More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1341 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1341  hypothetical protein  100 
 
 		 361 aa  680    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3795  protein of unknown function UPF0118  31.98 
 
 		 350 aa  186  5e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.625058 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2523  protein of unknown function UPF0118  33.23 
 
 		 360 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3583  protein of unknown function UPF0118  33.23 
 
 		 360 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.274831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0409  hypothetical protein  31.71 
 
 		 387 aa  170  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0956  hypothetical protein  30.31 
 
 		 367 aa  169  8e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0478197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0558  hypothetical protein  32.76 
 
 		 362 aa  169  9e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0561744  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2839  protein of unknown function UPF0118  30.9 
 
 		 363 aa  166  5e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0111296  normal  0.2349 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1509  hypothetical protein  31.82 
 
 		 365 aa  164  3e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1198  protein of unknown function UPF0118  32.15 
 
 		 390 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2702  hypothetical protein  26.98 
 
 		 353 aa  161  1e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0593591 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2700  hypothetical protein  31.19 
 
 		 373 aa  160  4e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.19448  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3225  hypothetical protein  31.31 
 
 		 390 aa  159  5e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2421  hypothetical protein  33.89 
 
 		 361 aa  157  2e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.721488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3442  protein of unknown function UPF0118  31.09 
 
 		 397 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.804701 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2101  hypothetical protein  32.79 
 
 		 363 aa  150  3e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27111  hypothetical protein  32.28 
 
 		 356 aa  149  5e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3833  protein of unknown function UPF0118  30.99 
 
 		 364 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1877  protein of unknown function UPF0118  34.01 
 
 		 355 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3687  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1849  hypothetical protein  30.65 
 
 		 365 aa  138  2e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.326919  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3031  protein of unknown function UPF0118  30.87 
 
 		 377 aa  129  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0823  hypothetical protein  33.54 
 
 		 348 aa  122  8e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2732  hypothetical protein  28.83 
 
 		 345 aa  109  6e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  27.71 
 
 		 344 aa  106  7e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  28.01 
 
 		 358 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3286  protein of unknown function UPF0118  28.66 
 
 		 354 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1453  protein of unknown function UPF0118  30.34 
 
 		 384 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0707  permease, putative  24.92 
 
 		 391 aa  94.4  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0522  hypothetical protein  25.64 
 
 		 377 aa  93.6  5e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.176917  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0716  hypothetical protein  25 
 
 		 366 aa  92.4  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.073836  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0632  hypothetical protein  26.88 
 
 		 348 aa  91.7  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000226632  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1352  protein of unknown function UPF0118  32.43 
 
 		 438 aa  89  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  22.9 
 
 		 343 aa  87  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1050  permease  26.97 
 
 		 378 aa  83.6  0.000000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000509244  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2772  protein of unknown function UPF0118  28.61 
 
 		 353 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3424  hypothetical protein  26.23 
 
 		 403 aa  82  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000157289  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  28 
 
 		 363 aa  80.9  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  23.12 
 
 		 349 aa  80.9  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1098  protein of unknown function UPF0118  27.31 
 
 		 396 aa  80.5  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.370016  normal  0.531721 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  27.92 
 
 		 345 aa  80.1  0.00000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4544  hypothetical protein  24.84 
 
 		 381 aa  80.1  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2868  protein of unknown function UPF0118  27.39 
 
 		 400 aa  79.3  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  24.05 
 
 		 354 aa  78.2  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0061  hypothetical protein  25.32 
 
 		 383 aa  78.2  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1003  permease  28.92 
 
 		 350 aa  78.2  0.0000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0492002  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  22.92 
 
 		 351 aa  78.2  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1623  PerM family permease  25.32 
 
 		 367 aa  77.8  0.0000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.134997 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1773  hypothetical protein  25.47 
 
 		 357 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000027115  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  22.8 
 
 		 390 aa  77.4  0.0000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1781  protein of unknown function UPF0118  23.64 
 
 		 368 aa  77  0.0000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.836553  hitchhiker  0.00769603 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  21.89 
 
 		 341 aa  77  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0633  hypothetical protein  23.82 
 
 		 348 aa  77  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0451762  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0467  hypothetical protein  25.09 
 
 		 339 aa  76.6  0.0000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000010449  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1855  hypothetical protein  25.64 
 
 		 368 aa  76.3  0.0000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0735664  normal  0.142574 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2481  hypothetical protein  27.87 
 
 		 356 aa  75.5  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.691389  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  22.06 
 
 		 392 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1880  hypothetical protein  23.93 
 
 		 372 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0162246  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  24.33 
 
 		 529 aa  75.9  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3257  hypothetical protein  26.85 
 
 		 540 aa  74.3  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0749  protein of unknown function UPF0118  24.44 
 
 		 417 aa  73.9  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2774  hypothetical protein  22.04 
 
 		 348 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1556  hypothetical protein  24.55 
 
 		 407 aa  74.7  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2169  hypothetical protein  23.4 
 
 		 368 aa  74.3  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.215488  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2536  hypothetical protein  26.14 
 
 		 364 aa  73.9  0.000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  19.42 
 
 		 396 aa  73.6  0.000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1731  protein of unknown function UPF0118  24.23 
 
 		 373 aa  73.2  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3687  hypothetical protein  25.15 
 
 		 357 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000304887 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1762  hypothetical protein  25.24 
 
 		 329 aa  72.4  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  25.41 
 
 		 349 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3920  hypothetical protein  22.77 
 
 		 434 aa  72  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000253725  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3372  sporulation integral membrane protein YtvI  24.43 
 
 		 353 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3407  hypothetical protein  25.6 
 
 		 407 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1793  hypothetical protein  23.16 
 
 		 387 aa  72  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.116515  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7547  protein of unknown function UPF0118  26.33 
 
 		 392 aa  71.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43907  normal  0.494892 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4711  sporulation integral membrane protein YtvI  24.28 
 
 		 372 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000506038 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4727  hypothetical protein  24.28 
 
 		 365 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4722  sporulation integral membrane protein YtvI  23.73 
 
 		 372 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4325  permease  23.73 
 
 		 372 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4337  permease  23.73 
 
 		 372 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0400  hypothetical protein  26.4 
 
 		 357 aa  70.9  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0120  protein of unknown function UPF0118  22.25 
 
 		 436 aa  71.2  0.00000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  25.95 
 
 		 370 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26240  predicted permease  21.78 
 
 		 400 aa  70.1  0.00000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1702  permease, putative  24.62 
 
 		 357 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.303674  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3009  protein of unknown function UPF0118  25.25 
 
 		 382 aa  70.5  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  24.42 
 
 		 351 aa  70.1  0.00000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2385  protein of unknown function UPF0118  26.64 
 
 		 542 aa  70.5  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.322706 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0742  protein of unknown function UPF0118  25.65 
 
 		 361 aa  70.5  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3838  sporulation integral membrane protein YtvI  27.75 
 
 		 344 aa  70.1  0.00000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000542228  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  23.43 
 
 		 354 aa  69.7  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1477  protein of unknown function UPF0118  25.89 
 
 		 329 aa  69.3  0.00000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0279  hypothetical protein  23.97 
 
 		 423 aa  69.3  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0267805 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  23.15 
 
 		 355 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4490  hypothetical protein  22.71 
 
 		 372 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0811913  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4706  sporulation integral membrane protein YtvI  23.1 
 
 		 372 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  23.15 
 
 		 355 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  23.15 
 
 		 355 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  23.15 
 
 		 355 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3493  protein of unknown function UPF0118  25.85 
 
 		 348 aa  68.9  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  23.15 
 
 		 355 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>