More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_27111 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_27111  hypothetical protein  100 
 
 
356 aa  660    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2421  hypothetical protein  69.89 
 
 
361 aa  391  1e-107  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.721488  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2101  hypothetical protein  70.38 
 
 
363 aa  378  1e-103  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3795  protein of unknown function UPF0118  43.79 
 
 
350 aa  248  9e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.625058 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3583  protein of unknown function UPF0118  43.44 
 
 
360 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.274831  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2523  protein of unknown function UPF0118  43.44 
 
 
360 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0956  hypothetical protein  33.24 
 
 
367 aa  187  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0478197  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2700  hypothetical protein  36.07 
 
 
373 aa  186  5e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.19448  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1509  hypothetical protein  34.6 
 
 
365 aa  181  1e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0558  hypothetical protein  34.34 
 
 
362 aa  171  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0561744  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2839  protein of unknown function UPF0118  33.62 
 
 
363 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0111296  normal  0.2349 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3225  hypothetical protein  33.33 
 
 
390 aa  169  5e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1198  protein of unknown function UPF0118  33.33 
 
 
390 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3442  protein of unknown function UPF0118  34.87 
 
 
397 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.804701 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2702  hypothetical protein  30.3 
 
 
353 aa  166  6.9999999999999995e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0593591 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0409  hypothetical protein  32.24 
 
 
387 aa  157  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3833  protein of unknown function UPF0118  35.06 
 
 
364 aa  153  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1849  hypothetical protein  31.49 
 
 
365 aa  149  9e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.326919  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3286  protein of unknown function UPF0118  35.55 
 
 
354 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1877  protein of unknown function UPF0118  34.51 
 
 
355 aa  132  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3687  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1341  hypothetical protein  32.33 
 
 
361 aa  129  6e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3031  protein of unknown function UPF0118  29.22 
 
 
377 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2732  hypothetical protein  29.23 
 
 
345 aa  122  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0823  hypothetical protein  32.05 
 
 
348 aa  121  1.9999999999999998e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  34.41 
 
 
374 aa  102  7e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  25.61 
 
 
358 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  24.69 
 
 
354 aa  92.8  7e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  25.42 
 
 
343 aa  91.3  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1096  protein of unknown function UPF0118  30.03 
 
 
374 aa  89.4  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.771823  hitchhiker  0.00624948 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  31.25 
 
 
379 aa  89  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2481  hypothetical protein  30.06 
 
 
356 aa  88.6  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.691389  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1964  hypothetical protein  30.35 
 
 
378 aa  89  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02140  putative permease  29.72 
 
 
357 aa  88.2  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0913386  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1973  hypothetical protein  27.9 
 
 
369 aa  87.4  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0953876  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1242  protein of unknown function UPF0118  29.5 
 
 
374 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  hitchhiker  0.00297495 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  29.02 
 
 
344 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0779  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  30.06 
 
 
375 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.770407  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2435  hypothetical protein  30.06 
 
 
358 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0853714  normal  0.0537169 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1352  protein of unknown function UPF0118  26.25 
 
 
438 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2201  hypothetical protein  28.48 
 
 
365 aa  84.7  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000750597  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1297  hypothetical protein  30.27 
 
 
382 aa  83.2  0.000000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.675511  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1843  hypothetical protein  27.85 
 
 
366 aa  82.8  0.000000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.633644  normal  0.110752 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2382  membrane protein  28.34 
 
 
355 aa  82  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0793  hypothetical protein  28.88 
 
 
379 aa  82  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114477  normal  0.678459 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0522  hypothetical protein  26.11 
 
 
377 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.176917  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2171  hypothetical protein  27.76 
 
 
366 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.655201  normal  0.719413 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  22.3 
 
 
348 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2536  hypothetical protein  29.38 
 
 
364 aa  81.3  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2001  permease  24.22 
 
 
371 aa  81.6  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  22.3 
 
 
361 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  22.3 
 
 
361 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  22.3 
 
 
361 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  21.67 
 
 
361 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  21.67 
 
 
361 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  21.67 
 
 
373 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1003  permease  25.46 
 
 
350 aa  80.5  0.00000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0492002  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  28.62 
 
 
529 aa  80.1  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  21.96 
 
 
361 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1408  hypothetical protein  28.62 
 
 
372 aa  80.1  0.00000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.285024  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  21.96 
 
 
348 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  23.82 
 
 
355 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  23.82 
 
 
355 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  23.82 
 
 
355 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  23.82 
 
 
355 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  23.82 
 
 
355 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1742  putative permease PerM  28.79 
 
 
354 aa  77.8  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0742  protein of unknown function UPF0118  28.84 
 
 
361 aa  78.6  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  28.31 
 
 
363 aa  77.8  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2818  hypothetical protein  28.13 
 
 
363 aa  78.6  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3129  hypothetical protein  29.41 
 
 
418 aa  78.2  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2065  hypothetical protein  30.63 
 
 
370 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.76219  normal  0.0900338 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2339  protein of unknown function UPF0118  30.63 
 
 
370 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3329  hypothetical protein  27.83 
 
 
365 aa  77.4  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63767  normal  0.12265 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0823  protein of unknown function UPF0118  27.41 
 
 
358 aa  77.4  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74505  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2435  hypothetical protein  27.18 
 
 
361 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0011748 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03191  hypothetical protein  26.63 
 
 
356 aa  77  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0190  hypothetical protein  27.25 
 
 
356 aa  77.4  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  21.5 
 
 
351 aa  77.4  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0713  permease, putative  29.21 
 
 
382 aa  76.6  0.0000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.658083  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  23.34 
 
 
349 aa  76.6  0.0000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002790  permease PerM  28.62 
 
 
357 aa  76.6  0.0000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1156  permease  25.38 
 
 
382 aa  76.6  0.0000000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0866214  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0400  hypothetical protein  30.19 
 
 
357 aa  76.3  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  22.97 
 
 
355 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2575  hypothetical protein  29.06 
 
 
415 aa  75.5  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41372  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  23.51 
 
 
355 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3512  hypothetical protein  25.83 
 
 
356 aa  75.5  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.293962  normal  0.922433 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  22.51 
 
 
361 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5162  hypothetical protein  31.86 
 
 
382 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235316  normal  0.0183443 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3424  hypothetical protein  24.15 
 
 
403 aa  75.1  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000157289  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0703  putative permease  29.21 
 
 
382 aa  75.5  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0259  protein of unknown function UPF0118  25.56 
 
 
356 aa  74.7  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1855  hypothetical protein  31.71 
 
 
380 aa  75.1  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.631285 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2169  hypothetical protein  20.56 
 
 
368 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.215488  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  23.32 
 
 
355 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  21.78 
 
 
361 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1300  hypothetical protein  29.33 
 
 
434 aa  74.3  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.493989  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3538  hypothetical protein  28.8 
 
 
406 aa  73.9  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.25155 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0061  hypothetical protein  24.76 
 
 
383 aa  73.6  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0707  permease, putative  25.16 
 
 
391 aa  73.6  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>