More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2437 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2437  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 		 386 aa  743    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000151216  normal  0.0209402 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1485  protein of unknown function UPF0118  36.26 
 
 		 455 aa  211  3e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.823858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0209  protein of unknown function UPF0118  33.06 
 
 		 399 aa  209  8e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15290  predicted permease  32.28 
 
 		 415 aa  195  1e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2165  hypothetical protein  36.27 
 
 		 414 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.128502  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0221  protein of unknown function UPF0118  33.23 
 
 		 364 aa  188  1e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795849 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2641  protein of unknown function UPF0118  32.89 
 
 		 408 aa  184  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.517547  normal  0.208528 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1841  permease  35.12 
 
 		 563 aa  182  1e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1139  hypothetical protein  31.21 
 
 		 526 aa  180  4e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3466  protein of unknown function UPF0118  32.84 
 
 		 448 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.254752 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  29.18 
 
 		 529 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1247  protein of unknown function UPF0118  27.79 
 
 		 388 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7547  protein of unknown function UPF0118  26.69 
 
 		 392 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43907  normal  0.494892 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1731  protein of unknown function UPF0118  26.98 
 
 		 373 aa  100  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8629  permease-like protein  25.76 
 
 		 423 aa  99  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3715  hypothetical protein  24.34 
 
 		 412 aa  99  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291378 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3538  hypothetical protein  23.46 
 
 		 406 aa  97.8  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.25155 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0503  protein of unknown function UPF0118  28.27 
 
 		 416 aa  97.4  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0195  protein of unknown function UPF0118  25.95 
 
 		 486 aa  95.5  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1793  hypothetical protein  26.35 
 
 		 387 aa  95.5  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.116515  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0456  protein of unknown function UPF0118  22.39 
 
 		 460 aa  94.4  3e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.204189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  28.07 
 
 		 354 aa  94  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4544  hypothetical protein  22.6 
 
 		 381 aa  92  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1694  permease-like protein  23.08 
 
 		 443 aa  90.5  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111642  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0558  hypothetical protein  26.65 
 
 		 362 aa  90.9  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0561744  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0518  protein of unknown function UPF0118  26.54 
 
 		 397 aa  90.1  6e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.318359  normal  0.0533128 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2329  protein of unknown function UPF0118  25.31 
 
 		 436 aa  89.4  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000385102 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3615  hypothetical protein  26.6 
 
 		 412 aa  87  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1354  hypothetical protein  25.91 
 
 		 375 aa  85.1  0.000000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000360215  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0279  hypothetical protein  28.85 
 
 		 423 aa  85.1  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0267805 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0322  hypothetical protein  29.24 
 
 		 487 aa  83.6  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.084246  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2868  protein of unknown function UPF0118  27.02 
 
 		 400 aa  83.2  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2927  permease  21.17 
 
 		 365 aa  83.2  0.000000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241708  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4850  hypothetical protein  25.76 
 
 		 394 aa  82.8  0.000000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1226  hypothetical protein  25.32 
 
 		 376 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1243  hypothetical protein  25.32 
 
 		 376 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.597847 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  23.4 
 
 		 361 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1029  hypothetical protein  22.17 
 
 		 361 aa  80.9  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.951774  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1010  hypothetical protein  22.17 
 
 		 361 aa  80.9  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.389096  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09400  predicted permease  24.67 
 
 		 357 aa  80.5  0.00000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.291782 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0728  protein of unknown function UPF0118  22.42 
 
 		 363 aa  80.9  0.00000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1252  hypothetical protein  25.47 
 
 		 376 aa  80.5  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3308  protein of unknown function UPF0118  25.06 
 
 		 452 aa  80.5  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783017  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  21.74 
 
 		 392 aa  80.5  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3286  protein of unknown function UPF0118  27.76 
 
 		 354 aa  79.7  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2554  hypothetical protein  27.4 
 
 		 356 aa  79.3  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07790  predicted permease  23.95 
 
 		 492 aa  78.6  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.132097 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  26.9 
 
 		 370 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2128  protein of unknown function UPF0118  29.78 
 
 		 444 aa  77.4  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.813628  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2284  protein of unknown function UPF0118  26.48 
 
 		 406 aa  77  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00112442  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  23.49 
 
 		 396 aa  76.6  0.0000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1964  hypothetical protein  24.81 
 
 		 378 aa  76.3  0.0000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1871  membrane protein YubA  21.57 
 
 		 373 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3393  protein of unknown function UPF0118  22.78 
 
 		 426 aa  76.3  0.0000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.334585  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0907  protein of unknown function UPF0118  28.3 
 
 		 423 aa  76.3  0.0000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00600861  normal  0.0221352 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3225  hypothetical protein  24.52 
 
 		 390 aa  75.5  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3083  hypothetical protein  21.83 
 
 		 373 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000376158  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3355  hypothetical protein  21.57 
 
 		 373 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2732  hypothetical protein  24.13 
 
 		 345 aa  75.1  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3997  hypothetical protein  25.07 
 
 		 413 aa  75.1  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00194517  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4330  protein of unknown function UPF0118  25.96 
 
 		 358 aa  74.3  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3031  protein of unknown function UPF0118  25.86 
 
 		 377 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2485  hypothetical protein  24.4 
 
 		 435 aa  73.6  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.957524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2596  hypothetical protein  26.17 
 
 		 371 aa  73.6  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2818  hypothetical protein  27.62 
 
 		 363 aa  73.6  0.000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1198  protein of unknown function UPF0118  26.71 
 
 		 390 aa  73.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2203  protein of unknown function UPF0118  26.96 
 
 		 397 aa  72.4  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0681126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0238  hypothetical protein  27.35 
 
 		 421 aa  72.8  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.817468 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3380  hypothetical protein  20.99 
 
 		 373 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  22.15 
 
 		 351 aa  71.6  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  24.52 
 
 		 373 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3380  hypothetical protein  20.7 
 
 		 376 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.300528  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  23.33 
 
 		 361 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3161  hypothetical protein  20.99 
 
 		 376 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000118258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  23.33 
 
 		 361 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3145  permease  20.99 
 
 		 376 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000188051  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0409  hypothetical protein  27.48 
 
 		 387 aa  71.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2556  protein of unknown function UPF0118  27.41 
 
 		 429 aa  71.6  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3410  hypothetical protein  20.99 
 
 		 376 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5305  hypothetical protein  27.97 
 
 		 464 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.111321  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1056  hypothetical protein  24.01 
 
 		 398 aa  72  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1509  hypothetical protein  25.7 
 
 		 365 aa  72  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2702  hypothetical protein  24.76 
 
 		 353 aa  71.6  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0593591 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2922  protein of unknown function UPF0118  22.22 
 
 		 357 aa  72  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.512956  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  23.33 
 
 		 361 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1423  hypothetical protein  30.16 
 
 		 368 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00001195  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3055  permease  20.99 
 
 		 376 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0055436  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  22.22 
 
 		 402 aa  71.2  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0457  hypothetical protein  26.72 
 
 		 383 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  22.22 
 
 		 402 aa  71.2  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  24.52 
 
 		 361 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3926  protein of unknown function UPF0118  24.84 
 
 		 340 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  24.52 
 
 		 361 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  24.52 
 
 		 361 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  21.62 
 
 		 343 aa  70.9  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1608  hypothetical protein  26.85 
 
 		 371 aa  70.9  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.55717  normal  0.0841628 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1881  hypothetical protein  26.13 
 
 		 435 aa  70.5  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  23.37 
 
 		 393 aa  70.9  0.00000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3381  membrane protein YubA  20.7 
 
 		 373 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00559166  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2759  protein of unknown function UPF0118  26.11 
 
 		 368 aa  70.5  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.163255  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>