More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2477 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2477  hypothetical protein  100 
 
 		 378 aa  721    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3012  protein of unknown function UPF0118  57.26 
 
 		 369 aa  356  2.9999999999999997e-97  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2478  hypothetical protein  51.19 
 
 		 369 aa  316  4e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1315  protein of unknown function UPF0118  48.28 
 
 		 369 aa  275  9e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.494628  normal  0.216518 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  38.34 
 
 		 371 aa  215  9.999999999999999e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  29.01 
 
 		 343 aa  106  8e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  27.22 
 
 		 354 aa  105  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  30.43 
 
 		 363 aa  102  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  28.81 
 
 		 529 aa  102  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  28.74 
 
 		 344 aa  98.6  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1113  hypothetical protein  30.08 
 
 		 363 aa  96.7  7e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0939063  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  28.7 
 
 		 370 aa  93.2  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2050  hypothetical protein  26.45 
 
 		 368 aa  92.4  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116574  hitchhiker  0.00000000347502 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0725  protein of unknown function UPF0118  32.35 
 
 		 347 aa  92  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0808655  hitchhiker  0.000000275011 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0571  hypothetical protein  32.35 
 
 		 347 aa  92  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.442056  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0195  protein of unknown function UPF0118  28.08 
 
 		 486 aa  92.4  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1773  hypothetical protein  27.59 
 
 		 357 aa  92  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000027115  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  25.92 
 
 		 341 aa  91.7  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  25.54 
 
 		 396 aa  90.9  3e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4001  hypothetical protein  25.57 
 
 		 368 aa  90.9  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.591053 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  26.5 
 
 		 345 aa  89  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  23.83 
 
 		 405 aa  87.4  3e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2702  hypothetical protein  27.7 
 
 		 353 aa  87.8  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0593591 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0224  protein of unknown function UPF0118  24.04 
 
 		 345 aa  87.8  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000072412  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2485  hypothetical protein  27.37 
 
 		 435 aa  87  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.957524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3083  hypothetical protein  26.4 
 
 		 373 aa  87.4  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000376158  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  27.69 
 
 		 354 aa  87  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2385  protein of unknown function UPF0118  25.13 
 
 		 542 aa  86.7  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.322706 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0728  protein of unknown function UPF0118  28.32 
 
 		 363 aa  86.7  6e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2291  hypothetical protein  27.3 
 
 		 424 aa  86.7  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3355  hypothetical protein  26.09 
 
 		 373 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1871  membrane protein YubA  26.23 
 
 		 373 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  25.52 
 
 		 393 aa  84.7  0.000000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  28.28 
 
 		 374 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3380  hypothetical protein  26.23 
 
 		 376 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.300528  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3161  hypothetical protein  26.23 
 
 		 376 aa  84  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000118258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3145  permease  26.23 
 
 		 376 aa  84  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000188051  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3055  permease  26.23 
 
 		 376 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0055436  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3410  hypothetical protein  26.23 
 
 		 376 aa  84  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0061  hypothetical protein  30.8 
 
 		 383 aa  84  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3380  hypothetical protein  26.23 
 
 		 373 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0225  protein of unknown function UPF0118  23.01 
 
 		 345 aa  84  0.000000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000651141  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7547  protein of unknown function UPF0118  24.18 
 
 		 392 aa  83.6  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43907  normal  0.494892 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  25 
 
 		 369 aa  83.2  0.000000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  24.18 
 
 		 351 aa  82.4  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2491  protein of unknown function UPF0118  23.92 
 
 		 353 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3381  membrane protein YubA  25.93 
 
 		 373 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00559166  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  25.07 
 
 		 390 aa  82  0.00000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1144  hypothetical protein  23.92 
 
 		 354 aa  81.6  0.00000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  unclonable  0.00155039  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3407  hypothetical protein  27.27 
 
 		 407 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  24 
 
 		 351 aa  80.9  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1781  protein of unknown function UPF0118  24.48 
 
 		 368 aa  80.9  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.836553  hitchhiker  0.00769603 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  23.75 
 
 		 349 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3715  hypothetical protein  25.88 
 
 		 412 aa  80.5  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291378 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  23.03 
 
 		 355 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  23.03 
 
 		 355 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  23.03 
 
 		 355 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  23.03 
 
 		 355 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10207  transmembrane protein  28.26 
 
 		 367 aa  80.1  0.00000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  23.03 
 
 		 355 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0503  protein of unknown function UPF0118  28.43 
 
 		 416 aa  79.7  0.00000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1623  PerM family permease  25.58 
 
 		 367 aa  79  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.134997 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0120  protein of unknown function UPF0118  26.05 
 
 		 436 aa  79  0.0000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2203  protein of unknown function UPF0118  26.55 
 
 		 397 aa  79  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0681126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1855  hypothetical protein  27.64 
 
 		 380 aa  79.3  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.631285 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2329  protein of unknown function UPF0118  25.62 
 
 		 436 aa  79  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000385102 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  22.8 
 
 		 355 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  23.21 
 
 		 402 aa  78.2  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  22.8 
 
 		 355 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1855  hypothetical protein  25.58 
 
 		 368 aa  78.2  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0735664  normal  0.142574 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8629  permease-like protein  27.17 
 
 		 423 aa  78.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1156  permease  24.64 
 
 		 382 aa  78.2  0.0000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0866214  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  23.21 
 
 		 402 aa  78.2  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1439  hypothetical protein  26.88 
 
 		 366 aa  77.8  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0335022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0961  protein of unknown function UPF0118  30.81 
 
 		 382 aa  77  0.0000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685895 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2668  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  30.05 
 
 		 665 aa  77  0.0000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1164  hypothetical protein  28.53 
 
 		 457 aa  76.6  0.0000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.23073  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0457  hypothetical protein  27.97 
 
 		 383 aa  76.6  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2189  protein of unknown function UPF0118  31.69 
 
 		 396 aa  76.3  0.0000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.289237  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3129  hypothetical protein  28.03 
 
 		 418 aa  75.9  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0279  hypothetical protein  27.61 
 
 		 423 aa  75.9  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0267805 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  22.8 
 
 		 355 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1354  hypothetical protein  24.56 
 
 		 375 aa  75.9  0.000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000360215  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1225  hypothetical protein  30.41 
 
 		 357 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.220929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0195  hypothetical protein  28.93 
 
 		 384 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4523  hypothetical protein  23.33 
 
 		 355 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0610501  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3308  protein of unknown function UPF0118  28.23 
 
 		 452 aa  75.1  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783017  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3462  hypothetical protein  29.53 
 
 		 418 aa  75.5  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0247174 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  27.25 
 
 		 358 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3538  hypothetical protein  27.55 
 
 		 406 aa  74.7  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.25155 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1556  hypothetical protein  26.24 
 
 		 407 aa  74.3  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  23.72 
 
 		 349 aa  74.3  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02243  permease  27.09 
 
 		 388 aa  73.9  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3480  protein of unknown function UPF0118  30.62 
 
 		 412 aa  73.9  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.904351  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2994  hypothetical protein  27.6 
 
 		 360 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687092 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2596  hypothetical protein  26.91 
 
 		 371 aa  73.9  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1694  permease-like protein  25.43 
 
 		 443 aa  73.9  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111642  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2453  protein of unknown function UPF0118  29.68 
 
 		 356 aa  73.6  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.563612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2164  hypothetical protein  28.02 
 
 		 369 aa  73.9  0.000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0910  hypothetical protein  23.33 
 
 		 379 aa  73.6  0.000000000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>