More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_2702 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_2702  hypothetical protein  100 
 
 		 369 aa  734    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00759105  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2920  hypothetical protein  86.45 
 
 		 368 aa  644    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2386  hypothetical protein  88.08 
 
 		 368 aa  650    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0461614  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2778  hypothetical protein  99.19 
 
 		 369 aa  728    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0204087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1685  protein of unknown function UPF0118  99.19 
 
 		 369 aa  728    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0357703  normal  0.026776 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1485  hypothetical protein  88.08 
 
 		 368 aa  654    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00467252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1550  hypothetical protein  88.08 
 
 		 368 aa  654    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0232271  normal  0.172747 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1544  hypothetical protein  88.08 
 
 		 368 aa  654    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.173707  normal  0.127911 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2681  hypothetical protein  99.19 
 
 		 369 aa  728    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.185142  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2557  hypothetical protein  84.35 
 
 		 404 aa  587  1e-166  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1490  hypothetical protein  83.48 
 
 		 358 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00480126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2891  hypothetical protein  80.81 
 
 		 394 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0951393  hitchhiker  0.00000885055 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2360  hypothetical protein  77.15 
 
 		 406 aa  570  1e-161  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1700  hypothetical protein  76.75 
 
 		 359 aa  566  1e-160  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.23154  normal  0.0296077 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1665  hypothetical protein  73.67 
 
 		 382 aa  556  1e-157  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000108955  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2398  hypothetical protein  76.99 
 
 		 389 aa  545  1e-154  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.17382  normal  0.699282 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2909  hypothetical protein  56.75 
 
 		 372 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2311  hypothetical protein  57.7 
 
 		 354 aa  406  1.0000000000000001e-112  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02299  hypothetical protein  60.49 
 
 		 345 aa  400  9.999999999999999e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.622561  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3314  hypothetical protein  51.7 
 
 		 353 aa  356  2.9999999999999997e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2379  hypothetical protein  48.2 
 
 		 345 aa  316  4e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1709  putative transport protein  48.12 
 
 		 352 aa  309  5.9999999999999995e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0814358  hitchhiker  0.000224346 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1561  putative transport protein  48.12 
 
 		 352 aa  309  5.9999999999999995e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.421411  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1669  putative transport protein  48.12 
 
 		 352 aa  309  5.9999999999999995e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1889  putative transport protein  49.85 
 
 		 350 aa  303  3.0000000000000004e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000651778 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1693  putative transport protein  45 
 
 		 344 aa  286  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.31551  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1590  putative transport protein  45 
 
 		 344 aa  286  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1860  putative transport protein  45 
 
 		 344 aa  286  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1649  putative transport protein  45 
 
 		 344 aa  286  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1581  putative transport protein  45 
 
 		 344 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.180816 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1354  permease  45.05 
 
 		 350 aa  278  1e-73  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1910  putative transport protein  44.12 
 
 		 344 aa  277  3e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3090  putative transport protein  48.06 
 
 		 350 aa  272  6e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3881  hypothetical protein  41.98 
 
 		 349 aa  259  6e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.198688 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1598  putative transport protein  46.6 
 
 		 344 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01570  predicted inner membrane protein  46.3 
 
 		 344 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2042  protein of unknown function UPF0118  46.3 
 
 		 344 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.230614  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2029  putative transport protein  46.3 
 
 		 344 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.854402  normal  0.642454 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01560  hypothetical protein  46.3 
 
 		 344 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1787  putative transport protein  46.3 
 
 		 344 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.619529  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2311  putative transport protein  46.3 
 
 		 344 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1808  putative transport protein  45.99 
 
 		 344 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.791182  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2517  hypothetical protein  44.25 
 
 		 361 aa  252  6e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03323  predicted inner membrane protein  39.64 
 
 		 349 aa  252  8.000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0241  protein of unknown function UPF0118  39.64 
 
 		 349 aa  252  8.000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03276  hypothetical protein  39.64 
 
 		 349 aa  252  8.000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0242  hypothetical protein  39.64 
 
 		 349 aa  252  8.000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4794  inner membrane protein YhhT  39.64 
 
 		 349 aa  252  8.000000000000001e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3848  hypothetical protein  39.64 
 
 		 349 aa  252  8.000000000000001e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3956  hypothetical protein  39.64 
 
 		 349 aa  252  8.000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3673  hypothetical protein  39.64 
 
 		 349 aa  252  8.000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3758  hypothetical protein  39.64 
 
 		 349 aa  251  1e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3851  inner membrane protein YhhT  41.93 
 
 		 349 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1675  putative transport protein  45.99 
 
 		 344 aa  251  1e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3784  inner membrane protein YhhT  41.61 
 
 		 349 aa  249  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3774  inner membrane protein YhhT  41.61 
 
 		 349 aa  249  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.505829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3894  hypothetical protein  41.61 
 
 		 349 aa  249  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3954  inner membrane protein YhhT  41.61 
 
 		 349 aa  247  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.835894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2065  protein of unknown function UPF0118  43.07 
 
 		 358 aa  243  3.9999999999999997e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.742659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1694  hypothetical protein  43.11 
 
 		 360 aa  242  7.999999999999999e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.258631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2430  hypothetical protein  41.84 
 
 		 360 aa  233  5e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1640  transport protein  41.05 
 
 		 336 aa  229  6e-59  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2070  hypothetical protein  37.84 
 
 		 348 aa  215  9.999999999999999e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1118  transport protein  35 
 
 		 339 aa  215  9.999999999999999e-55  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2437  hypothetical protein  36 
 
 		 341 aa  195  1e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.705178  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1134  hypothetical protein  40.54 
 
 		 361 aa  195  1e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.504348  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0123  hypothetical protein  38.44 
 
 		 338 aa  191  2e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0266583  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4853  protein of unknown function UPF0118  35.62 
 
 		 359 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0719  protein of unknown function UPF0118  33.92 
 
 		 370 aa  179  5.999999999999999e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000137163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3065  hypothetical protein  33.13 
 
 		 342 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.499692  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4059  protein of unknown function UPF0118  31.16 
 
 		 409 aa  159  6e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.793351  normal  0.664479 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3035  hypothetical protein  32.63 
 
 		 349 aa  158  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.124885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1524  protein of unknown function UPF0118  31.69 
 
 		 354 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.740315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3067  hypothetical protein  31.58 
 
 		 354 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722131  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23200  predicted permease  27.59 
 
 		 398 aa  134  1.9999999999999998e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4918  protein of unknown function UPF0118  26.8 
 
 		 364 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0907  hypothetical protein  28.17 
 
 		 362 aa  130  3e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0785187  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0359  hypothetical protein  31.33 
 
 		 350 aa  130  3e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.17593  normal  0.0847494 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0006  membrane protein  29.46 
 
 		 362 aa  129  9.000000000000001e-29  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3357  protein of unknown function UPF0118  28.53 
 
 		 358 aa  127  4.0000000000000003e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.53694  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1937  permease-like protein  27.36 
 
 		 350 aa  126  8.000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5154  hypothetical protein  25.13 
 
 		 663 aa  124  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1025  hypothetical protein  29.14 
 
 		 406 aa  124  4e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.297957 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1291  hypothetical protein  29.28 
 
 		 351 aa  121  1.9999999999999998e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0482108  normal  0.0196495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7304  hypothetical protein  27.56 
 
 		 351 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3659  hypothetical protein  30.52 
 
 		 390 aa  113  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0638108 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5344  hypothetical protein  24.93 
 
 		 647 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0275026 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19450  predicted permease  27.45 
 
 		 438 aa  110  3e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1233  membrane transporter  25.27 
 
 		 650 aa  109  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0210631  normal  0.375468 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_2996  hypothetical protein  30.43 
 
 		 414 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.229433 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2014  hypothetical protein  30.15 
 
 		 352 aa  109  9.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2009  hypothetical protein  30.15 
 
 		 352 aa  109  9.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1066  hypothetical protein  27.5 
 
 		 359 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.283585  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5076  protein of unknown function UPF0118  23.35 
 
 		 675 aa  107  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.864281 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3345  hypothetical protein  29.22 
 
 		 432 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001931  putative permease protein  24.44 
 
 		 356 aa  107  4e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4560  hypothetical protein  24.15 
 
 		 668 aa  106  6e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.119566 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5379  protein of unknown function UPF0118  24.73 
 
 		 650 aa  106  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.613329  normal  0.237029 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5020  protein of unknown function UPF0118  24.15 
 
 		 679 aa  106  8e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247687  normal  0.0740005 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6859  protein of unknown function UPF0118  25.98 
 
 		 662 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.810171 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>