More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3615 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3615  hypothetical protein  100 
 
 		 412 aa  790    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3997  hypothetical protein  84.5 
 
 		 413 aa  632  1e-180  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00194517  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  46.04 
 
 		 529 aa  322  9.999999999999999e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8629  permease-like protein  47.81 
 
 		 423 aa  312  7.999999999999999e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1694  permease-like protein  44.2 
 
 		 443 aa  290  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111642  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1608  hypothetical protein  44.44 
 
 		 371 aa  249  4e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.55717  normal  0.0841628 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1793  hypothetical protein  43.77 
 
 		 387 aa  249  7e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.116515  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0195  protein of unknown function UPF0118  41.14 
 
 		 486 aa  228  2e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1247  protein of unknown function UPF0118  37.7 
 
 		 388 aa  218  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7547  protein of unknown function UPF0118  38.04 
 
 		 392 aa  210  4e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43907  normal  0.494892 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09400  predicted permease  39.48 
 
 		 357 aa  196  8.000000000000001e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.291782 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6535  protein of unknown function UPF0118  35.23 
 
 		 394 aa  192  8e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.278292  normal  0.0349253 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2284  protein of unknown function UPF0118  36.32 
 
 		 406 aa  177  3e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00112442  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2329  protein of unknown function UPF0118  32.98 
 
 		 436 aa  166  6.9999999999999995e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000385102 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2868  protein of unknown function UPF0118  35.39 
 
 		 400 aa  165  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2596  hypothetical protein  34.49 
 
 		 371 aa  166  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1731  protein of unknown function UPF0118  33.23 
 
 		 373 aa  150  5e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4330  protein of unknown function UPF0118  31.08 
 
 		 358 aa  133  5e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  30.06 
 
 		 354 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0518  protein of unknown function UPF0118  32.65 
 
 		 397 aa  124  4e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.318359  normal  0.0533128 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08230  predicted permease  37.28 
 
 		 440 aa  116  6e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0209  protein of unknown function UPF0118  34.03 
 
 		 399 aa  107  3e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1139  hypothetical protein  25.46 
 
 		 526 aa  106  8e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2641  protein of unknown function UPF0118  29.51 
 
 		 408 aa  106  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.517547  normal  0.208528 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2165  hypothetical protein  27.93 
 
 		 414 aa  101  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.128502  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1485  protein of unknown function UPF0118  28.62 
 
 		 455 aa  101  3e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.823858  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0221  protein of unknown function UPF0118  31.46 
 
 		 364 aa  99.4  9e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795849 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  25.23 
 
 		 355 aa  99  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  25.23 
 
 		 355 aa  99  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  25.56 
 
 		 355 aa  98.6  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  25.56 
 
 		 355 aa  98.6  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  25.56 
 
 		 355 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  25.56 
 
 		 355 aa  98.6  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  25.56 
 
 		 355 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  25.71 
 
 		 355 aa  97.1  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2485  hypothetical protein  26.68 
 
 		 435 aa  97.1  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.957524  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3466  protein of unknown function UPF0118  30.29 
 
 		 448 aa  96.7  7e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.254752 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4060  hypothetical protein  26.71 
 
 		 404 aa  94.4  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000137982  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1841  permease  26.03 
 
 		 563 aa  94.4  3e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2732  hypothetical protein  27.66 
 
 		 345 aa  93.2  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0522  hypothetical protein  26.19 
 
 		 377 aa  92.4  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.176917  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0829  protein of unknown function UPF0118  31.64 
 
 		 422 aa  89.7  7e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0384263  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15290  predicted permease  28.34 
 
 		 415 aa  90.1  7e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  24.62 
 
 		 349 aa  89.7  8e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4473  hypothetical protein  26.5 
 
 		 356 aa  89  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17401  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3102  hypothetical protein  25.88 
 
 		 352 aa  89.4  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0322  hypothetical protein  28.28 
 
 		 487 aa  89.4  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.084246  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  23.97 
 
 		 392 aa  88.6  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3129  hypothetical protein  26.32 
 
 		 418 aa  88.2  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  24.68 
 
 		 373 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4544  hypothetical protein  25.55 
 
 		 381 aa  88.6  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4001  hypothetical protein  27.18 
 
 		 368 aa  88.6  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.591053 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  24.68 
 
 		 348 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0279  hypothetical protein  29.01 
 
 		 423 aa  87.8  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0267805 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0224  protein of unknown function UPF0118  26.8 
 
 		 345 aa  88.2  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000072412  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  24.61 
 
 		 361 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  24.61 
 
 		 361 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  24.68 
 
 		 361 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0663  protein of unknown function UPF0118  26.09 
 
 		 373 aa  87.4  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.177633 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26240  predicted permease  28.42 
 
 		 400 aa  87  6e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4523  hypothetical protein  25.24 
 
 		 355 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0610501  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  24.37 
 
 		 348 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0978  hypothetical protein  27.34 
 
 		 452 aa  85.9  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.42646  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  24.37 
 
 		 361 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  24.37 
 
 		 361 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  24.37 
 
 		 361 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  32.24 
 
 		 358 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4013  protein of unknown function UPF0118  26.77 
 
 		 389 aa  84.7  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00579473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0558  hypothetical protein  26.92 
 
 		 362 aa  84.7  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0561744  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  22.32 
 
 		 369 aa  84.3  0.000000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3520  hypothetical protein  28.15 
 
 		 434 aa  84  0.000000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.365519  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2774  hypothetical protein  28.43 
 
 		 348 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1242  protein of unknown function UPF0118  26.87 
 
 		 374 aa  83.2  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  hitchhiker  0.00297495 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2001  permease  26.38 
 
 		 371 aa  83.2  0.000000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  22.98 
 
 		 405 aa  82.4  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  24.05 
 
 		 361 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2291  hypothetical protein  27.7 
 
 		 424 aa  82  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5305  hypothetical protein  28.24 
 
 		 464 aa  81.3  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.111321  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  23.42 
 
 		 361 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2382  membrane protein  28.12 
 
 		 355 aa  80.9  0.00000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1635  hypothetical protein  25.29 
 
 		 357 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.546399  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0707  permease, putative  24.91 
 
 		 391 aa  80.5  0.00000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4793  hypothetical protein  27.79 
 
 		 344 aa  80.5  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.560868 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  25.76 
 
 		 379 aa  79.7  0.00000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0716  hypothetical protein  24.74 
 
 		 366 aa  79.7  0.00000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.073836  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002790  permease PerM  27.16 
 
 		 357 aa  79  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2491  protein of unknown function UPF0118  23.47 
 
 		 353 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1742  putative permease PerM  26.77 
 
 		 354 aa  79.3  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0061  hypothetical protein  26.77 
 
 		 383 aa  79  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2575  hypothetical protein  25.6 
 
 		 415 aa  79.3  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41372  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1096  protein of unknown function UPF0118  24.78 
 
 		 374 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.771823  hitchhiker  0.00624948 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03191  hypothetical protein  26.11 
 
 		 356 aa  78.2  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1881  hypothetical protein  24.27 
 
 		 435 aa  77.8  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02243  permease  27.47 
 
 		 388 aa  78.2  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3286  protein of unknown function UPF0118  25.61 
 
 		 354 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2702  hypothetical protein  26.12 
 
 		 353 aa  77.4  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0593591 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  24.75 
 
 		 354 aa  77.4  0.0000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3464  hypothetical protein  25.29 
 
 		 406 aa  77  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384592 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2927  permease  24.53 
 
 		 365 aa  76.6  0.0000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241708  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  22.84 
 
 		 349 aa  76.6  0.0000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>