More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1198 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1198  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 
390 aa  761    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2839  protein of unknown function UPF0118  72.8 
 
 
363 aa  524  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0111296  normal  0.2349 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3225  hypothetical protein  62.4 
 
 
390 aa  447  1.0000000000000001e-124  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0409  hypothetical protein  61.78 
 
 
387 aa  429  1e-119  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3442  protein of unknown function UPF0118  59.54 
 
 
397 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.804701 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2702  hypothetical protein  43.96 
 
 
353 aa  286  4e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0593591 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0558  hypothetical protein  40 
 
 
362 aa  265  8e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0561744  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2700  hypothetical protein  43.63 
 
 
373 aa  256  4e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.19448  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1509  hypothetical protein  43.33 
 
 
365 aa  254  2.0000000000000002e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0956  hypothetical protein  38.02 
 
 
367 aa  251  2e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0478197  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1849  hypothetical protein  42.03 
 
 
365 aa  244  1.9999999999999999e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.326919  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3833  protein of unknown function UPF0118  42.04 
 
 
364 aa  235  8e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3286  protein of unknown function UPF0118  41.97 
 
 
354 aa  229  6e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3031  protein of unknown function UPF0118  37.98 
 
 
377 aa  212  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3795  protein of unknown function UPF0118  35.1 
 
 
350 aa  209  5e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.625058 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3583  protein of unknown function UPF0118  34.84 
 
 
360 aa  183  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.274831  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2523  protein of unknown function UPF0118  34.84 
 
 
360 aa  183  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2732  hypothetical protein  36.1 
 
 
345 aa  181  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1877  protein of unknown function UPF0118  39.04 
 
 
355 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3687  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0823  hypothetical protein  37.19 
 
 
348 aa  163  5.0000000000000005e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27111  hypothetical protein  33.73 
 
 
356 aa  159  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2421  hypothetical protein  33.43 
 
 
361 aa  154  2e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.721488  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  30.57 
 
 
358 aa  142  8e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1341  hypothetical protein  31.83 
 
 
361 aa  139  7.999999999999999e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2101  hypothetical protein  30.79 
 
 
363 aa  130  5.0000000000000004e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1453  protein of unknown function UPF0118  31.32 
 
 
384 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2772  protein of unknown function UPF0118  29.5 
 
 
353 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  25.32 
 
 
343 aa  100  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  28.34 
 
 
363 aa  100  5e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1973  hypothetical protein  27.22 
 
 
369 aa  97.1  4e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0953876  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  26.97 
 
 
349 aa  96.7  6e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1352  protein of unknown function UPF0118  28.15 
 
 
438 aa  94.7  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  25.29 
 
 
351 aa  94  5e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  24.78 
 
 
354 aa  93.2  7e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  26.33 
 
 
341 aa  92.8  8e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  24.75 
 
 
351 aa  92  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02243  permease  27.84 
 
 
388 aa  91.7  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  25.87 
 
 
369 aa  90.9  3e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0632  hypothetical protein  27.24 
 
 
348 aa  89.4  9e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000226632  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  27.37 
 
 
345 aa  88.6  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  22.01 
 
 
355 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2201  hypothetical protein  27.57 
 
 
365 aa  87.8  3e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000750597  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0716  hypothetical protein  25.89 
 
 
366 aa  87.4  4e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.073836  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0707  permease, putative  24.73 
 
 
391 aa  87.4  4e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0522  hypothetical protein  25.6 
 
 
377 aa  87  5e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.176917  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  21.7 
 
 
355 aa  87  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  23.69 
 
 
361 aa  86.7  7e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  21.02 
 
 
355 aa  86.3  8e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  20.89 
 
 
355 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  20.89 
 
 
355 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  20.89 
 
 
355 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2774  hypothetical protein  24.68 
 
 
348 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  20.89 
 
 
355 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  20.89 
 
 
355 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  29.73 
 
 
371 aa  85.9  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0467  hypothetical protein  27.22 
 
 
339 aa  85.5  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000010449  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2171  hypothetical protein  26.56 
 
 
366 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.655201  normal  0.719413 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2481  hypothetical protein  25.99 
 
 
356 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.691389  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1056  hypothetical protein  25.96 
 
 
398 aa  84  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2087  hypothetical protein  24.24 
 
 
353 aa  84  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.257402  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1408  hypothetical protein  27.67 
 
 
372 aa  83.6  0.000000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.285024  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2536  hypothetical protein  27.54 
 
 
364 aa  84  0.000000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2818  hypothetical protein  26.92 
 
 
363 aa  83.6  0.000000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1003  permease  25.24 
 
 
350 aa  83.2  0.000000000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0492002  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1050  permease  29.95 
 
 
378 aa  83.2  0.000000000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000509244  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1793  hypothetical protein  27.18 
 
 
387 aa  83.2  0.000000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.116515  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3187  putative permease  27.56 
 
 
357 aa  82.4  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.295884  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  21.47 
 
 
392 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2006  hypothetical protein  24.55 
 
 
363 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000247505  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  22.34 
 
 
396 aa  82  0.00000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2382  membrane protein  27.19 
 
 
355 aa  81.6  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  26.45 
 
 
344 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002790  permease PerM  25.37 
 
 
357 aa  82  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  26.86 
 
 
379 aa  80.9  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2491  protein of unknown function UPF0118  24.58 
 
 
353 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0555  protein of unknown function UPF0118  30.48 
 
 
364 aa  80.9  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1423  hypothetical protein  24.93 
 
 
368 aa  80.9  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00001195  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0728  protein of unknown function UPF0118  25.8 
 
 
363 aa  80.5  0.00000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02140  putative permease  24.45 
 
 
357 aa  80.5  0.00000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0913386  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2437  protein of unknown function UPF0118  26.71 
 
 
386 aa  79.7  0.00000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000151216  normal  0.0209402 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  23.17 
 
 
361 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2688  permease PerM  23.51 
 
 
355 aa  79.3  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  22.87 
 
 
373 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2640  permease PerM  23.51 
 
 
355 aa  79.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.419277  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2861  permease PerM  23.51 
 
 
362 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4544  hypothetical protein  25.15 
 
 
381 aa  79.3  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2730  permease PerM  23.51 
 
 
362 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.659097  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1649  hypothetical protein  26.73 
 
 
360 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.673436  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1964  hypothetical protein  27.25 
 
 
378 aa  79.3  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2752  permease PerM  23.51 
 
 
362 aa  79.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  21.95 
 
 
393 aa  79  0.0000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  22.56 
 
 
361 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  22.56 
 
 
361 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  22.87 
 
 
361 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  22.87 
 
 
348 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0928  permease  22.5 
 
 
361 aa  78.2  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.335153 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2011  hypothetical protein  49.4 
 
 
99 aa  78.6  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2575  hypothetical protein  26.19 
 
 
415 aa  78.2  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41372  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  22.56 
 
 
361 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  22.56 
 
 
361 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>