More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_2101 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_2101  hypothetical protein  100 
 
 
363 aa  689    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2421  hypothetical protein  78.61 
 
 
361 aa  473  1e-132  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.721488  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27111  hypothetical protein  70.38 
 
 
356 aa  399  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3795  protein of unknown function UPF0118  42.42 
 
 
350 aa  263  3e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.625058 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2523  protein of unknown function UPF0118  42.2 
 
 
360 aa  227  3e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3583  protein of unknown function UPF0118  42.2 
 
 
360 aa  227  3e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.274831  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1509  hypothetical protein  33.14 
 
 
365 aa  182  9.000000000000001e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2700  hypothetical protein  34.01 
 
 
373 aa  181  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.19448  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0956  hypothetical protein  29.71 
 
 
367 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0478197  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2839  protein of unknown function UPF0118  31.23 
 
 
363 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0111296  normal  0.2349 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0558  hypothetical protein  34.03 
 
 
362 aa  171  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0561744  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2702  hypothetical protein  29.45 
 
 
353 aa  162  1e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0593591 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1198  protein of unknown function UPF0118  29.13 
 
 
390 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3225  hypothetical protein  30 
 
 
390 aa  158  2e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3833  protein of unknown function UPF0118  33.54 
 
 
364 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3442  protein of unknown function UPF0118  32.41 
 
 
397 aa  153  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.804701 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1877  protein of unknown function UPF0118  34.63 
 
 
355 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3687  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1849  hypothetical protein  30.72 
 
 
365 aa  147  3e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.326919  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0409  hypothetical protein  27.95 
 
 
387 aa  145  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1341  hypothetical protein  32.84 
 
 
361 aa  144  3e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3031  protein of unknown function UPF0118  31.55 
 
 
377 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0823  hypothetical protein  30.42 
 
 
348 aa  129  7.000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3286  protein of unknown function UPF0118  31.1 
 
 
354 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2732  hypothetical protein  27.78 
 
 
345 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  27.3 
 
 
358 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1352  protein of unknown function UPF0118  29.13 
 
 
438 aa  99  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  28.57 
 
 
344 aa  97.8  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2818  hypothetical protein  30.03 
 
 
363 aa  89  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0522  hypothetical protein  25.29 
 
 
377 aa  86.7  6e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.176917  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  24.92 
 
 
354 aa  86.3  7e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1453  protein of unknown function UPF0118  31.2 
 
 
384 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0779  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  26.76 
 
 
375 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.770407  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  27.27 
 
 
363 aa  81.3  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2435  hypothetical protein  26.76 
 
 
358 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0853714  normal  0.0537169 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  28.65 
 
 
374 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2481  hypothetical protein  27.16 
 
 
356 aa  79  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.691389  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10207  transmembrane protein  28.04 
 
 
367 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1297  hypothetical protein  27.41 
 
 
382 aa  78.2  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.675511  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1990  protein of unknown function UPF0118  27.78 
 
 
372 aa  77.8  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0716  hypothetical protein  24.64 
 
 
366 aa  77  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.073836  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5162  hypothetical protein  29.52 
 
 
382 aa  76.6  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235316  normal  0.0183443 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2001  permease  23.82 
 
 
371 aa  76.3  0.0000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0662  permease, putative  31.49 
 
 
362 aa  75.9  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.531977  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  23.73 
 
 
349 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0400  hypothetical protein  28.01 
 
 
357 aa  75.5  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  23.05 
 
 
343 aa  74.7  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2575  hypothetical protein  25.85 
 
 
415 aa  74.7  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41372  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2201  hypothetical protein  26.4 
 
 
365 aa  75.1  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000750597  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02140  putative permease  27.08 
 
 
357 aa  75.5  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0913386  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1029  hypothetical protein  23.26 
 
 
361 aa  74.7  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.951774  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1010  hypothetical protein  23.26 
 
 
361 aa  74.7  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.389096  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  21.7 
 
 
355 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  21.7 
 
 
355 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  21.7 
 
 
355 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  21.7 
 
 
355 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  21.7 
 
 
355 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0707  permease, putative  24.35 
 
 
391 aa  74.3  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0823  protein of unknown function UPF0118  27.22 
 
 
358 aa  74.3  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74505  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  22.26 
 
 
349 aa  74.3  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  27.3 
 
 
379 aa  74.3  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2491  protein of unknown function UPF0118  21.72 
 
 
353 aa  73.9  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03191  hypothetical protein  26.57 
 
 
356 aa  73.6  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1056  hypothetical protein  28.08 
 
 
398 aa  73.6  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4060  hypothetical protein  27.04 
 
 
404 aa  73.6  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000137982  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  20.62 
 
 
355 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2772  protein of unknown function UPF0118  27.59 
 
 
353 aa  73.2  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  20.94 
 
 
351 aa  72.8  0.000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2774  hypothetical protein  24.6 
 
 
348 aa  72.8  0.000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0961  protein of unknown function UPF0118  26.74 
 
 
382 aa  72.8  0.000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685895 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002790  permease PerM  25.83 
 
 
357 aa  72.8  0.000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  20.31 
 
 
355 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1300  hypothetical protein  28.19 
 
 
434 aa  72.4  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.493989  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1102  hypothetical protein  27.64 
 
 
377 aa  72  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0908719  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2171  hypothetical protein  26.41 
 
 
366 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.655201  normal  0.719413 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2382  membrane protein  27.33 
 
 
355 aa  71.6  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3424  hypothetical protein  23.57 
 
 
403 aa  71.6  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000157289  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0749  protein of unknown function UPF0118  27.27 
 
 
417 aa  72  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  20.19 
 
 
355 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1964  hypothetical protein  28.23 
 
 
378 aa  71.6  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3786  protein of unknown function UPF0118  25.56 
 
 
386 aa  71.6  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.262236  normal  0.0203414 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1096  protein of unknown function UPF0118  26.35 
 
 
374 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.771823  hitchhiker  0.00624948 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0766  hypothetical protein  25.08 
 
 
404 aa  70.9  0.00000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.838264  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1242  protein of unknown function UPF0118  26.53 
 
 
374 aa  71.2  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  hitchhiker  0.00297495 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  26.69 
 
 
354 aa  70.9  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1050  permease  25.85 
 
 
378 aa  70.5  0.00000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000509244  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1408  hypothetical protein  25.99 
 
 
372 aa  70.5  0.00000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.285024  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0928  permease  25.7 
 
 
361 aa  70.1  0.00000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.335153 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1463  protein of unknown function UPF0118  23.12 
 
 
407 aa  70.1  0.00000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1040  hypothetical protein  28.32 
 
 
366 aa  69.7  0.00000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00428171  unclonable  0.0000000129007 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2536  hypothetical protein  27.49 
 
 
364 aa  69.7  0.00000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1973  hypothetical protein  24.48 
 
 
369 aa  69.3  0.00000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0953876  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0960  protein of unknown function UPF0118  23.18 
 
 
353 aa  68.9  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  19.32 
 
 
351 aa  68.9  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3308  protein of unknown function UPF0118  27.22 
 
 
452 aa  68.6  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783017  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1793  hypothetical protein  28.62 
 
 
387 aa  68.2  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.116515  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0793  hypothetical protein  24.74 
 
 
379 aa  68.6  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114477  normal  0.678459 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  20.66 
 
 
341 aa  67.8  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0713  permease, putative  25.85 
 
 
382 aa  67.4  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.658083  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0259  protein of unknown function UPF0118  25.2 
 
 
356 aa  67.8  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5545  protein of unknown function UPF0118  27.13 
 
 
375 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0252141  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>