More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0409 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0409  hypothetical protein  100 
 
 
387 aa  756    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3225  hypothetical protein  83.2 
 
 
390 aa  617  1e-175  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1198  protein of unknown function UPF0118  61.78 
 
 
390 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3442  protein of unknown function UPF0118  57.18 
 
 
397 aa  412  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.804701 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2839  protein of unknown function UPF0118  53.91 
 
 
363 aa  385  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0111296  normal  0.2349 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2702  hypothetical protein  41.27 
 
 
353 aa  283  4.0000000000000003e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0593591 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0558  hypothetical protein  41.01 
 
 
362 aa  259  8e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0561744  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0956  hypothetical protein  39.6 
 
 
367 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0478197  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2700  hypothetical protein  43.02 
 
 
373 aa  250  3e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.19448  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1509  hypothetical protein  40.28 
 
 
365 aa  250  3e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3833  protein of unknown function UPF0118  42.39 
 
 
364 aa  246  4e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1849  hypothetical protein  39.72 
 
 
365 aa  238  1e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.326919  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3795  protein of unknown function UPF0118  35.91 
 
 
350 aa  219  5e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.625058 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3286  protein of unknown function UPF0118  41.74 
 
 
354 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3031  protein of unknown function UPF0118  38.49 
 
 
377 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3583  protein of unknown function UPF0118  35.2 
 
 
360 aa  195  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.274831  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2523  protein of unknown function UPF0118  35.2 
 
 
360 aa  195  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2732  hypothetical protein  35.26 
 
 
345 aa  176  7e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1877  protein of unknown function UPF0118  37.5 
 
 
355 aa  170  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3687  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0823  hypothetical protein  34.95 
 
 
348 aa  164  2.0000000000000002e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27111  hypothetical protein  32.24 
 
 
356 aa  142  7e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2421  hypothetical protein  32.45 
 
 
361 aa  137  4e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.721488  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1341  hypothetical protein  31.92 
 
 
361 aa  131  2.0000000000000002e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  29.64 
 
 
358 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1453  protein of unknown function UPF0118  31.91 
 
 
384 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2101  hypothetical protein  26.94 
 
 
363 aa  110  6e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  23.84 
 
 
355 aa  102  9e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  23.51 
 
 
355 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  23.51 
 
 
355 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  23.51 
 
 
355 aa  102  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  23.51 
 
 
355 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  23.51 
 
 
355 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  29.21 
 
 
343 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  23.51 
 
 
355 aa  100  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  23.18 
 
 
355 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2772  protein of unknown function UPF0118  26.93 
 
 
353 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1973  hypothetical protein  25.86 
 
 
369 aa  93.2  8e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0953876  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1352  protein of unknown function UPF0118  25.84 
 
 
438 aa  92  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4523  hypothetical protein  23.84 
 
 
355 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0610501  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4473  hypothetical protein  24.5 
 
 
356 aa  89  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17401  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  25.54 
 
 
349 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  24.05 
 
 
351 aa  85.5  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3187  putative permease  27.8 
 
 
357 aa  84.7  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.295884  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  23.57 
 
 
351 aa  84  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2818  hypothetical protein  29.32 
 
 
363 aa  83.6  0.000000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3102  hypothetical protein  23.61 
 
 
352 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0728  protein of unknown function UPF0118  27.3 
 
 
363 aa  83.2  0.000000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1003  permease  26.25 
 
 
350 aa  83.2  0.000000000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0492002  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  22.29 
 
 
354 aa  82.8  0.000000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3786  protein of unknown function UPF0118  24.28 
 
 
386 aa  81.6  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.262236  normal  0.0203414 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  24.16 
 
 
341 aa  81.6  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3407  hypothetical protein  25.48 
 
 
407 aa  80.5  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  28.12 
 
 
363 aa  80.5  0.00000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2481  hypothetical protein  22.22 
 
 
356 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.691389  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2171  hypothetical protein  24.17 
 
 
366 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.655201  normal  0.719413 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  26.32 
 
 
344 aa  79.7  0.00000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2491  protein of unknown function UPF0118  26.45 
 
 
353 aa  79.7  0.00000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1423  hypothetical protein  24.63 
 
 
368 aa  79  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00001195  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2536  hypothetical protein  27.57 
 
 
364 aa  78.2  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0522  hypothetical protein  23.28 
 
 
377 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.176917  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2382  membrane protein  25.4 
 
 
355 aa  77.8  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0716  hypothetical protein  23.18 
 
 
366 aa  77.8  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.073836  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  24.11 
 
 
345 aa  77  0.0000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002790  permease PerM  24.92 
 
 
357 aa  75.5  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  24.65 
 
 
379 aa  75.9  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0191  PerM family permease  25.46 
 
 
327 aa  75.5  0.000000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.739217  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0910  hypothetical protein  25.84 
 
 
379 aa  75.1  0.000000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  22.36 
 
 
396 aa  73.9  0.000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1050  permease  26.55 
 
 
378 aa  73.6  0.000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000509244  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2437  protein of unknown function UPF0118  26.2 
 
 
386 aa  73.6  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000151216  normal  0.0209402 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0707  permease, putative  21.57 
 
 
391 aa  73.6  0.000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3512  hypothetical protein  22.42 
 
 
356 aa  73.6  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.293962  normal  0.922433 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2752  permease PerM  23.24 
 
 
362 aa  73.2  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1463  protein of unknown function UPF0118  21.55 
 
 
407 aa  73.2  0.000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3470  hypothetical protein  25.53 
 
 
362 aa  73.2  0.000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2730  permease PerM  22.75 
 
 
362 aa  71.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.659097  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2640  permease PerM  22.75 
 
 
355 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.419277  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2688  permease PerM  22.75 
 
 
355 aa  71.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2861  permease PerM  22.75 
 
 
362 aa  71.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2201  hypothetical protein  24.92 
 
 
365 aa  72  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000750597  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0467  hypothetical protein  24.23 
 
 
339 aa  71.6  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000010449  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2435  hypothetical protein  24.03 
 
 
361 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0011748 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1357  hypothetical protein  23.26 
 
 
354 aa  70.1  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3128  putative permease PerM  23.26 
 
 
354 aa  70.1  0.00000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00611871  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1240  putative permease PerM  23.26 
 
 
354 aa  70.1  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00935863  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0190  hypothetical protein  25 
 
 
356 aa  69.7  0.00000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2575  hypothetical protein  25.65 
 
 
415 aa  69.7  0.00000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41372  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02385  predicted inner membrane protein  22.89 
 
 
353 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0762767  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1176  protein of unknown function UPF0118  22.89 
 
 
353 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.412561  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1556  hypothetical protein  24.22 
 
 
407 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1183  hypothetical protein  22.89 
 
 
353 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0538168 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0960  protein of unknown function UPF0118  23.1 
 
 
353 aa  69.3  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02347  hypothetical protein  22.89 
 
 
353 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.106827  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2775  PerM family permease  22.89 
 
 
353 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0215248  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0793  hypothetical protein  26.71 
 
 
379 aa  69.3  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114477  normal  0.678459 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2627  PerM family permease  22.89 
 
 
353 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2867  putative permease, PerM family  22.89 
 
 
353 aa  68.9  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.697689  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2640  PerM family permease  22.89 
 
 
353 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3715  putative permease, PerM family  22.89 
 
 
353 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0259  protein of unknown function UPF0118  25.24 
 
 
356 aa  68.2  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>