More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0823 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0823  hypothetical protein  100 
 
 
348 aa  666    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2702  hypothetical protein  36.62 
 
 
353 aa  226  5.0000000000000005e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0593591 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0956  hypothetical protein  31.87 
 
 
367 aa  213  4.9999999999999996e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0478197  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3833  protein of unknown function UPF0118  41.25 
 
 
364 aa  210  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3225  hypothetical protein  33.72 
 
 
390 aa  207  3e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2700  hypothetical protein  34.66 
 
 
373 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.19448  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0409  hypothetical protein  34.95 
 
 
387 aa  196  5.000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2839  protein of unknown function UPF0118  36.39 
 
 
363 aa  195  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0111296  normal  0.2349 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1509  hypothetical protein  31.8 
 
 
365 aa  192  6e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0558  hypothetical protein  34.88 
 
 
362 aa  191  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0561744  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1198  protein of unknown function UPF0118  37.22 
 
 
390 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3442  protein of unknown function UPF0118  35.35 
 
 
397 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.804701 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3795  protein of unknown function UPF0118  30 
 
 
350 aa  179  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.625058 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1849  hypothetical protein  33.94 
 
 
365 aa  171  2e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.326919  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2523  protein of unknown function UPF0118  30.79 
 
 
360 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3583  protein of unknown function UPF0118  30.79 
 
 
360 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.274831  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3031  protein of unknown function UPF0118  31.83 
 
 
377 aa  155  7e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2421  hypothetical protein  32.36 
 
 
361 aa  139  7.999999999999999e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.721488  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27111  hypothetical protein  32.05 
 
 
356 aa  132  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3286  protein of unknown function UPF0118  30.58 
 
 
354 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1877  protein of unknown function UPF0118  35.89 
 
 
355 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3687  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2732  hypothetical protein  29.36 
 
 
345 aa  122  9e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1341  hypothetical protein  33.91 
 
 
361 aa  121  1.9999999999999998e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  24.05 
 
 
354 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  31.56 
 
 
358 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0742  protein of unknown function UPF0118  29.3 
 
 
361 aa  110  5e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2101  hypothetical protein  29.7 
 
 
363 aa  109  8.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1781  protein of unknown function UPF0118  29.35 
 
 
368 aa  108  9.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.836553  hitchhiker  0.00769603 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  25.43 
 
 
402 aa  105  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  25.43 
 
 
402 aa  105  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  24.53 
 
 
355 aa  103  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  24.84 
 
 
355 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  24.84 
 
 
355 aa  101  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  24.84 
 
 
355 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  24.84 
 
 
355 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  24.84 
 
 
355 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  24.26 
 
 
351 aa  101  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  24.21 
 
 
355 aa  99.8  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  24.2 
 
 
355 aa  99  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1242  protein of unknown function UPF0118  28.29 
 
 
374 aa  98.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  hitchhiker  0.00297495 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  30.32 
 
 
374 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  24.23 
 
 
405 aa  98.2  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1096  protein of unknown function UPF0118  28.25 
 
 
374 aa  97.4  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.771823  hitchhiker  0.00624948 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1964  hypothetical protein  26.8 
 
 
378 aa  97.4  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  24.51 
 
 
390 aa  97.4  3e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2339  protein of unknown function UPF0118  29.12 
 
 
370 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2065  hypothetical protein  29.12 
 
 
370 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.76219  normal  0.0900338 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002790  permease PerM  28.06 
 
 
357 aa  95.5  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0779  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  26.71 
 
 
375 aa  95.5  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.770407  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2435  hypothetical protein  26.71 
 
 
358 aa  95.9  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0853714  normal  0.0537169 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  27.53 
 
 
344 aa  95.5  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1742  putative permease PerM  29.08 
 
 
354 aa  95.9  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1973  hypothetical protein  28.27 
 
 
369 aa  94.4  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0953876  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2382  membrane protein  27.54 
 
 
355 aa  93.6  4e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0061  hypothetical protein  27.16 
 
 
383 aa  93.6  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5162  hypothetical protein  30.42 
 
 
382 aa  92  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235316  normal  0.0183443 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4523  hypothetical protein  24.52 
 
 
355 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0610501  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1315  protein of unknown function UPF0118  31.91 
 
 
369 aa  91.3  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.494628  normal  0.216518 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0728  protein of unknown function UPF0118  24.92 
 
 
363 aa  92  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2025  protein of unknown function UPF0118  29.47 
 
 
370 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.653838 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  22.15 
 
 
341 aa  90.1  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  26.4 
 
 
379 aa  90.5  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2491  protein of unknown function UPF0118  25.81 
 
 
353 aa  90.5  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0400  hypothetical protein  26.14 
 
 
357 aa  90.1  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2481  hypothetical protein  25.57 
 
 
356 aa  89.7  6e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.691389  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1297  hypothetical protein  27.88 
 
 
382 aa  89.7  6e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.675511  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0225  protein of unknown function UPF0118  25.77 
 
 
345 aa  89.7  6e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000651141  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1300  hypothetical protein  27.42 
 
 
434 aa  89.7  6e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.493989  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  24.05 
 
 
392 aa  89.7  7e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1056  hypothetical protein  24.76 
 
 
398 aa  89.4  9e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  24.53 
 
 
361 aa  89  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  21.31 
 
 
396 aa  89  1e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  22.11 
 
 
349 aa  88.2  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  23.63 
 
 
349 aa  88.2  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  20.13 
 
 
343 aa  88.6  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2772  protein of unknown function UPF0118  24.3 
 
 
353 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2575  hypothetical protein  27.42 
 
 
415 aa  87.4  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41372  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0191  PerM family permease  25.33 
 
 
327 aa  87  4e-16  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.739217  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0522  hypothetical protein  23.86 
 
 
377 aa  87.4  4e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.176917  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0793  hypothetical protein  27.8 
 
 
379 aa  87  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114477  normal  0.678459 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4473  hypothetical protein  24.84 
 
 
356 aa  86.3  8e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17401  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1843  hypothetical protein  27.67 
 
 
366 aa  85.9  9e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.633644  normal  0.110752 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  23.9 
 
 
361 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1003  permease  25.48 
 
 
350 aa  85.5  0.000000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0492002  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1453  protein of unknown function UPF0118  25.8 
 
 
384 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0961  protein of unknown function UPF0118  26.42 
 
 
382 aa  85.1  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685895 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2536  hypothetical protein  29.87 
 
 
364 aa  85.1  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0766  hypothetical protein  23.39 
 
 
404 aa  85.1  0.000000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.838264  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0823  protein of unknown function UPF0118  26.73 
 
 
358 aa  84.7  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74505  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2624  ABC transporter permease  28.3 
 
 
356 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.138735  normal  0.255995 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3493  protein of unknown function UPF0118  26.97 
 
 
348 aa  84.3  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1352  protein of unknown function UPF0118  30.34 
 
 
438 aa  84.3  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  23.27 
 
 
361 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2859  protein of unknown function UPF0118  29.39 
 
 
356 aa  83.6  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.262918  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  23.27 
 
 
361 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2453  protein of unknown function UPF0118  27.65 
 
 
356 aa  83.2  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.563612  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1556  hypothetical protein  28.68 
 
 
407 aa  83.2  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  23.27 
 
 
373 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2668  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  27.13 
 
 
665 aa  82.8  0.000000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  23.27 
 
 
361 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>