More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_3090 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_3090  putative transport protein  100 
 
 		 350 aa  672    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2909  hypothetical protein  52.89 
 
 		 372 aa  311  9e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2557  hypothetical protein  46.44 
 
 		 404 aa  309  4e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02299  hypothetical protein  49.41 
 
 		 345 aa  306  5.0000000000000004e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.622561  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2920  hypothetical protein  49.11 
 
 		 368 aa  302  6.000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1544  hypothetical protein  49.11 
 
 		 368 aa  301  2e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.173707  normal  0.127911 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1485  hypothetical protein  49.11 
 
 		 368 aa  299  4e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00467252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1550  hypothetical protein  49.11 
 
 		 368 aa  299  4e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0232271  normal  0.172747 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2360  hypothetical protein  47.63 
 
 		 406 aa  297  2e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1490  hypothetical protein  46.61 
 
 		 358 aa  296  5e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00480126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2702  hypothetical protein  48.06 
 
 		 369 aa  295  9e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00759105  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2681  hypothetical protein  47.76 
 
 		 369 aa  293  2e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.185142  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2311  hypothetical protein  45.69 
 
 		 354 aa  294  2e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2778  hypothetical protein  47.76 
 
 		 369 aa  294  2e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0204087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1685  protein of unknown function UPF0118  47.76 
 
 		 369 aa  293  2e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0357703  normal  0.026776 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2386  hypothetical protein  47.01 
 
 		 368 aa  293  3e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0461614  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2379  hypothetical protein  50 
 
 		 345 aa  291  1e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1665  hypothetical protein  48.47 
 
 		 382 aa  290  3e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000108955  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2517  hypothetical protein  46.85 
 
 		 361 aa  290  3e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2430  hypothetical protein  45.58 
 
 		 360 aa  287  2e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2891  hypothetical protein  47.38 
 
 		 394 aa  286  4e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0951393  hitchhiker  0.00000885055 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2065  protein of unknown function UPF0118  49.39 
 
 		 358 aa  285  8e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.742659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2398  hypothetical protein  48.62 
 
 		 389 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.17382  normal  0.699282 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1700  hypothetical protein  46.18 
 
 		 359 aa  282  7.000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.23154  normal  0.0296077 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3314  hypothetical protein  48.21 
 
 		 353 aa  273  3e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1693  putative transport protein  43.6 
 
 		 344 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.31551  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1649  putative transport protein  43.6 
 
 		 344 aa  250  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1590  putative transport protein  43.6 
 
 		 344 aa  250  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1860  putative transport protein  43.6 
 
 		 344 aa  250  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1581  putative transport protein  43.6 
 
 		 344 aa  249  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.180816 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1354  permease  39.83 
 
 		 350 aa  249  7e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1889  putative transport protein  43.92 
 
 		 350 aa  247  2e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000651778 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1561  putative transport protein  43.54 
 
 		 352 aa  242  7.999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.421411  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1709  putative transport protein  43.54 
 
 		 352 aa  242  7.999999999999999e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0814358  hitchhiker  0.000224346 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1669  putative transport protein  43.54 
 
 		 352 aa  242  7.999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1910  putative transport protein  42.99 
 
 		 344 aa  240  2e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3881  hypothetical protein  41.95 
 
 		 349 aa  237  2e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.198688 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2070  hypothetical protein  43.52 
 
 		 348 aa  235  7e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1694  hypothetical protein  42.18 
 
 		 360 aa  233  5e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.258631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3851  inner membrane protein YhhT  42.86 
 
 		 349 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3956  hypothetical protein  40.73 
 
 		 349 aa  229  4e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3848  hypothetical protein  40.73 
 
 		 349 aa  229  4e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0242  hypothetical protein  40.73 
 
 		 349 aa  229  4e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03323  predicted inner membrane protein  40.73 
 
 		 349 aa  229  5e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0241  protein of unknown function UPF0118  40.73 
 
 		 349 aa  229  5e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03276  hypothetical protein  40.73 
 
 		 349 aa  229  5e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3758  hypothetical protein  40.73 
 
 		 349 aa  229  5e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3673  hypothetical protein  40.73 
 
 		 349 aa  229  5e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4794  inner membrane protein YhhT  40.73 
 
 		 349 aa  229  5e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3784  inner membrane protein YhhT  42.55 
 
 		 349 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3894  hypothetical protein  42.55 
 
 		 349 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3774  inner membrane protein YhhT  42.55 
 
 		 349 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.505829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3954  inner membrane protein YhhT  42.25 
 
 		 349 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.835894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2311  putative transport protein  43.6 
 
 		 344 aa  224  1e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01570  predicted inner membrane protein  43.6 
 
 		 344 aa  223  3e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2042  protein of unknown function UPF0118  43.6 
 
 		 344 aa  223  3e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.230614  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2029  putative transport protein  43.6 
 
 		 344 aa  223  3e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.854402  normal  0.642454 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01560  hypothetical protein  43.6 
 
 		 344 aa  223  3e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1787  putative transport protein  43.6 
 
 		 344 aa  223  3e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.619529  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1808  putative transport protein  43.6 
 
 		 344 aa  223  4e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.791182  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1598  putative transport protein  43.29 
 
 		 344 aa  222  6e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1675  putative transport protein  43.29 
 
 		 344 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1640  transport protein  38.15 
 
 		 336 aa  216  2.9999999999999998e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4853  protein of unknown function UPF0118  37.35 
 
 		 359 aa  215  8e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1134  hypothetical protein  42.99 
 
 		 361 aa  191  2e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.504348  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1524  protein of unknown function UPF0118  37.35 
 
 		 354 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.740315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2437  hypothetical protein  36.04 
 
 		 341 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.705178  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0719  protein of unknown function UPF0118  35.59 
 
 		 370 aa  182  6e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000137163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1118  transport protein  35 
 
 		 339 aa  176  6e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3065  hypothetical protein  31.66 
 
 		 342 aa  176  8e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.499692  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0123  hypothetical protein  36.62 
 
 		 338 aa  166  5e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0266583  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3035  hypothetical protein  32.02 
 
 		 349 aa  161  1e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.124885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3067  hypothetical protein  31.99 
 
 		 354 aa  155  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722131  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3357  protein of unknown function UPF0118  30.65 
 
 		 358 aa  151  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.53694  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0359  hypothetical protein  30.7 
 
 		 350 aa  144  3e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.17593  normal  0.0847494 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4059  protein of unknown function UPF0118  30 
 
 		 409 aa  143  4e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.793351  normal  0.664479 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19450  predicted permease  33.04 
 
 		 438 aa  142  7e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0907  hypothetical protein  33.57 
 
 		 362 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0785187  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23200  predicted permease  30.11 
 
 		 398 aa  138  2e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1025  hypothetical protein  32.63 
 
 		 406 aa  126  6e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.297957 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1291  hypothetical protein  34.01 
 
 		 351 aa  124  2e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0482108  normal  0.0196495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1937  permease-like protein  29.91 
 
 		 350 aa  123  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7304  hypothetical protein  31.82 
 
 		 351 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5154  hypothetical protein  30.9 
 
 		 663 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2560  hypothetical protein  27.89 
 
 		 644 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5344  hypothetical protein  30.38 
 
 		 647 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0275026 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2014  hypothetical protein  27.81 
 
 		 352 aa  114  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2009  hypothetical protein  27.81 
 
 		 352 aa  114  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4918  protein of unknown function UPF0118  31.02 
 
 		 364 aa  113  5e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0006  membrane protein  26.07 
 
 		 362 aa  112  7.000000000000001e-24  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6859  protein of unknown function UPF0118  28.87 
 
 		 662 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.810171 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1125  protein of unknown function UPF0118  31.67 
 
 		 359 aa  110  5e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1020  hypothetical protein  29.93 
 
 		 344 aa  109  6e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1194  protein of unknown function UPF0118  31.5 
 
 		 359 aa  109  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.514771  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0793  hypothetical protein  28.18 
 
 		 348 aa  108  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.414272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3669  hypothetical protein  28.77 
 
 		 390 aa  108  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1150  hypothetical membrane spanning protein  29.93 
 
 		 376 aa  108  2e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3145  hypothetical protein  27.64 
 
 		 660 aa  104  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.44353  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3196  hypothetical protein  27.64 
 
 		 660 aa  104  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5234  hypothetical protein  29.96 
 
 		 362 aa  104  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>