More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3833 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3833  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 
364 aa  705    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0956  hypothetical protein  40.68 
 
 
367 aa  281  1e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0478197  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2702  hypothetical protein  40.29 
 
 
353 aa  270  2.9999999999999997e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0593591 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1509  hypothetical protein  40.39 
 
 
365 aa  260  3e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2700  hypothetical protein  39.78 
 
 
373 aa  259  4e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.19448  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0409  hypothetical protein  42.9 
 
 
387 aa  258  1e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3442  protein of unknown function UPF0118  43.02 
 
 
397 aa  256  5e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.804701 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3225  hypothetical protein  43.21 
 
 
390 aa  251  1e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2839  protein of unknown function UPF0118  40.61 
 
 
363 aa  236  4e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0111296  normal  0.2349 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1198  protein of unknown function UPF0118  40.72 
 
 
390 aa  235  9e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3795  protein of unknown function UPF0118  37.06 
 
 
350 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.625058 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2523  protein of unknown function UPF0118  37.18 
 
 
360 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3583  protein of unknown function UPF0118  37.18 
 
 
360 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.274831  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0558  hypothetical protein  32.13 
 
 
362 aa  193  3e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0561744  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0823  hypothetical protein  41.44 
 
 
348 aa  190  4e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1849  hypothetical protein  34.05 
 
 
365 aa  189  9e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.326919  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3031  protein of unknown function UPF0118  34.29 
 
 
377 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1877  protein of unknown function UPF0118  38.3 
 
 
355 aa  169  9e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3687  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2421  hypothetical protein  36.01 
 
 
361 aa  164  3e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.721488  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3286  protein of unknown function UPF0118  36.34 
 
 
354 aa  162  7e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27111  hypothetical protein  34.91 
 
 
356 aa  154  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2732  hypothetical protein  30.3 
 
 
345 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2101  hypothetical protein  32.09 
 
 
363 aa  126  6e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  29.75 
 
 
358 aa  126  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1341  hypothetical protein  31.08 
 
 
361 aa  115  7.999999999999999e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2772  protein of unknown function UPF0118  27.53 
 
 
353 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  28.66 
 
 
344 aa  93.6  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1964  hypothetical protein  26.75 
 
 
378 aa  93.6  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1453  protein of unknown function UPF0118  27.63 
 
 
384 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2481  hypothetical protein  28.34 
 
 
356 aa  90.5  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.691389  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1973  hypothetical protein  27.99 
 
 
369 aa  88.6  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0953876  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  24.42 
 
 
396 aa  88.6  2e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0632  hypothetical protein  26.28 
 
 
348 aa  87.4  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000226632  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  24.76 
 
 
354 aa  85.5  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  25.39 
 
 
373 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0225  protein of unknown function UPF0118  26.14 
 
 
345 aa  84.7  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000651141  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2575  hypothetical protein  29.26 
 
 
415 aa  85.1  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41372  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1003  permease  28.4 
 
 
350 aa  84.3  0.000000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0492002  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  26.01 
 
 
361 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  26.01 
 
 
361 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2752  permease PerM  25.96 
 
 
362 aa  83.6  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  25.39 
 
 
348 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  25.39 
 
 
361 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  23.93 
 
 
369 aa  83.2  0.000000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2688  permease PerM  26.05 
 
 
355 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  25.56 
 
 
379 aa  82.8  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0703  putative permease  28.93 
 
 
382 aa  82.4  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  23.82 
 
 
343 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2201  hypothetical protein  25.95 
 
 
365 aa  81.6  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000750597  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  24.77 
 
 
361 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  24.77 
 
 
361 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2730  permease PerM  25.77 
 
 
362 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.659097  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2861  permease PerM  25.77 
 
 
362 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  24.77 
 
 
348 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  24.77 
 
 
361 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2640  permease PerM  25.77 
 
 
355 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.419277  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  28.44 
 
 
374 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0713  permease, putative  29.56 
 
 
382 aa  80.9  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.658083  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  24.93 
 
 
361 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  24.1 
 
 
355 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  24.31 
 
 
361 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  23.8 
 
 
355 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1102  hypothetical protein  30.37 
 
 
377 aa  78.6  0.0000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0908719  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0191  PerM family permease  25.15 
 
 
327 aa  78.2  0.0000000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.739217  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1056  hypothetical protein  25.79 
 
 
398 aa  78.2  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02140  putative permease  25.77 
 
 
357 aa  77.8  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0913386  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02385  predicted inner membrane protein  25.2 
 
 
353 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0762767  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1176  protein of unknown function UPF0118  25.2 
 
 
353 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.412561  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3715  putative permease, PerM family  25.2 
 
 
353 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2640  PerM family permease  25.2 
 
 
353 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02347  hypothetical protein  25.2 
 
 
353 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.106827  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2775  PerM family permease  25.2 
 
 
353 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0215248  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2627  PerM family permease  25.2 
 
 
353 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1183  hypothetical protein  25.2 
 
 
353 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0538168 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2867  putative permease, PerM family  25.2 
 
 
353 aa  77.8  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.697689  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  23.49 
 
 
355 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1050  permease  26.33 
 
 
378 aa  77  0.0000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000509244  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1731  protein of unknown function UPF0118  27.01 
 
 
373 aa  76.3  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2818  hypothetical protein  28.4 
 
 
363 aa  76.3  0.0000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1651  hypothetical protein  26.69 
 
 
366 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  23.2 
 
 
355 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  23.2 
 
 
355 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  23.2 
 
 
355 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  23.2 
 
 
355 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0793  hypothetical protein  26.67 
 
 
379 aa  75.5  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114477  normal  0.678459 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  23.2 
 
 
355 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0928  permease  25.97 
 
 
361 aa  75.1  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.335153 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1242  protein of unknown function UPF0118  25 
 
 
374 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  hitchhiker  0.00297495 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2417  hypothetical protein  26.69 
 
 
366 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.798484  hitchhiker  0.00111788 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  22.95 
 
 
341 aa  74.3  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  27.68 
 
 
363 aa  74.7  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0657  permease  27.97 
 
 
384 aa  74.3  0.000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.036358  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2171  hypothetical protein  25.66 
 
 
366 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.655201  normal  0.719413 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0120  protein of unknown function UPF0118  23.58 
 
 
436 aa  73.9  0.000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3187  putative permease  27.3 
 
 
357 aa  73.6  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.295884  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3083  hypothetical protein  25.08 
 
 
373 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000376158  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2345  hypothetical protein  26.73 
 
 
366 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000997744 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08190  predicted permease  28.42 
 
 
455 aa  73.2  0.000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0210651 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0742  protein of unknown function UPF0118  25.32 
 
 
361 aa  73.2  0.000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1096  protein of unknown function UPF0118  25.56 
 
 
374 aa  72.4  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.771823  hitchhiker  0.00624948 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>