More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3715 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3715  hypothetical protein  100 
 
 		 412 aa  792    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291378 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3538  hypothetical protein  84.33 
 
 		 406 aa  630  1e-180  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.25155 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  25.68 
 
 		 351 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  26.49 
 
 		 351 aa  108  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07790  predicted permease  25.99 
 
 		 492 aa  106  8e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.132097 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2437  protein of unknown function UPF0118  24.34 
 
 		 386 aa  104  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000151216  normal  0.0209402 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  24.77 
 
 		 344 aa  103  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1056  hypothetical protein  27.19 
 
 		 398 aa  103  5e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  26.33 
 
 		 341 aa  103  8e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  24.31 
 
 		 343 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1354  hypothetical protein  25.54 
 
 		 375 aa  101  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000360215  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1113  hypothetical protein  29.97 
 
 		 363 aa  99  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0939063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  25.23 
 
 		 355 aa  99  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  26.21 
 
 		 354 aa  99  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  25.23 
 
 		 355 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  25.23 
 
 		 355 aa  97.4  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  25.23 
 
 		 355 aa  97.4  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  25.23 
 
 		 355 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  25.23 
 
 		 355 aa  97.4  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  25.23 
 
 		 355 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  22.82 
 
 		 349 aa  97.1  5e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0707  permease, putative  25 
 
 		 391 aa  95.9  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0209  protein of unknown function UPF0118  27.51 
 
 		 399 aa  95.9  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1352  protein of unknown function UPF0118  23.94 
 
 		 438 aa  94.7  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  24.61 
 
 		 355 aa  95.1  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  28.92 
 
 		 358 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002790  permease PerM  27.5 
 
 		 357 aa  94.4  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  25.29 
 
 		 393 aa  94.7  3e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  21.81 
 
 		 396 aa  94  4e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0522  hypothetical protein  25.5 
 
 		 377 aa  94.4  4e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.176917  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2435  hypothetical protein  31.14 
 
 		 358 aa  94.4  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0853714  normal  0.0537169 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0779  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  31.14 
 
 		 375 aa  94  5e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.770407  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02243  permease  28.24 
 
 		 388 aa  93.2  8e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4523  hypothetical protein  25.55 
 
 		 355 aa  93.2  9e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0610501  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0823  protein of unknown function UPF0118  25.17 
 
 		 358 aa  92.4  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74505  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  25.4 
 
 		 354 aa  91.7  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  24.34 
 
 		 379 aa  91.3  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0190  hypothetical protein  26.87 
 
 		 356 aa  91.3  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0716  hypothetical protein  24.36 
 
 		 366 aa  90.9  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.073836  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4001  hypothetical protein  25.23 
 
 		 368 aa  90.9  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.591053 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1300  hypothetical protein  28.76 
 
 		 434 aa  90.9  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.493989  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2818  hypothetical protein  25.32 
 
 		 363 aa  90.5  5e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2556  protein of unknown function UPF0118  23.39 
 
 		 429 aa  90.1  6e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  26.06 
 
 		 363 aa  89.7  8e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  23.97 
 
 		 361 aa  89  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0728  protein of unknown function UPF0118  22.54 
 
 		 363 aa  89  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2575  hypothetical protein  27.86 
 
 		 415 aa  88.6  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41372  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1964  hypothetical protein  27.93 
 
 		 378 aa  88.2  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  20.51 
 
 		 369 aa  88.6  2e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0971  protein of unknown function UPF0118  27.66 
 
 		 389 aa  87  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0710399 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0632  hypothetical protein  26.54 
 
 		 348 aa  87  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000226632  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1297  hypothetical protein  28.12 
 
 		 382 aa  87  5e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.675511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0259  protein of unknown function UPF0118  27.69 
 
 		 356 aa  86.7  7e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  24.05 
 
 		 361 aa  86.7  7e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0111  permease  25.59 
 
 		 394 aa  86.7  7e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1556  hypothetical protein  25.97 
 
 		 407 aa  86.7  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0742  protein of unknown function UPF0118  26.26 
 
 		 361 aa  86.3  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  22.73 
 
 		 405 aa  85.9  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  22.18 
 
 		 345 aa  85.5  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3129  hypothetical protein  27.99 
 
 		 418 aa  85.9  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3102  hypothetical protein  25.78 
 
 		 352 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1242  protein of unknown function UPF0118  26.5 
 
 		 374 aa  85.1  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  hitchhiker  0.00297495 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0400  hypothetical protein  28.74 
 
 		 357 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  26.11 
 
 		 371 aa  85.1  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  23.2 
 
 		 390 aa  85.1  0.000000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  22.47 
 
 		 349 aa  84.3  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  28.65 
 
 		 374 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2169  hypothetical protein  23.48 
 
 		 368 aa  84.7  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.215488  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1880  hypothetical protein  23.12 
 
 		 372 aa  84.3  0.000000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0162246  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2641  protein of unknown function UPF0118  24.68 
 
 		 408 aa  84  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.517547  normal  0.208528 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2732  hypothetical protein  27.87 
 
 		 345 aa  84  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4544  hypothetical protein  25.92 
 
 		 381 aa  83.6  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1973  hypothetical protein  23.69 
 
 		 369 aa  83.2  0.000000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0953876  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1623  PerM family permease  24.57 
 
 		 367 aa  83.2  0.000000000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.134997 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4473  hypothetical protein  24.61 
 
 		 356 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17401  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2006  hypothetical protein  22.67 
 
 		 363 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000247505  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2165  hypothetical protein  22.71 
 
 		 414 aa  82.8  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.128502  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1855  hypothetical protein  24.57 
 
 		 368 aa  82.8  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0735664  normal  0.142574 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2481  hypothetical protein  25.18 
 
 		 356 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.691389  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0749  protein of unknown function UPF0118  24 
 
 		 417 aa  82.8  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  26.89 
 
 		 370 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1096  protein of unknown function UPF0118  25.87 
 
 		 374 aa  81.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.771823  hitchhiker  0.00624948 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1911  hypothetical protein  23.96 
 
 		 372 aa  82  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24805  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0713  permease, putative  27.3 
 
 		 382 aa  81.3  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.658083  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1990  protein of unknown function UPF0118  22.68 
 
 		 372 aa  81.3  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2201  hypothetical protein  23.78 
 
 		 365 aa  81.6  0.00000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000750597  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3462  hypothetical protein  26.44 
 
 		 418 aa  80.9  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0247174 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0703  putative permease  27.3 
 
 		 382 aa  81.3  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2491  protein of unknown function UPF0118  24.14 
 
 		 353 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1649  hypothetical protein  23.84 
 
 		 360 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.673436  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0467  hypothetical protein  27.71 
 
 		 339 aa  80.9  0.00000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000010449  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3397  hypothetical protein  24.88 
 
 		 412 aa  80.5  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.947024  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3565  hypothetical protein  29.94 
 
 		 356 aa  80.5  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  23.24 
 
 		 361 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  23.24 
 
 		 361 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  23.24 
 
 		 361 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  23.24 
 
 		 348 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1742  putative permease PerM  23.9 
 
 		 354 aa  80.5  0.00000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2485  hypothetical protein  24.01 
 
 		 435 aa  80.1  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.957524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2382  membrane protein  23.71 
 
 		 355 aa  80.1  0.00000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>