More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_1066 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_1066  hypothetical protein  100 
 
 
359 aa  694    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.283585  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1194  protein of unknown function UPF0118  92.48 
 
 
359 aa  645    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.514771  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1125  protein of unknown function UPF0118  92.76 
 
 
359 aa  645    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2927  transport protein  30.83 
 
 
405 aa  152  8e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.799818  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3144  hypothetical protein  32.28 
 
 
393 aa  149  8e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0744058  normal  0.288256 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2075  hypothetical protein  31.44 
 
 
385 aa  146  5e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381466  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2002  hypothetical protein  30.86 
 
 
434 aa  144  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0749036  hitchhiker  0.0034214 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2253  putative permease  28.16 
 
 
389 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3095  hypothetical protein  31.92 
 
 
393 aa  140  3.9999999999999997e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3845  hypothetical protein  31.02 
 
 
406 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.521345  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3116  membrane transporter  31.02 
 
 
388 aa  139  6e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3452  hypothetical protein  28.12 
 
 
394 aa  139  6e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1364  protein of unknown function UPF0118  28.53 
 
 
420 aa  138  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2644  hypothetical protein  31.75 
 
 
393 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3669  hypothetical protein  30.17 
 
 
390 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1381  hypothetical protein  27.11 
 
 
384 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3520  hypothetical protein  31.82 
 
 
434 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.365519  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5154  hypothetical protein  27.45 
 
 
663 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6859  protein of unknown function UPF0118  29.52 
 
 
662 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.810171 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1431  hypothetical protein  32.3 
 
 
606 aa  126  7e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.145958  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1561  putative transport protein  29.97 
 
 
352 aa  125  9e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.421411  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1709  putative transport protein  29.97 
 
 
352 aa  125  9e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0814358  hitchhiker  0.000224346 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1669  putative transport protein  29.97 
 
 
352 aa  125  9e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5020  protein of unknown function UPF0118  29.12 
 
 
679 aa  125  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247687  normal  0.0740005 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4560  hypothetical protein  29.12 
 
 
668 aa  125  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.119566 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2954  hypothetical protein  27.51 
 
 
386 aa  125  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5963  protein of unknown function UPF0118  28.4 
 
 
353 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.97133 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5076  protein of unknown function UPF0118  29.67 
 
 
675 aa  124  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.864281 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0304  protein of unknown function UPF0118  28.64 
 
 
650 aa  122  8e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.10955  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3196  hypothetical protein  27.18 
 
 
660 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1509  hypothetical protein  28.3 
 
 
399 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3145  hypothetical protein  27.18 
 
 
660 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.44353  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001931  putative permease protein  26.5 
 
 
356 aa  120  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1725  protein of unknown function UPF0118  30.85 
 
 
680 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02869  transport protein  28.71 
 
 
338 aa  120  4.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2158  hypothetical protein  31.59 
 
 
387 aa  120  4.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2560  hypothetical protein  28.46 
 
 
644 aa  118  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1889  putative transport protein  32.04 
 
 
350 aa  118  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000651778 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2517  hypothetical protein  30.58 
 
 
361 aa  118  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2482  hypothetical protein  28.65 
 
 
662 aa  117  3e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0555  hypothetical protein  26.04 
 
 
380 aa  117  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.11052 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6648  putative phytochrome sensor protein  27.04 
 
 
805 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1665  hypothetical protein  29.48 
 
 
382 aa  112  9e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000108955  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4584  protein of unknown function UPF0118  28.98 
 
 
652 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.113593  normal  0.096848 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0413  hypothetical protein  30.56 
 
 
679 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.169508 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0263  protein of unknown function UPF0118  28.49 
 
 
369 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.120153  normal  0.560864 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4214  hypothetical protein  28.86 
 
 
652 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0784859  normal  0.378864 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2430  hypothetical protein  29.23 
 
 
360 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3881  hypothetical protein  28.57 
 
 
349 aa  110  4.0000000000000004e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.198688 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1640  transport protein  25.68 
 
 
336 aa  110  4.0000000000000004e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1910  putative transport protein  30.42 
 
 
344 aa  110  5e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2920  hypothetical protein  28.62 
 
 
368 aa  109  6e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4370  protein of unknown function UPF0118  26.45 
 
 
652 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1693  putative transport protein  30.23 
 
 
344 aa  109  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.31551  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2778  hypothetical protein  27.5 
 
 
369 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0204087  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2681  hypothetical protein  27.5 
 
 
369 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.185142  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1685  protein of unknown function UPF0118  27.5 
 
 
369 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0357703  normal  0.026776 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6242  hypothetical protein  26.56 
 
 
659 aa  109  9.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.253941  normal  0.568466 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1700  hypothetical protein  28.13 
 
 
359 aa  109  9.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.23154  normal  0.0296077 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1590  putative transport protein  30.23 
 
 
344 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1649  putative transport protein  30.23 
 
 
344 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4731  protein of unknown function UPF0118  27.14 
 
 
649 aa  108  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0106944 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2702  hypothetical protein  27.5 
 
 
369 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00759105  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1860  putative transport protein  30.23 
 
 
344 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2379  hypothetical protein  26.79 
 
 
345 aa  108  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412006  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2158  protein of unknown function UPF0118  29.09 
 
 
653 aa  108  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4144  putative phytochrome sensor protein  26.93 
 
 
821 aa  108  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0677009 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2065  protein of unknown function UPF0118  29.09 
 
 
358 aa  107  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.742659  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1581  putative transport protein  29.94 
 
 
344 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.180816 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1696  putative phytochrome sensor protein  29.14 
 
 
830 aa  107  4e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1485  hypothetical protein  29.49 
 
 
368 aa  107  4e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00467252  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1550  hypothetical protein  29.49 
 
 
368 aa  107  4e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0232271  normal  0.172747 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1544  hypothetical protein  28.57 
 
 
368 aa  106  5e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.173707  normal  0.127911 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6996  putative permease  27.91 
 
 
372 aa  106  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1060  hypothetical protein  29.94 
 
 
645 aa  106  7e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3553  hypothetical protein  29.31 
 
 
647 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0625218 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1983  protein of unknown function UPF0118  28.72 
 
 
408 aa  105  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2909  hypothetical protein  29.09 
 
 
372 aa  105  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2995  hypothetical protein  24.69 
 
 
377 aa  104  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2891  hypothetical protein  27.38 
 
 
394 aa  104  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0951393  hitchhiker  0.00000885055 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1490  hypothetical protein  28.13 
 
 
358 aa  104  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00480126  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1892  putative GAF sensor protein  28.86 
 
 
824 aa  105  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.397553 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2140  hypothetical protein  25.63 
 
 
700 aa  103  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.425167  normal  0.975115 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0209  protein of unknown function UPF0118  27.64 
 
 
651 aa  103  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0257  response regulator receiver domain-containing protein  24.57 
 
 
357 aa  104  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.492639 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5379  protein of unknown function UPF0118  27.04 
 
 
650 aa  103  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.613329  normal  0.237029 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2386  hypothetical protein  27.03 
 
 
368 aa  103  5e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0461614  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1233  membrane transporter  27.61 
 
 
650 aa  103  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0210631  normal  0.375468 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4144  putative GAF sensor protein  23.55 
 
 
801 aa  103  6e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2143  hypothetical protein  26.55 
 
 
366 aa  103  7e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2311  hypothetical protein  25.83 
 
 
354 aa  102  8e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3105  hypothetical protein  28.57 
 
 
374 aa  102  8e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2398  hypothetical protein  27.1 
 
 
389 aa  102  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.17382  normal  0.699282 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3758  hypothetical protein  28.3 
 
 
349 aa  102  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3882  putative GAF sensor protein  23.76 
 
 
782 aa  102  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3851  inner membrane protein YhhT  30.55 
 
 
349 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3566  hypothetical protein  29.38 
 
 
657 aa  101  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0446712  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3848  hypothetical protein  28.3 
 
 
349 aa  102  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2557  hypothetical protein  27.48 
 
 
404 aa  101  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3314  hypothetical protein  26.48 
 
 
353 aa  100  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>