More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2135 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2135  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 		 443 aa  840    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3357  protein of unknown function UPF0118  48.5 
 
 		 358 aa  311  1e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.53694  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4059  protein of unknown function UPF0118  40.22 
 
 		 409 aa  283  4.0000000000000003e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.793351  normal  0.664479 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19450  predicted permease  39.95 
 
 		 438 aa  246  4e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1937  permease-like protein  46.88 
 
 		 350 aa  245  9e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7304  hypothetical protein  46.65 
 
 		 351 aa  241  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23200  predicted permease  40.8 
 
 		 398 aa  231  2e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4918  protein of unknown function UPF0118  40.44 
 
 		 364 aa  228  2e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1025  hypothetical protein  46.49 
 
 		 406 aa  225  1e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.297957 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1524  protein of unknown function UPF0118  32.29 
 
 		 354 aa  167  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.740315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4853  protein of unknown function UPF0118  31.89 
 
 		 359 aa  159  7e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3314  hypothetical protein  30.65 
 
 		 353 aa  157  4e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02299  hypothetical protein  31.44 
 
 		 345 aa  151  3e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.622561  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2557  hypothetical protein  29.12 
 
 		 404 aa  151  3e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1665  hypothetical protein  30.14 
 
 		 382 aa  150  4e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000108955  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1561  putative transport protein  31.63 
 
 		 352 aa  147  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.421411  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1669  putative transport protein  31.63 
 
 		 352 aa  147  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1709  putative transport protein  31.63 
 
 		 352 aa  147  4.0000000000000006e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0814358  hitchhiker  0.000224346 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2379  hypothetical protein  28.18 
 
 		 345 aa  144  4e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412006  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2920  hypothetical protein  28.12 
 
 		 368 aa  143  7e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1544  hypothetical protein  28.36 
 
 		 368 aa  143  7e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.173707  normal  0.127911 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2702  hypothetical protein  28.2 
 
 		 369 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00759105  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1485  hypothetical protein  28.07 
 
 		 368 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00467252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1550  hypothetical protein  28.07 
 
 		 368 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0232271  normal  0.172747 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2778  hypothetical protein  27.81 
 
 		 369 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0204087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1685  protein of unknown function UPF0118  27.91 
 
 		 369 aa  140  7e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0357703  normal  0.026776 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2681  hypothetical protein  27.91 
 
 		 369 aa  140  7e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.185142  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3881  hypothetical protein  31.01 
 
 		 349 aa  139  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.198688 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2386  hypothetical protein  29.18 
 
 		 368 aa  139  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0461614  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1490  hypothetical protein  29.48 
 
 		 358 aa  139  1e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00480126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2891  hypothetical protein  30.09 
 
 		 394 aa  138  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0951393  hitchhiker  0.00000885055 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1889  putative transport protein  34 
 
 		 350 aa  137  5e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000651778 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2360  hypothetical protein  28.1 
 
 		 406 aa  137  5e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2909  hypothetical protein  28.37 
 
 		 372 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2311  hypothetical protein  28.99 
 
 		 354 aa  135  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1581  putative transport protein  32.03 
 
 		 344 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.180816 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1693  putative transport protein  32.03 
 
 		 344 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.31551  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3851  inner membrane protein YhhT  32.21 
 
 		 349 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1590  putative transport protein  32.03 
 
 		 344 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1700  hypothetical protein  29.18 
 
 		 359 aa  134  3e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.23154  normal  0.0296077 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1649  putative transport protein  32.03 
 
 		 344 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1860  putative transport protein  32.03 
 
 		 344 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1694  hypothetical protein  29.25 
 
 		 360 aa  134  3.9999999999999996e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.258631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2517  hypothetical protein  32.63 
 
 		 361 aa  133  6e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2065  protein of unknown function UPF0118  31.91 
 
 		 358 aa  133  7.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.742659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3954  inner membrane protein YhhT  32.21 
 
 		 349 aa  133  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.835894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3784  inner membrane protein YhhT  31.9 
 
 		 349 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3774  inner membrane protein YhhT  31.9 
 
 		 349 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.505829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3894  hypothetical protein  31.9 
 
 		 349 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2398  hypothetical protein  28.25 
 
 		 389 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.17382  normal  0.699282 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3758  hypothetical protein  29.21 
 
 		 349 aa  131  3e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3848  hypothetical protein  29.21 
 
 		 349 aa  130  6e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3956  hypothetical protein  28.89 
 
 		 349 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0242  hypothetical protein  28.89 
 
 		 349 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03323  predicted inner membrane protein  28.89 
 
 		 349 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0241  protein of unknown function UPF0118  28.89 
 
 		 349 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4794  inner membrane protein YhhT  28.89 
 
 		 349 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3673  hypothetical protein  28.89 
 
 		 349 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03276  hypothetical protein  28.89 
 
 		 349 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1910  putative transport protein  30.06 
 
 		 344 aa  126  7e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1640  transport protein  27.11 
 
 		 336 aa  126  8.000000000000001e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2430  hypothetical protein  31.76 
 
 		 360 aa  125  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1118  transport protein  27.11 
 
 		 339 aa  125  2e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2070  hypothetical protein  29.1 
 
 		 348 aa  124  4e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0359  hypothetical protein  28.74 
 
 		 350 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.17593  normal  0.0847494 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1354  permease  25.15 
 
 		 350 aa  119  9.999999999999999e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3067  hypothetical protein  28.44 
 
 		 354 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722131  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0123  hypothetical protein  27.98 
 
 		 338 aa  111  2.0000000000000002e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0266583  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3065  hypothetical protein  26.33 
 
 		 342 aa  110  5e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.499692  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3090  putative transport protein  29.88 
 
 		 350 aa  109  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2311  putative transport protein  31.29 
 
 		 344 aa  107  4e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01570  predicted inner membrane protein  31.29 
 
 		 344 aa  107  5e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2042  protein of unknown function UPF0118  31.29 
 
 		 344 aa  107  5e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.230614  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1808  putative transport protein  31.29 
 
 		 344 aa  107  5e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.791182  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2029  putative transport protein  31.29 
 
 		 344 aa  107  5e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.854402  normal  0.642454 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01560  hypothetical protein  31.29 
 
 		 344 aa  107  5e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1787  putative transport protein  31.29 
 
 		 344 aa  107  5e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.619529  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1598  putative transport protein  30.97 
 
 		 344 aa  106  9e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1134  hypothetical protein  26.47 
 
 		 361 aa  104  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.504348  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1675  putative transport protein  30.97 
 
 		 344 aa  104  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2437  hypothetical protein  31.25 
 
 		 341 aa  102  9e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.705178  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4788  hypothetical protein  28.03 
 
 		 373 aa  100  6e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5020  protein of unknown function UPF0118  27.72 
 
 		 679 aa  99.8  9e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247687  normal  0.0740005 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4560  hypothetical protein  27.72 
 
 		 668 aa  99.8  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.119566 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3035  hypothetical protein  26.51 
 
 		 349 aa  97.1  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.124885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5076  protein of unknown function UPF0118  33.49 
 
 		 675 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.864281 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6859  protein of unknown function UPF0118  26.5 
 
 		 662 aa  89.7  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.810171 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0304  protein of unknown function UPF0118  27.78 
 
 		 650 aa  89.7  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.10955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0719  protein of unknown function UPF0118  23.77 
 
 		 370 aa  87.8  3e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000137163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0907  hypothetical protein  26.56 
 
 		 362 aa  85.9  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0785187  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2995  hypothetical protein  28.46 
 
 		 377 aa  82.4  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1194  protein of unknown function UPF0118  30.56 
 
 		 359 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.514771  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4013  protein of unknown function UPF0118  27.86 
 
 		 389 aa  82  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00579473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3908  hypothetical protein  28.21 
 
 		 383 aa  81.3  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1066  hypothetical protein  30.23 
 
 		 359 aa  81.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.283585  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6648  putative phytochrome sensor protein  27.35 
 
 		 805 aa  81.6  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1125  protein of unknown function UPF0118  30.56 
 
 		 359 aa  80.9  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2140  hypothetical protein  29.95 
 
 		 700 aa  80.9  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.425167  normal  0.975115 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2075  hypothetical protein  26.2 
 
 		 385 aa  80.5  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381466  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2158  protein of unknown function UPF0118  33.33 
 
 		 653 aa  79.3  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>