More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1247 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1247  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 		 388 aa  765    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  46.36 
 
 		 529 aa  286  5e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1694  permease-like protein  43.2 
 
 		 443 aa  272  9e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111642  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8629  permease-like protein  42.45 
 
 		 423 aa  263  4e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1793  hypothetical protein  45.13 
 
 		 387 aa  263  6e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.116515  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09400  predicted permease  39.02 
 
 		 357 aa  214  1.9999999999999998e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.291782 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3615  hypothetical protein  37.7 
 
 		 412 aa  201  3e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3997  hypothetical protein  36.14 
 
 		 413 aa  201  3e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00194517  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0195  protein of unknown function UPF0118  35.88 
 
 		 486 aa  196  7e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7547  protein of unknown function UPF0118  32.71 
 
 		 392 aa  192  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43907  normal  0.494892 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6535  protein of unknown function UPF0118  29.11 
 
 		 394 aa  164  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.278292  normal  0.0349253 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1608  hypothetical protein  33.88 
 
 		 371 aa  161  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.55717  normal  0.0841628 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2329  protein of unknown function UPF0118  32.28 
 
 		 436 aa  157  3e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000385102 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1731  protein of unknown function UPF0118  31.49 
 
 		 373 aa  147  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2596  hypothetical protein  31.82 
 
 		 371 aa  143  4e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  27.71 
 
 		 354 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2868  protein of unknown function UPF0118  30.94 
 
 		 400 aa  125  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2284  protein of unknown function UPF0118  32.15 
 
 		 406 aa  119  9e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00112442  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4330  protein of unknown function UPF0118  30.53 
 
 		 358 aa  116  7.999999999999999e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2165  hypothetical protein  32.29 
 
 		 414 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.128502  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2437  protein of unknown function UPF0118  27.56 
 
 		 386 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000151216  normal  0.0209402 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2641  protein of unknown function UPF0118  28.96 
 
 		 408 aa  107  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.517547  normal  0.208528 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15290  predicted permease  25.57 
 
 		 415 aa  106  7e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2203  protein of unknown function UPF0118  29.36 
 
 		 397 aa  106  7e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0681126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1485  protein of unknown function UPF0118  24.57 
 
 		 455 aa  105  9e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.823858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0518  protein of unknown function UPF0118  28.5 
 
 		 397 aa  102  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.318359  normal  0.0533128 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2233  hypothetical protein  27.43 
 
 		 379 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.195735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2050  hypothetical protein  29.18 
 
 		 368 aa  100  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116574  hitchhiker  0.00000000347502 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0457  hypothetical protein  28.11 
 
 		 383 aa  99  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0209  protein of unknown function UPF0118  28.95 
 
 		 399 aa  98.2  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  28.78 
 
 		 371 aa  97.4  3e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0518  hypothetical protein  32.46 
 
 		 387 aa  97.4  4e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3009  protein of unknown function UPF0118  28.28 
 
 		 382 aa  97.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3863  hypothetical protein  26.64 
 
 		 347 aa  96.7  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.596541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3926  protein of unknown function UPF0118  26.01 
 
 		 340 aa  96.7  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3466  protein of unknown function UPF0118  25.28 
 
 		 448 aa  96.3  7e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.254752 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0221  protein of unknown function UPF0118  25.43 
 
 		 364 aa  96.3  7e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795849 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  30.21 
 
 		 358 aa  96.3  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4001  hypothetical protein  24.63 
 
 		 368 aa  95.1  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.591053 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  24.84 
 
 		 405 aa  94  4e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  27.45 
 
 		 344 aa  94  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2392  hypothetical protein  26.84 
 
 		 349 aa  93.6  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.89361 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  29.85 
 
 		 370 aa  93.6  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2806  hypothetical protein  28.62 
 
 		 372 aa  93.6  6e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.217461  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  25.53 
 
 		 349 aa  93.2  8e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1050  protein of unknown function UPF0118  29.43 
 
 		 384 aa  92.8  9e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1773  hypothetical protein  30.25 
 
 		 357 aa  91.7  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000027115  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3355  hypothetical protein  26.42 
 
 		 373 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0279  hypothetical protein  28.35 
 
 		 423 aa  90.9  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0267805 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0522  hypothetical protein  25.93 
 
 		 377 aa  90.5  4e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.176917  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0322  hypothetical protein  28.94 
 
 		 487 aa  90.5  5e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.084246  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3308  protein of unknown function UPF0118  24.78 
 
 		 452 aa  90.1  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783017  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  25.07 
 
 		 341 aa  90.1  6e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3380  hypothetical protein  26.1 
 
 		 376 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.300528  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1871  membrane protein YubA  26.1 
 
 		 373 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  27.62 
 
 		 343 aa  90.1  6e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1881  hypothetical protein  26.2 
 
 		 435 aa  89.7  8e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3381  membrane protein YubA  25.79 
 
 		 373 aa  89  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00559166  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1352  protein of unknown function UPF0118  26.3 
 
 		 438 aa  88.6  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3105  hypothetical protein  27.37 
 
 		 389 aa  88.2  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  26.02 
 
 		 402 aa  87.8  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  26.02 
 
 		 402 aa  87.8  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3161  hypothetical protein  25.79 
 
 		 376 aa  87.4  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000118258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3145  permease  25.79 
 
 		 376 aa  87.4  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000188051  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3410  hypothetical protein  25.79 
 
 		 376 aa  87.4  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  23.32 
 
 		 392 aa  87.4  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3380  hypothetical protein  25.79 
 
 		 373 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07661  permease  32.91 
 
 		 358 aa  87.4  4e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0677332 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1139  hypothetical protein  30.3 
 
 		 526 aa  87  5e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4793  hypothetical protein  27.22 
 
 		 344 aa  87  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.560868 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2979  hypothetical protein  29.37 
 
 		 387 aa  87  6e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3083  hypothetical protein  24.92 
 
 		 373 aa  86.7  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000376158  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0195  hypothetical protein  28.16 
 
 		 384 aa  86.7  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566996  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3055  permease  25.47 
 
 		 376 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0055436  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08230  predicted permease  33.33 
 
 		 440 aa  85.5  0.000000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3393  protein of unknown function UPF0118  26.67 
 
 		 426 aa  84.7  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.334585  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0558  hypothetical protein  28.14 
 
 		 362 aa  85.1  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0561744  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  33.52 
 
 		 349 aa  85.5  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0224  protein of unknown function UPF0118  27.61 
 
 		 345 aa  84.3  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000072412  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0169  hypothetical protein  26.96 
 
 		 381 aa  83.6  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0178  hypothetical protein  26.96 
 
 		 381 aa  83.6  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2485  hypothetical protein  27.2 
 
 		 435 aa  82.8  0.000000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.957524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0749  protein of unknown function UPF0118  26.86 
 
 		 417 aa  82.8  0.000000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2774  hypothetical protein  24.84 
 
 		 348 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2554  hypothetical protein  29.15 
 
 		 356 aa  82.8  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  27.42 
 
 		 351 aa  82.8  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4544  hypothetical protein  28.19 
 
 		 381 aa  81.6  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2291  hypothetical protein  25.83 
 
 		 424 aa  81.3  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0503  protein of unknown function UPF0118  26.65 
 
 		 416 aa  81.3  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0238  hypothetical protein  26.85 
 
 		 421 aa  81.3  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.817468 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0159  hypothetical protein  26.65 
 
 		 381 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0479062 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4482  protein of unknown function UPF0118  25.9 
 
 		 390 aa  80.5  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255906  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1841  permease  23.78 
 
 		 563 aa  80.5  0.00000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2927  permease  25.43 
 
 		 365 aa  80.5  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241708  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1195  hypothetical protein  31.82 
 
 		 329 aa  79.7  0.00000000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3786  protein of unknown function UPF0118  28.78 
 
 		 386 aa  80.1  0.00000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.262236  normal  0.0203414 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1164  hypothetical protein  25.72 
 
 		 457 aa  80.1  0.00000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.23073  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2286  protein of unknown function UPF0118  28.32 
 
 		 418 aa  79.7  0.00000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0673264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1113  hypothetical protein  25.66 
 
 		 363 aa  79.7  0.00000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0939063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0907  protein of unknown function UPF0118  30.52 
 
 		 423 aa  79.7  0.00000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00600861  normal  0.0221352 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>