More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10207 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10207  transmembrane protein  100 
 
 
367 aa  700    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0169  hypothetical protein  70.28 
 
 
381 aa  481  1e-135  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0178  hypothetical protein  70.28 
 
 
381 aa  481  1e-135  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0159  hypothetical protein  70 
 
 
381 aa  479  1e-134  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0479062 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0195  hypothetical protein  68.42 
 
 
384 aa  436  1e-121  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566996  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0457  hypothetical protein  64.2 
 
 
383 aa  436  1e-121  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4482  protein of unknown function UPF0118  53.27 
 
 
390 aa  330  2e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255906  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0322  hypothetical protein  46.45 
 
 
487 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.084246  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0279  hypothetical protein  47.98 
 
 
423 aa  276  5e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0267805 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1164  hypothetical protein  43.4 
 
 
457 aa  267  2.9999999999999995e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.23073  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7052  protein of unknown function UPF0118  48.4 
 
 
402 aa  263  3e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39490  predicted permease  49.25 
 
 
403 aa  262  6.999999999999999e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.233759  normal  0.317185 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5305  hypothetical protein  41.57 
 
 
464 aa  249  7e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.111321  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0238  hypothetical protein  43.06 
 
 
421 aa  244  9.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.817468 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1236  protein of unknown function UPF0118  43.4 
 
 
439 aa  237  2e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000518014 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08190  predicted permease  39.29 
 
 
455 aa  226  6e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0210651 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2637  protein of unknown function UPF0118  40.78 
 
 
421 aa  224  1e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0978  hypothetical protein  41.09 
 
 
452 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.42646  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4772  protein of unknown function UPF0118  47.72 
 
 
475 aa  219  5e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.808425  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1161  hypothetical protein  41.67 
 
 
415 aa  218  1e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0938  protein of unknown function UPF0118  41.48 
 
 
420 aa  214  9.999999999999999e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1895  protein of unknown function UPF0118  38.53 
 
 
483 aa  205  1e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588951  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2203  protein of unknown function UPF0118  38.8 
 
 
397 aa  202  7e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0681126  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1468  protein of unknown function UPF0118  38.04 
 
 
368 aa  196  4.0000000000000005e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.916675  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1700  hypothetical protein  37.13 
 
 
429 aa  195  1e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00039584 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21060  predicted permease  37.54 
 
 
436 aa  194  2e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.152627  normal  0.29168 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2291  hypothetical protein  37.16 
 
 
407 aa  193  3e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.370535  normal  0.257699 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08290  predicted permease  37.65 
 
 
367 aa  190  2.9999999999999997e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23100  predicted permease  35.49 
 
 
477 aa  190  2.9999999999999997e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.741637  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3105  hypothetical protein  38.89 
 
 
389 aa  188  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2806  protein of unknown function UPF0118  42.04 
 
 
387 aa  186  6e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00669184 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05050  predicted permease  36.65 
 
 
405 aa  183  5.0000000000000004e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.187674  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1098  protein of unknown function UPF0118  42.64 
 
 
396 aa  181  2e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.370016  normal  0.531721 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1881  hypothetical protein  32.77 
 
 
435 aa  178  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2026  protein of unknown function UPF0118  37.2 
 
 
398 aa  162  6e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2286  protein of unknown function UPF0118  35.03 
 
 
418 aa  162  7e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0673264  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3393  protein of unknown function UPF0118  31.03 
 
 
426 aa  159  9e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.334585  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1050  protein of unknown function UPF0118  38.53 
 
 
384 aa  155  2e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6766  permease-like protein  36.53 
 
 
432 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2803  protein of unknown function UPF0118  32.23 
 
 
441 aa  147  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.168707  normal  0.0979616 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1252  hypothetical protein  36.31 
 
 
376 aa  146  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2128  protein of unknown function UPF0118  34.65 
 
 
444 aa  145  8.000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.813628  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3823  protein of unknown function UPF0118  33.54 
 
 
390 aa  141  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0609806  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0907  protein of unknown function UPF0118  34.34 
 
 
423 aa  137  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00600861  normal  0.0221352 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1226  hypothetical protein  33.96 
 
 
376 aa  137  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1243  hypothetical protein  33.96 
 
 
376 aa  137  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.597847 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3110  protein of unknown function UPF0118  34.26 
 
 
414 aa  134  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4850  hypothetical protein  35.58 
 
 
394 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4624  protein of unknown function UPF0118  35.48 
 
 
393 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0503  protein of unknown function UPF0118  30.53 
 
 
416 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7599  hypothetical protein  35.83 
 
 
355 aa  123  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0354819  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2613  protein of unknown function UPF0118  39.44 
 
 
392 aa  118  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.047245  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  30.2 
 
 
354 aa  108  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14120  predicted permease  29.6 
 
 
476 aa  101  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.209203  normal  0.521602 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6257  protein of unknown function UPF0118  39.38 
 
 
389 aa  100  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.707833  normal  0.194644 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4013  protein of unknown function UPF0118  26.86 
 
 
389 aa  98.2  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00579473  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3314  hypothetical protein  29.1 
 
 
353 aa  97.8  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2732  hypothetical protein  28.26 
 
 
345 aa  96.7  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  31.17 
 
 
529 aa  96.3  8e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  27.1 
 
 
390 aa  93.2  6e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  27.71 
 
 
354 aa  89.7  7e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  25.5 
 
 
361 aa  89.4  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3012  protein of unknown function UPF0118  28.22 
 
 
369 aa  89  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  24.05 
 
 
405 aa  88.6  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1694  hypothetical protein  29.72 
 
 
360 aa  88.2  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.258631  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1762  hypothetical protein  27.27 
 
 
329 aa  88.2  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  26.07 
 
 
361 aa  87  4e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  30.32 
 
 
370 aa  86.7  7e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2557  hypothetical protein  27.64 
 
 
404 aa  86.7  7e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0221  protein of unknown function UPF0118  25.9 
 
 
364 aa  85.1  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00795849 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  26.81 
 
 
358 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  27.41 
 
 
363 aa  85.1  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2075  hypothetical protein  28.19 
 
 
385 aa  85.1  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381466  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3758  hypothetical protein  26.79 
 
 
349 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  25.67 
 
 
361 aa  84  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  25.67 
 
 
361 aa  84  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  25.67 
 
 
348 aa  84  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  25.67 
 
 
361 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3848  hypothetical protein  26.79 
 
 
349 aa  83.6  0.000000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2360  hypothetical protein  29.28 
 
 
406 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  25.33 
 
 
373 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  25.33 
 
 
361 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0242  hypothetical protein  26.79 
 
 
349 aa  83.2  0.000000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3956  hypothetical protein  26.79 
 
 
349 aa  83.2  0.000000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  25.33 
 
 
348 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0657  permease  27.38 
 
 
384 aa  82.8  0.000000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.036358  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  25.08 
 
 
361 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  25.08 
 
 
361 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03323  predicted inner membrane protein  26.48 
 
 
349 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0241  protein of unknown function UPF0118  26.48 
 
 
349 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3673  hypothetical protein  26.48 
 
 
349 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2485  hypothetical protein  25.58 
 
 
435 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.957524  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0120  protein of unknown function UPF0118  25 
 
 
436 aa  82  0.00000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  27.76 
 
 
371 aa  82.4  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4794  inner membrane protein YhhT  26.48 
 
 
349 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02243  permease  28.65 
 
 
388 aa  82  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03276  hypothetical protein  26.48 
 
 
349 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  23.25 
 
 
396 aa  80.9  0.00000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0061  hypothetical protein  32.23 
 
 
383 aa  80.9  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1315  protein of unknown function UPF0118  28.1 
 
 
369 aa  80.9  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.494628  normal  0.216518 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>