More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1669 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A1709  putative transport protein  100 
 
 		 352 aa  689    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0814358  hitchhiker  0.000224346 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1669  putative transport protein  100 
 
 		 352 aa  689    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1561  putative transport protein  100 
 
 		 352 aa  689    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.421411  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1889  putative transport protein  65.8 
 
 		 350 aa  443  1e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000651778 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1693  putative transport protein  62.06 
 
 		 344 aa  418  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.31551  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1590  putative transport protein  62.06 
 
 		 344 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1860  putative transport protein  62.06 
 
 		 344 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1581  putative transport protein  61.76 
 
 		 344 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.180816 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1649  putative transport protein  62.06 
 
 		 344 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1910  putative transport protein  61.76 
 
 		 344 aa  409  1e-113  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01570  predicted inner membrane protein  60 
 
 		 344 aa  376  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2042  protein of unknown function UPF0118  60 
 
 		 344 aa  376  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.230614  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1598  putative transport protein  59.71 
 
 		 344 aa  375  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1808  putative transport protein  60 
 
 		 344 aa  376  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.791182  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2029  putative transport protein  60 
 
 		 344 aa  376  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.854402  normal  0.642454 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01560  hypothetical protein  60 
 
 		 344 aa  376  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1787  putative transport protein  60 
 
 		 344 aa  376  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.619529  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1675  putative transport protein  59.71 
 
 		 344 aa  373  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2311  putative transport protein  59.71 
 
 		 344 aa  374  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3881  hypothetical protein  49.85 
 
 		 349 aa  333  4e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.198688 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3848  hypothetical protein  48.69 
 
 		 349 aa  330  2e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3758  hypothetical protein  48.69 
 
 		 349 aa  330  3e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3956  hypothetical protein  48.12 
 
 		 349 aa  328  7e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0242  hypothetical protein  48.12 
 
 		 349 aa  328  7e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03323  predicted inner membrane protein  48.12 
 
 		 349 aa  328  8e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0241  protein of unknown function UPF0118  48.12 
 
 		 349 aa  328  8e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03276  hypothetical protein  48.12 
 
 		 349 aa  328  8e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3673  hypothetical protein  48.12 
 
 		 349 aa  328  8e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4794  inner membrane protein YhhT  48.12 
 
 		 349 aa  328  8e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3851  inner membrane protein YhhT  50.44 
 
 		 349 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3894  hypothetical protein  50.15 
 
 		 349 aa  325  8.000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3774  inner membrane protein YhhT  50.15 
 
 		 349 aa  325  8.000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.505829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3784  inner membrane protein YhhT  50.15 
 
 		 349 aa  325  8.000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3954  inner membrane protein YhhT  50.15 
 
 		 349 aa  324  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.835894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2702  hypothetical protein  48.12 
 
 		 369 aa  322  6e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00759105  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1685  protein of unknown function UPF0118  47.83 
 
 		 369 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0357703  normal  0.026776 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2681  hypothetical protein  47.83 
 
 		 369 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.185142  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2778  hypothetical protein  47.83 
 
 		 369 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0204087  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2920  hypothetical protein  47.38 
 
 		 368 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1544  hypothetical protein  46.13 
 
 		 368 aa  317  2e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.173707  normal  0.127911 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1485  hypothetical protein  46.13 
 
 		 368 aa  316  3e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00467252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1550  hypothetical protein  46.13 
 
 		 368 aa  316  3e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0232271  normal  0.172747 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2386  hypothetical protein  47.35 
 
 		 368 aa  315  5e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0461614  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1490  hypothetical protein  47.97 
 
 		 358 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00480126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2360  hypothetical protein  47.81 
 
 		 406 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1700  hypothetical protein  47.21 
 
 		 359 aa  310  2e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.23154  normal  0.0296077 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2557  hypothetical protein  46.63 
 
 		 404 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2891  hypothetical protein  48.47 
 
 		 394 aa  309  4e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0951393  hitchhiker  0.00000885055 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1665  hypothetical protein  48.81 
 
 		 382 aa  309  5e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000108955  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2398  hypothetical protein  48.26 
 
 		 389 aa  308  9e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.17382  normal  0.699282 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2311  hypothetical protein  48.51 
 
 		 354 aa  307  2.0000000000000002e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1354  permease  46.25 
 
 		 350 aa  296  3e-79  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2909  hypothetical protein  46.65 
 
 		 372 aa  293  2e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02299  hypothetical protein  43.11 
 
 		 345 aa  270  2e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.622561  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3314  hypothetical protein  45.29 
 
 		 353 aa  265  7e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2379  hypothetical protein  40.99 
 
 		 345 aa  256  3e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1640  transport protein  41.36 
 
 		 336 aa  235  1.0000000000000001e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3090  putative transport protein  43.54 
 
 		 350 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2065  protein of unknown function UPF0118  39.02 
 
 		 358 aa  228  8e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.742659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2517  hypothetical protein  39.04 
 
 		 361 aa  221  1.9999999999999999e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2430  hypothetical protein  37.75 
 
 		 360 aa  216  5e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2070  hypothetical protein  37.17 
 
 		 348 aa  207  3e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1694  hypothetical protein  37.61 
 
 		 360 aa  198  9e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.258631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0719  protein of unknown function UPF0118  36.39 
 
 		 370 aa  197  3e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000137163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1118  transport protein  37.09 
 
 		 339 aa  189  7e-47  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0123  hypothetical protein  37.95 
 
 		 338 aa  172  1e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0266583  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2437  hypothetical protein  34.92 
 
 		 341 aa  160  2e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.705178  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1134  hypothetical protein  37.16 
 
 		 361 aa  161  2e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.504348  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4853  protein of unknown function UPF0118  34.53 
 
 		 359 aa  159  8e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3065  hypothetical protein  30.61 
 
 		 342 aa  158  1e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.499692  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23200  predicted permease  32.05 
 
 		 398 aa  154  2e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3357  protein of unknown function UPF0118  32.12 
 
 		 358 aa  150  3e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.53694  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1524  protein of unknown function UPF0118  32.28 
 
 		 354 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.740315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5154  hypothetical protein  30.79 
 
 		 663 aa  141  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3035  hypothetical protein  29.74 
 
 		 349 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.124885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4059  protein of unknown function UPF0118  28.61 
 
 		 409 aa  136  6.0000000000000005e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.793351  normal  0.664479 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3067  hypothetical protein  32.14 
 
 		 354 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722131  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6859  protein of unknown function UPF0118  27.92 
 
 		 662 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.810171 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1066  hypothetical protein  30.28 
 
 		 359 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.283585  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6648  putative phytochrome sensor protein  30.5 
 
 		 805 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1194  protein of unknown function UPF0118  30.03 
 
 		 359 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.514771  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1125  protein of unknown function UPF0118  29.46 
 
 		 359 aa  126  5e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19450  predicted permease  29.38 
 
 		 438 aa  125  1e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2560  hypothetical protein  28.27 
 
 		 644 aa  124  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1696  putative phytochrome sensor protein  29.62 
 
 		 830 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1892  putative GAF sensor protein  29.62 
 
 		 824 aa  120  3e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.397553 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0359  hypothetical protein  27.14 
 
 		 350 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.17593  normal  0.0847494 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1291  hypothetical protein  34.6 
 
 		 351 aa  119  7e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0482108  normal  0.0196495 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2014  hypothetical protein  27.98 
 
 		 352 aa  118  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2009  hypothetical protein  27.98 
 
 		 352 aa  118  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0006  membrane protein  27.71 
 
 		 362 aa  119  9.999999999999999e-26  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4918  protein of unknown function UPF0118  29.6 
 
 		 364 aa  118  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1431  hypothetical protein  28.65 
 
 		 606 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.145958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7304  hypothetical protein  30.41 
 
 		 351 aa  116  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2135  protein of unknown function UPF0118  31.16 
 
 		 443 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1025  hypothetical protein  30.75 
 
 		 406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.297957 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2482  hypothetical protein  25.81 
 
 		 662 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1937  permease-like protein  30.72 
 
 		 350 aa  109  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3144  hypothetical protein  26.54 
 
 		 393 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0744058  normal  0.288256 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0172  hypothetical protein  26.89 
 
 		 347 aa  108  1e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000263309  normal  0.0370984 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>