More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2644 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2644  hypothetical protein  100 
 
 		 393 aa  776    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1509  hypothetical protein  64.17 
 
 		 399 aa  419  1e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3452  hypothetical protein  41.47 
 
 		 394 aa  276  7e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2927  transport protein  40.51 
 
 		 405 aa  269  7e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.799818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3669  hypothetical protein  40.62 
 
 		 390 aa  269  7e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1364  protein of unknown function UPF0118  40.05 
 
 		 420 aa  269  8e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3095  hypothetical protein  40.75 
 
 		 393 aa  256  7e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2253  putative permease  39.94 
 
 		 389 aa  242  7e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2002  hypothetical protein  40.36 
 
 		 434 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0749036  hitchhiker  0.0034214 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1381  hypothetical protein  37.46 
 
 		 384 aa  225  1e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2954  hypothetical protein  36.25 
 
 		 386 aa  205  1e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3776  protein of unknown function UPF0118  36.77 
 
 		 439 aa  193  4e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.165443 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3888  protein of unknown function UPF0118  36.77 
 
 		 439 aa  193  4e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1066  hypothetical protein  31.75 
 
 		 359 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.283585  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3144  hypothetical protein  32.65 
 
 		 393 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0744058  normal  0.288256 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1194  protein of unknown function UPF0118  31.55 
 
 		 359 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.514771  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1125  protein of unknown function UPF0118  31.55 
 
 		 359 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3845  hypothetical protein  32.35 
 
 		 406 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.521345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3116  membrane transporter  32.35 
 
 		 388 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8661  protein of unknown function UPF0118  29.81 
 
 		 386 aa  155  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2075  hypothetical protein  30.47 
 
 		 385 aa  154  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381466  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001931  putative permease protein  29.22 
 
 		 356 aa  152  8e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0257  response regulator receiver domain-containing protein  30.64 
 
 		 357 aa  149  7e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.492639 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0263  protein of unknown function UPF0118  30.31 
 
 		 369 aa  147  4.0000000000000006e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.120153  normal  0.560864 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2995  hypothetical protein  31.23 
 
 		 377 aa  144  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2158  hypothetical protein  27.3 
 
 		 387 aa  133  6e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2143  hypothetical protein  28.12 
 
 		 366 aa  132  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3520  hypothetical protein  30.21 
 
 		 434 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.365519  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0216  hypothetical protein  26.7 
 
 		 369 aa  129  8.000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0246  transport protein  26.7 
 
 		 369 aa  128  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.33291  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02869  transport protein  26.16 
 
 		 338 aa  126  5e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6996  putative permease  28.07 
 
 		 372 aa  124  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1983  protein of unknown function UPF0118  27.98 
 
 		 408 aa  121  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0555  hypothetical protein  27.58 
 
 		 380 aa  120  4.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.11052 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1431  hypothetical protein  28.29 
 
 		 606 aa  119  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.145958  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5963  protein of unknown function UPF0118  29.51 
 
 		 353 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.97133 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4272  hypothetical protein  27.47 
 
 		 374 aa  117  5e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3464  hypothetical protein  27.09 
 
 		 406 aa  116  6e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384592 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4013  protein of unknown function UPF0118  29.28 
 
 		 389 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00579473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1370  hypothetical protein  28.74 
 
 		 367 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.635669 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2927  permease  27.32 
 
 		 365 aa  114  3e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241708  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5076  protein of unknown function UPF0118  23.9 
 
 		 675 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.864281 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1390  hypothetical protein  28.32 
 
 		 368 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1725  protein of unknown function UPF0118  24.87 
 
 		 680 aa  110  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4731  protein of unknown function UPF0118  26.69 
 
 		 649 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0106944 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5020  protein of unknown function UPF0118  23.51 
 
 		 679 aa  108  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247687  normal  0.0740005 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4214  hypothetical protein  27.12 
 
 		 652 aa  108  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0784859  normal  0.378864 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4560  hypothetical protein  23.51 
 
 		 668 aa  108  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.119566 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4584  protein of unknown function UPF0118  26.33 
 
 		 652 aa  107  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.113593  normal  0.096848 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0304  protein of unknown function UPF0118  27.23 
 
 		 650 aa  107  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.10955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4026  hypothetical protein  27.78 
 
 		 374 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23322 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2059  hypothetical protein  24.87 
 
 		 382 aa  103  4e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.295344  normal  0.388769 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6648  putative phytochrome sensor protein  25.81 
 
 		 805 aa  103  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3105  hypothetical protein  26.79 
 
 		 374 aa  102  8e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4370  protein of unknown function UPF0118  27.57 
 
 		 652 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01555  transport protein  30.27 
 
 		 296 aa  100  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5154  hypothetical protein  25.46 
 
 		 663 aa  100  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0413  hypothetical protein  25.13 
 
 		 679 aa  100  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.169508 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6859  protein of unknown function UPF0118  24.42 
 
 		 662 aa  100  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.810171 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2214  hypothetical protein  26.82 
 
 		 374 aa  99.4  9e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0663  protein of unknown function UPF0118  28.37 
 
 		 373 aa  99.4  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.177633 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4116  protein of unknown function UPF0118  26.98 
 
 		 360 aa  98.6  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.614918  normal  0.119486 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4702  protein of unknown function UPF0118  26.85 
 
 		 371 aa  97.8  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.605317  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1892  putative GAF sensor protein  28.2 
 
 		 824 aa  95.9  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.397553 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1696  putative phytochrome sensor protein  28.61 
 
 		 830 aa  95.9  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3553  hypothetical protein  26.29 
 
 		 647 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0625218 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1003  permease  26.97 
 
 		 350 aa  95.5  2e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0492002  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2560  hypothetical protein  25 
 
 		 644 aa  93.6  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2954  hypothetical protein  23.98 
 
 		 444 aa  93.6  5e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0136  protein of unknown function UPF0118  21.64 
 
 		 387 aa  91.3  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.291617  normal  0.459798 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3566  hypothetical protein  25.7 
 
 		 657 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0446712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  28.61 
 
 		 343 aa  91.7  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2379  hypothetical protein  26.43 
 
 		 345 aa  91.3  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2697  transport protein  27.01 
 
 		 371 aa  90.9  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0215163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  23.94 
 
 		 402 aa  90.5  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  23.94 
 
 		 402 aa  90.5  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4144  putative phytochrome sensor protein  26.51 
 
 		 821 aa  90.1  7e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0677009 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6242  hypothetical protein  23.89 
 
 		 659 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.253941  normal  0.568466 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1354  permease  24.86 
 
 		 350 aa  89  1e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  23.31 
 
 		 405 aa  88.2  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1640  transport protein  22.64 
 
 		 336 aa  88.2  2e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2957  hypothetical protein  22.4 
 
 		 366 aa  87.8  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2140  hypothetical protein  23.18 
 
 		 700 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.425167  normal  0.975115 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0006  membrane protein  24.85 
 
 		 362 aa  87.8  3e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2482  hypothetical protein  25.14 
 
 		 662 aa  87.4  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0992  protein of unknown function UPF0118  26.49 
 
 		 396 aa  87.4  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.537691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2909  hypothetical protein  25.37 
 
 		 372 aa  87  5e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1561  putative transport protein  26.32 
 
 		 352 aa  86.7  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.421411  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1709  putative transport protein  26.32 
 
 		 352 aa  86.7  7e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0814358  hitchhiker  0.000224346 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1669  putative transport protein  26.32 
 
 		 352 aa  86.7  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3310  protein of unknown function UPF0118  25.97 
 
 		 354 aa  86.7  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2065  protein of unknown function UPF0118  26.46 
 
 		 358 aa  84.7  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.742659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1742  putative permease PerM  24.02 
 
 		 354 aa  85.1  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1762  hypothetical protein  25.88 
 
 		 329 aa  85.5  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0719  protein of unknown function UPF0118  23.59 
 
 		 370 aa  85.1  0.000000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000137163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2891  hypothetical protein  22.87 
 
 		 394 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0951393  hitchhiker  0.00000885055 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0864  protein of unknown function UPF0118  25.73 
 
 		 388 aa  85.5  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.407336  normal  0.786267 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  25.38 
 
 		 370 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1260  hypothetical protein  24.02 
 
 		 366 aa  84.3  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3090  putative transport protein  28.49 
 
 		 350 aa  84.7  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>