More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3466 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_3466  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 		 448 aa  878    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.254752 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0221  protein of unknown function UPF0118  74.48 
 
 		 364 aa  502  1e-141  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795849 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15290  predicted permease  58.09 
 
 		 415 aa  461  9.999999999999999e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1485  protein of unknown function UPF0118  54.17 
 
 		 455 aa  419  1e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.823858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1841  permease  45.36 
 
 		 563 aa  334  2e-90  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1139  hypothetical protein  44.57 
 
 		 526 aa  321  9.999999999999999e-87  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2641  protein of unknown function UPF0118  41.88 
 
 		 408 aa  224  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.517547  normal  0.208528 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2165  hypothetical protein  41.53 
 
 		 414 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.128502  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0209  protein of unknown function UPF0118  35.31 
 
 		 399 aa  187  3e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2437  protein of unknown function UPF0118  31.49 
 
 		 386 aa  169  7e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000151216  normal  0.0209402 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  29.01 
 
 		 529 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2284  protein of unknown function UPF0118  30.57 
 
 		 406 aa  109  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00112442  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2868  protein of unknown function UPF0118  31.33 
 
 		 400 aa  104  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  27.58 
 
 		 354 aa  103  9e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3615  hypothetical protein  29.84 
 
 		 412 aa  102  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1694  permease-like protein  28.64 
 
 		 443 aa  102  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111642  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0195  protein of unknown function UPF0118  26.22 
 
 		 486 aa  101  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8629  permease-like protein  26.33 
 
 		 423 aa  99.8  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1247  protein of unknown function UPF0118  25.07 
 
 		 388 aa  98.6  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0907  protein of unknown function UPF0118  31.73 
 
 		 423 aa  98.6  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00600861  normal  0.0221352 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1731  protein of unknown function UPF0118  28.76 
 
 		 373 aa  98.2  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3997  hypothetical protein  28.76 
 
 		 413 aa  95.9  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00194517  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4330  protein of unknown function UPF0118  30.36 
 
 		 358 aa  94.7  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2329  protein of unknown function UPF0118  27.44 
 
 		 436 aa  94  5e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000385102 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2927  permease  26.88 
 
 		 365 aa  91.7  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241708  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09400  predicted permease  31.33 
 
 		 357 aa  91.3  3e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.291782 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7547  protein of unknown function UPF0118  26.65 
 
 		 392 aa  90.5  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43907  normal  0.494892 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0457  hypothetical protein  27.76 
 
 		 383 aa  89.7  9e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0279  hypothetical protein  27.58 
 
 		 423 aa  87.8  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0267805 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0322  hypothetical protein  27.33 
 
 		 487 aa  87.4  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.084246  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6535  protein of unknown function UPF0118  28.03 
 
 		 394 aa  85.1  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.278292  normal  0.0349253 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  23.08 
 
 		 351 aa  85.5  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0503  protein of unknown function UPF0118  29.96 
 
 		 416 aa  84.7  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1793  hypothetical protein  24.83 
 
 		 387 aa  84.7  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.116515  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1226  hypothetical protein  29.96 
 
 		 376 aa  83.6  0.000000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1243  hypothetical protein  29.96 
 
 		 376 aa  83.6  0.000000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.597847 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08290  predicted permease  27.44 
 
 		 367 aa  82.4  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0195  hypothetical protein  27.65 
 
 		 384 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1252  hypothetical protein  30 
 
 		 376 aa  81.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0169  hypothetical protein  27.21 
 
 		 381 aa  80.9  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0178  hypothetical protein  27.21 
 
 		 381 aa  80.9  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3393  protein of unknown function UPF0118  29.55 
 
 		 426 aa  80.5  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.334585  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1762  hypothetical protein  23.9 
 
 		 329 aa  80.5  0.00000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1194  protein of unknown function UPF0118  27.35 
 
 		 359 aa  80.5  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.514771  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0159  hypothetical protein  27.21 
 
 		 381 aa  80.5  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0479062 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1125  protein of unknown function UPF0118  26.18 
 
 		 359 aa  79.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0518  protein of unknown function UPF0118  26.62 
 
 		 397 aa  79.3  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.318359  normal  0.0533128 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2203  protein of unknown function UPF0118  26.27 
 
 		 397 aa  78.6  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0681126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2596  hypothetical protein  25.32 
 
 		 371 aa  78.6  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2774  hypothetical protein  25.46 
 
 		 348 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2128  protein of unknown function UPF0118  29.5 
 
 		 444 aa  77.8  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.813628  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4116  protein of unknown function UPF0118  25.79 
 
 		 360 aa  77.8  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.614918  normal  0.119486 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0558  hypothetical protein  26.91 
 
 		 362 aa  77.4  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0561744  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08190  predicted permease  30.69 
 
 		 455 aa  77.8  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0210651 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3823  protein of unknown function UPF0118  30.14 
 
 		 390 aa  77.4  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0609806  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0938  protein of unknown function UPF0118  26.95 
 
 		 420 aa  77  0.0000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4850  hypothetical protein  30.72 
 
 		 394 aa  76.3  0.0000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  23.18 
 
 		 361 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  22.26 
 
 		 392 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1236  protein of unknown function UPF0118  25 
 
 		 439 aa  75.5  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000518014 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  22.7 
 
 		 373 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  23.82 
 
 		 361 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23100  predicted permease  26.68 
 
 		 477 aa  74.3  0.000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.741637  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0136  protein of unknown function UPF0118  25.16 
 
 		 387 aa  73.9  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.291617  normal  0.459798 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0238  hypothetical protein  26.67 
 
 		 421 aa  73.9  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.817468 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2957  hypothetical protein  23.36 
 
 		 366 aa  73.6  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5305  hypothetical protein  28.77 
 
 		 464 aa  73.6  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.111321  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  22.84 
 
 		 361 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0657  permease  23.48 
 
 		 384 aa  73.6  0.000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.036358  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  26.13 
 
 		 349 aa  73.6  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1757  hypothetical protein  25.75 
 
 		 360 aa  73.2  0.000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.805933  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  22.28 
 
 		 361 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  22.28 
 
 		 361 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0456  protein of unknown function UPF0118  22.29 
 
 		 460 aa  72.8  0.00000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.204189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  22.56 
 
 		 361 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1608  hypothetical protein  27.71 
 
 		 371 aa  72.8  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.55717  normal  0.0841628 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  22.28 
 
 		 361 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  22.56 
 
 		 361 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1164  hypothetical protein  25.3 
 
 		 457 aa  72.8  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.23073  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3009  protein of unknown function UPF0118  23.81 
 
 		 382 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0779  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  26.36 
 
 		 375 aa  71.6  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.770407  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2291  hypothetical protein  26.61 
 
 		 424 aa  72.4  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2435  hypothetical protein  26.36 
 
 		 358 aa  71.2  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0853714  normal  0.0537169 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14120  predicted permease  30.69 
 
 		 476 aa  70.9  0.00000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.209203  normal  0.521602 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2262  hypothetical protein  31.5 
 
 		 381 aa  71.2  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0141033  normal  0.407022 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0978  hypothetical protein  27.59 
 
 		 452 aa  71.2  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.42646  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  23.08 
 
 		 348 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1881  hypothetical protein  24.08 
 
 		 435 aa  70.5  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1161  hypothetical protein  30.28 
 
 		 415 aa  70.9  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2867  permease PerM, putative  24.83 
 
 		 361 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1066  hypothetical protein  26.18 
 
 		 359 aa  70.1  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.283585  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2201  hypothetical protein  25.38 
 
 		 365 aa  69.7  0.00000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000750597  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  22.51 
 
 		 348 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0061  hypothetical protein  26.14 
 
 		 383 aa  69.3  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1352  protein of unknown function UPF0118  21.29 
 
 		 438 aa  69.7  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2668  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  29.46 
 
 		 665 aa  68.9  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0823  protein of unknown function UPF0118  26.29 
 
 		 358 aa  68.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74505  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1408  hypothetical protein  25.08 
 
 		 372 aa  68.9  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.285024  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2485  hypothetical protein  23.95 
 
 		 435 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.957524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1911  hypothetical protein  23.9 
 
 		 372 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24805  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>