More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0956 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0956  hypothetical protein  100 
 
 
367 aa  713    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0478197  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2700  hypothetical protein  42.74 
 
 
373 aa  295  9e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.19448  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2702  hypothetical protein  42.15 
 
 
353 aa  288  9e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0593591 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1509  hypothetical protein  39.5 
 
 
365 aa  285  5.999999999999999e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3442  protein of unknown function UPF0118  39.24 
 
 
397 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.804701 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3225  hypothetical protein  40 
 
 
390 aa  261  1e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3795  protein of unknown function UPF0118  37.91 
 
 
350 aa  253  3e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.625058 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2839  protein of unknown function UPF0118  38.87 
 
 
363 aa  253  5.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0111296  normal  0.2349 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3833  protein of unknown function UPF0118  40.68 
 
 
364 aa  250  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0409  hypothetical protein  39.6 
 
 
387 aa  246  3e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1877  protein of unknown function UPF0118  44.55 
 
 
355 aa  244  3e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3687  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1198  protein of unknown function UPF0118  38.02 
 
 
390 aa  239  5e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3583  protein of unknown function UPF0118  37.35 
 
 
360 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.274831  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2523  protein of unknown function UPF0118  37.35 
 
 
360 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1849  hypothetical protein  36.72 
 
 
365 aa  209  6e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.326919  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0558  hypothetical protein  34.29 
 
 
362 aa  207  3e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0561744  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3031  protein of unknown function UPF0118  32.35 
 
 
377 aa  187  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3286  protein of unknown function UPF0118  35.63 
 
 
354 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0823  hypothetical protein  31.87 
 
 
348 aa  173  3.9999999999999995e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27111  hypothetical protein  33.24 
 
 
356 aa  168  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2421  hypothetical protein  30.32 
 
 
361 aa  148  1.0000000000000001e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.721488  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2732  hypothetical protein  29.34 
 
 
345 aa  139  7e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  31.18 
 
 
358 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2101  hypothetical protein  27.83 
 
 
363 aa  133  5e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1341  hypothetical protein  29.97 
 
 
361 aa  130  3e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  25.24 
 
 
343 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2772  protein of unknown function UPF0118  31.27 
 
 
353 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1453  protein of unknown function UPF0118  28.32 
 
 
384 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  27.15 
 
 
351 aa  101  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  24.18 
 
 
354 aa  99.8  7e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  27.3 
 
 
379 aa  99  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  26.6 
 
 
344 aa  99  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1242  protein of unknown function UPF0118  27.98 
 
 
374 aa  98.6  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  hitchhiker  0.00297495 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  25.4 
 
 
355 aa  97.1  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  25.4 
 
 
355 aa  95.9  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  25.4 
 
 
355 aa  95.9  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  25.4 
 
 
355 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  25.4 
 
 
355 aa  95.9  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  25.4 
 
 
355 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  24.76 
 
 
355 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  24.76 
 
 
355 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  23.84 
 
 
396 aa  92.8  9e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1964  hypothetical protein  26.69 
 
 
378 aa  92.8  9e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1096  protein of unknown function UPF0118  26.51 
 
 
374 aa  92.8  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.771823  hitchhiker  0.00624948 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1297  hypothetical protein  27.24 
 
 
382 aa  90.9  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.675511  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0793  hypothetical protein  26.88 
 
 
379 aa  90.5  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114477  normal  0.678459 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0742  protein of unknown function UPF0118  26.89 
 
 
361 aa  88.2  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0766  hypothetical protein  26.23 
 
 
404 aa  87.4  3e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.838264  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  26.62 
 
 
370 aa  87  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  25.39 
 
 
341 aa  85.9  9e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4523  hypothetical protein  25.08 
 
 
355 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0610501  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  24.35 
 
 
349 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1056  hypothetical protein  23.86 
 
 
398 aa  84  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  26.86 
 
 
374 aa  84  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02385  predicted inner membrane protein  25.23 
 
 
353 aa  83.6  0.000000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0762767  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1176  protein of unknown function UPF0118  25.23 
 
 
353 aa  83.6  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.412561  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2775  PerM family permease  25.23 
 
 
353 aa  83.6  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0215248  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2640  PerM family permease  25.23 
 
 
353 aa  83.6  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4473  hypothetical protein  25.4 
 
 
356 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17401  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3715  putative permease, PerM family  25.23 
 
 
353 aa  83.6  0.000000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02347  hypothetical protein  25.23 
 
 
353 aa  83.6  0.000000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.106827  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2867  putative permease, PerM family  25.23 
 
 
353 aa  83.6  0.000000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.697689  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1183  hypothetical protein  25.23 
 
 
353 aa  83.6  0.000000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0538168 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1003  permease  27.03 
 
 
350 aa  83.6  0.000000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0492002  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2627  PerM family permease  25.23 
 
 
353 aa  83.6  0.000000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02140  putative permease  25.65 
 
 
357 aa  83.2  0.000000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0913386  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2435  hypothetical protein  25.82 
 
 
358 aa  83.2  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0853714  normal  0.0537169 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0779  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  25.82 
 
 
375 aa  82.8  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.770407  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  25.32 
 
 
351 aa  82.8  0.000000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0728  protein of unknown function UPF0118  24.92 
 
 
363 aa  81.6  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0632  hypothetical protein  21.22 
 
 
348 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000226632  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3329  hypothetical protein  25.98 
 
 
365 aa  81.6  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63767  normal  0.12265 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02243  permease  25.79 
 
 
388 aa  80.9  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0716  hypothetical protein  22.45 
 
 
366 aa  80.9  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.073836  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2640  permease PerM  24.23 
 
 
355 aa  81.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.419277  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2688  permease PerM  24.23 
 
 
355 aa  80.9  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2575  hypothetical protein  25.25 
 
 
415 aa  80.9  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41372  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2752  permease PerM  24.23 
 
 
362 aa  80.9  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2861  permease PerM  24.23 
 
 
362 aa  80.9  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  25.72 
 
 
345 aa  80.5  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2730  permease PerM  24.23 
 
 
362 aa  80.9  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.659097  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1352  protein of unknown function UPF0118  24.4 
 
 
438 aa  80.1  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3129  hypothetical protein  24.64 
 
 
418 aa  80.1  0.00000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  26.58 
 
 
363 aa  80.1  0.00000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  25.62 
 
 
392 aa  79.7  0.00000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1423  hypothetical protein  23.55 
 
 
368 aa  79.7  0.00000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00001195  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0713  permease, putative  25.9 
 
 
382 aa  79.7  0.00000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.658083  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0703  putative permease  25.33 
 
 
382 aa  79.3  0.00000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0707  permease, putative  23.01 
 
 
391 aa  79  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  23.66 
 
 
369 aa  79  0.0000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3102  hypothetical protein  27.01 
 
 
352 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0196  hypothetical protein  25.15 
 
 
373 aa  77  0.0000000000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5162  hypothetical protein  27.3 
 
 
382 aa  76.6  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235316  normal  0.0183443 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1050  permease  22.34 
 
 
378 aa  76.3  0.0000000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000509244  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0400  hypothetical protein  26.06 
 
 
357 aa  74.7  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0467  hypothetical protein  23.47 
 
 
339 aa  75.1  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000010449  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2481  hypothetical protein  22.51 
 
 
356 aa  74.3  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.691389  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  23.57 
 
 
373 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  23.2 
 
 
529 aa  73.6  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3128  putative permease PerM  23.64 
 
 
354 aa  73.2  0.000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00611871  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>