More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6766 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6766  permease-like protein  100 
 
 		 432 aa  836    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2291  hypothetical protein  66.36 
 
 		 407 aa  412  1e-114  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.370535  normal  0.257699 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5305  hypothetical protein  44.99 
 
 		 464 aa  264  3e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.111321  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1161  hypothetical protein  43.57 
 
 		 415 aa  237  4e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1700  hypothetical protein  40.96 
 
 		 429 aa  234  3e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039584 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0322  hypothetical protein  42.22 
 
 		 487 aa  213  5.999999999999999e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.084246  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0457  hypothetical protein  39.34 
 
 		 383 aa  210  3e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0279  hypothetical protein  41.42 
 
 		 423 aa  206  5e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0267805 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7052  protein of unknown function UPF0118  39.58 
 
 		 402 aa  197  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1164  hypothetical protein  34.73 
 
 		 457 aa  194  4e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.23073  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0195  hypothetical protein  39.3 
 
 		 384 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0978  hypothetical protein  36.91 
 
 		 452 aa  188  1e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.42646  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0169  hypothetical protein  38.69 
 
 		 381 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0178  hypothetical protein  38.69 
 
 		 381 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0159  hypothetical protein  38.69 
 
 		 381 aa  186  6e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0479062 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4482  protein of unknown function UPF0118  35.97 
 
 		 390 aa  184  4.0000000000000006e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255906  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10207  transmembrane protein  38.41 
 
 		 367 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1098  protein of unknown function UPF0118  41.94 
 
 		 396 aa  172  1e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.370016  normal  0.531721 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1236  protein of unknown function UPF0118  33.66 
 
 		 439 aa  171  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000518014 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0938  protein of unknown function UPF0118  38.24 
 
 		 420 aa  169  7e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08190  predicted permease  39.27 
 
 		 455 aa  169  9e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0210651 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2203  protein of unknown function UPF0118  36.53 
 
 		 397 aa  169  1e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0681126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0238  hypothetical protein  35.16 
 
 		 421 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.817468 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3105  hypothetical protein  33.78 
 
 		 389 aa  160  3e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39490  predicted permease  38.3 
 
 		 403 aa  157  4e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.233759  normal  0.317185 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4772  protein of unknown function UPF0118  40.43 
 
 		 475 aa  156  7e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.808425  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21060  predicted permease  33.91 
 
 		 436 aa  155  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.152627  normal  0.29168 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1468  protein of unknown function UPF0118  35.55 
 
 		 368 aa  154  4e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.916675  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0907  protein of unknown function UPF0118  33.84 
 
 		 423 aa  152  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00600861  normal  0.0221352 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3393  protein of unknown function UPF0118  32.35 
 
 		 426 aa  152  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.334585  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2637  protein of unknown function UPF0118  36.27 
 
 		 421 aa  149  7e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23100  predicted permease  31.04 
 
 		 477 aa  148  2.0000000000000003e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.741637  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2806  protein of unknown function UPF0118  35.67 
 
 		 387 aa  148  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00669184 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1252  hypothetical protein  35.42 
 
 		 376 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2026  protein of unknown function UPF0118  32.76 
 
 		 398 aa  145  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0503  protein of unknown function UPF0118  34.48 
 
 		 416 aa  143  6e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4850  hypothetical protein  35.21 
 
 		 394 aa  143  7e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05050  predicted permease  37.22 
 
 		 405 aa  142  9.999999999999999e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.187674  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1895  protein of unknown function UPF0118  34.4 
 
 		 483 aa  142  9.999999999999999e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2128  protein of unknown function UPF0118  36.76 
 
 		 444 aa  142  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.813628  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14120  predicted permease  32.29 
 
 		 476 aa  140  3.9999999999999997e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.209203  normal  0.521602 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1050  protein of unknown function UPF0118  37.5 
 
 		 384 aa  139  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1226  hypothetical protein  35.03 
 
 		 376 aa  137  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1243  hypothetical protein  35.03 
 
 		 376 aa  137  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.597847 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1881  hypothetical protein  28.71 
 
 		 435 aa  133  5e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3823  protein of unknown function UPF0118  36.05 
 
 		 390 aa  129  7.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0609806  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2803  protein of unknown function UPF0118  31.67 
 
 		 441 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.168707  normal  0.0979616 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2286  protein of unknown function UPF0118  32.34 
 
 		 418 aa  127  3e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0673264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4624  protein of unknown function UPF0118  36.15 
 
 		 393 aa  126  8.000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3110  protein of unknown function UPF0118  34.62 
 
 		 414 aa  124  5e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08290  predicted permease  33.96 
 
 		 367 aa  116  8.999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6257  protein of unknown function UPF0118  33.33 
 
 		 389 aa  109  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.707833  normal  0.194644 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2613  protein of unknown function UPF0118  32.28 
 
 		 392 aa  103  7e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.047245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7599  hypothetical protein  33.77 
 
 		 355 aa  99.8  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0354819  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  26.82 
 
 		 396 aa  96.3  9e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2868  protein of unknown function UPF0118  29.25 
 
 		 400 aa  95.1  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0518  protein of unknown function UPF0118  31.32 
 
 		 397 aa  92.4  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.318359  normal  0.0533128 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1247  protein of unknown function UPF0118  28.73 
 
 		 388 aa  88.6  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1731  protein of unknown function UPF0118  35.96 
 
 		 373 aa  85.9  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0209  protein of unknown function UPF0118  28.79 
 
 		 399 aa  85.9  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  27.46 
 
 		 529 aa  85.1  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0136  protein of unknown function UPF0118  24.86 
 
 		 387 aa  83.6  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.291617  normal  0.459798 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0829  protein of unknown function UPF0118  27.76 
 
 		 422 aa  82.4  0.00000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0384263  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1973  hypothetical protein  28.39 
 
 		 369 aa  82  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0953876  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2491  protein of unknown function UPF0118  29.58 
 
 		 353 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  26.79 
 
 		 358 aa  80.1  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  25.4 
 
 		 390 aa  80.1  0.00000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2641  protein of unknown function UPF0118  27.97 
 
 		 408 aa  79.7  0.00000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.517547  normal  0.208528 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1485  protein of unknown function UPF0118  28.24 
 
 		 455 aa  79.7  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.823858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1877  protein of unknown function UPF0118  26.8 
 
 		 355 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3845  hypothetical protein  26.11 
 
 		 406 aa  77.8  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.521345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3116  membrane transporter  26.11 
 
 		 388 aa  77.4  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  27.04 
 
 		 355 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  27.04 
 
 		 355 aa  77  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  27.36 
 
 		 355 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  27.36 
 
 		 355 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  27.36 
 
 		 355 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  27.36 
 
 		 355 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  27.36 
 
 		 355 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2437  protein of unknown function UPF0118  33.73 
 
 		 386 aa  75.1  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000151216  normal  0.0209402 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2317  protein of unknown function UPF0118  26.54 
 
 		 377 aa  74.7  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.255461 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  26.98 
 
 		 355 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1300  hypothetical protein  30 
 
 		 434 aa  74.7  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.493989  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2668  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  30.8 
 
 		 665 aa  73.6  0.000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3480  protein of unknown function UPF0118  32.59 
 
 		 412 aa  73.6  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.904351  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3144  hypothetical protein  27.66 
 
 		 393 aa  73.2  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0744058  normal  0.288256 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3544  protein of unknown function UPF0118  32.14 
 
 		 412 aa  73.2  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  22.37 
 
 		 392 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1841  permease  26.61 
 
 		 563 aa  71.6  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0779  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  28.62 
 
 		 375 aa  72  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.770407  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0061  hypothetical protein  28.64 
 
 		 383 aa  72  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2398  accumulation associated protein  43.3 
 
 		 2397 aa  71.2  0.00000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.53067  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0120  protein of unknown function UPF0118  24.31 
 
 		 436 aa  71.2  0.00000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4523  hypothetical protein  26.96 
 
 		 355 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0610501  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2435  hypothetical protein  28.62 
 
 		 358 aa  71.2  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0853714  normal  0.0537169 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1697  hypothetical protein  27.06 
 
 		 360 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.588209  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  27.86 
 
 		 373 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0221  protein of unknown function UPF0118  28.63 
 
 		 364 aa  69.7  0.00000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795849 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  27.86 
 
 		 348 aa  70.1  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1623  PerM family permease  25.61 
 
 		 367 aa  70.1  0.00000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.134997 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>