
 
 
348 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  24.27 
 
 
361 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  25.31 
 
 
355 aa  105  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2329  protein of unknown function UPF0118  27.92 
 
 
436 aa  105  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000385102 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  25.22 
 
 
355 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  23.95 
 
 
373 aa  105  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2169  hypothetical protein  26.09 
 
 
368 aa  104  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.215488  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2994  hypothetical protein  32.12 
 
 
360 aa  105  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00687092 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  28.69 
 
 
358 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  23.95 
 
 
361 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08190  predicted permease  30.63 
 
 
455 aa  105  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0210651 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  23.95 
 
 
348 aa  103  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0195  hypothetical protein  30.64 
 
 
384 aa  104  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566996  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  24.76 
 
 
361 aa  104  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  24.76 
 
 
361 aa  104  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  23.62 
 
 
361 aa  103  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1297  hypothetical protein  33.49 
 
 
382 aa  103  7e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.675511  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0555  protein of unknown function UPF0118  40.88 
 
 
364 aa  102  8e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0938  protein of unknown function UPF0118  31.15 
 
 
420 aa  102  9e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2339  protein of unknown function UPF0118  30.89 
 
 
370 aa  102  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3055  permease  26.95 
 
 
376 aa  102  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0055436  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2065  hypothetical protein  30.89 
 
 
370 aa  102  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.76219  normal  0.0900338 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3083  hypothetical protein  26.52 
 
 
373 aa  102  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000376158  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5162  hypothetical protein  32.16 
 
 
382 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235316  normal  0.0183443 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1964  hypothetical protein  26.9 
 
 
378 aa  102  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1773  hypothetical protein  27.27 
 
 
357 aa  102  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000027115  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3380  hypothetical protein  26.65 
 
 
376 aa  101  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.300528  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3161  hypothetical protein  26.95 
 
 
376 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000118258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3145  permease  26.95 
 
 
376 aa  101  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000188051  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3380  hypothetical protein  26.95 
 
 
373 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3410  hypothetical protein  26.95 
 
 
376 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1880  hypothetical protein  26.06 
 
 
372 aa  101  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0162246  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2596  hypothetical protein  26.69 
 
 
371 aa  101  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1300  hypothetical protein  32.42 
 
 
434 aa  101  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.493989  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3397  hypothetical protein  31.23 
 
 
412 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.947024  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2385  protein of unknown function UPF0118  25.12 
 
 
542 aa  101  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.322706 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  23.34 
 
 
392 aa  100  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0195  protein of unknown function UPF0118  29.45 
 
 
486 aa  100  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0728  protein of unknown function UPF0118  27.63 
 
 
363 aa  100  4e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1871  membrane protein YubA  26.52 
 
 
373 aa  100  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1702  permease, putative  28.87 
 
 
357 aa  100  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.303674  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2201  hypothetical protein  27.84 
 
 
365 aa  100  5e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000750597  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5351  protein of unknown function UPF0118  28.66 
 
 
364 aa  99.8  6e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0138969  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>