More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0907 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0907  hypothetical protein  100 
 
 		 362 aa  712    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0785187  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1291  hypothetical protein  52.75 
 
 		 351 aa  332  8e-90  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0482108  normal  0.0196495 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3065  hypothetical protein  32 
 
 		 342 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.499692  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2437  hypothetical protein  37.46 
 
 		 341 aa  158  2e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.705178  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3067  hypothetical protein  33.84 
 
 		 354 aa  157  3e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722131  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3035  hypothetical protein  30.61 
 
 		 349 aa  153  4e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.124885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3314  hypothetical protein  29.78 
 
 		 353 aa  152  1e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2360  hypothetical protein  30 
 
 		 406 aa  147  3e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1485  hypothetical protein  29.39 
 
 		 368 aa  144  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00467252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1550  hypothetical protein  29.39 
 
 		 368 aa  144  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0232271  normal  0.172747 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1544  hypothetical protein  29.8 
 
 		 368 aa  144  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.173707  normal  0.127911 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2065  protein of unknown function UPF0118  27.46 
 
 		 358 aa  141  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.742659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2379  hypothetical protein  25.89 
 
 		 345 aa  140  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412006  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2920  hypothetical protein  28.53 
 
 		 368 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2778  hypothetical protein  28.32 
 
 		 369 aa  136  4e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0204087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2386  hypothetical protein  28.61 
 
 		 368 aa  137  4e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0461614  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2398  hypothetical protein  29.23 
 
 		 389 aa  137  4e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.17382  normal  0.699282 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1685  protein of unknown function UPF0118  28.36 
 
 		 369 aa  136  5e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0357703  normal  0.026776 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2681  hypothetical protein  28.36 
 
 		 369 aa  136  5e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.185142  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1665  hypothetical protein  26.99 
 
 		 382 aa  136  5e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000108955  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2702  hypothetical protein  28.36 
 
 		 369 aa  136  5e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00759105  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1700  hypothetical protein  26.69 
 
 		 359 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.23154  normal  0.0296077 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2557  hypothetical protein  28.15 
 
 		 404 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2517  hypothetical protein  29.82 
 
 		 361 aa  132  6.999999999999999e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02299  hypothetical protein  27.99 
 
 		 345 aa  132  7.999999999999999e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.622561  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2891  hypothetical protein  27.87 
 
 		 394 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0951393  hitchhiker  0.00000885055 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2909  hypothetical protein  27.2 
 
 		 372 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0359  hypothetical protein  31.37 
 
 		 350 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.17593  normal  0.0847494 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1490  hypothetical protein  28.36 
 
 		 358 aa  129  6e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00480126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3090  putative transport protein  31.83 
 
 		 350 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1581  putative transport protein  29.69 
 
 		 344 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.180816 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2311  hypothetical protein  28.22 
 
 		 354 aa  127  3e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1693  putative transport protein  29.38 
 
 		 344 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.31551  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1860  putative transport protein  29.38 
 
 		 344 aa  126  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1649  putative transport protein  29.38 
 
 		 344 aa  126  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1590  putative transport protein  29.38 
 
 		 344 aa  126  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1354  permease  28.34 
 
 		 350 aa  125  1e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1910  putative transport protein  29.25 
 
 		 344 aa  123  5e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1694  hypothetical protein  27.47 
 
 		 360 aa  122  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.258631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1889  putative transport protein  25.95 
 
 		 350 aa  120  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000651778 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0719  protein of unknown function UPF0118  27.79 
 
 		 370 aa  120  3e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000137163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1524  protein of unknown function UPF0118  27.48 
 
 		 354 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.740315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2430  hypothetical protein  28.7 
 
 		 360 aa  118  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1669  putative transport protein  27.71 
 
 		 352 aa  117  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1709  putative transport protein  27.71 
 
 		 352 aa  117  3e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0814358  hitchhiker  0.000224346 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1561  putative transport protein  27.71 
 
 		 352 aa  117  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.421411  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0242  hypothetical protein  25.87 
 
 		 349 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3956  hypothetical protein  25.87 
 
 		 349 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3758  hypothetical protein  25.58 
 
 		 349 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03323  predicted inner membrane protein  25.58 
 
 		 349 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0241  protein of unknown function UPF0118  25.58 
 
 		 349 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03276  hypothetical protein  25.58 
 
 		 349 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4794  inner membrane protein YhhT  25.58 
 
 		 349 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3848  hypothetical protein  25.58 
 
 		 349 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3673  hypothetical protein  25.58 
 
 		 349 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2311  putative transport protein  29.38 
 
 		 344 aa  114  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4853  protein of unknown function UPF0118  27.84 
 
 		 359 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01570  predicted inner membrane protein  29.38 
 
 		 344 aa  113  5e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2042  protein of unknown function UPF0118  29.38 
 
 		 344 aa  113  5e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.230614  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2029  putative transport protein  29.38 
 
 		 344 aa  113  5e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.854402  normal  0.642454 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1787  putative transport protein  29.38 
 
 		 344 aa  113  5e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.619529  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01560  hypothetical protein  29.38 
 
 		 344 aa  113  5e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1808  putative transport protein  29.38 
 
 		 344 aa  113  5e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.791182  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3881  hypothetical protein  25.3 
 
 		 349 aa  113  7.000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.198688 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1598  putative transport protein  29.38 
 
 		 344 aa  112  9e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1675  putative transport protein  29.06 
 
 		 344 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2070  hypothetical protein  28.67 
 
 		 348 aa  105  1e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3851  inner membrane protein YhhT  25.53 
 
 		 349 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3954  inner membrane protein YhhT  25.53 
 
 		 349 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.835894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3894  hypothetical protein  25.23 
 
 		 349 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3774  inner membrane protein YhhT  25.23 
 
 		 349 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.505829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3784  inner membrane protein YhhT  25.23 
 
 		 349 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1134  hypothetical protein  26.01 
 
 		 361 aa  100  4e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.504348  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4059  protein of unknown function UPF0118  26.18 
 
 		 409 aa  100  6e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.793351  normal  0.664479 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19450  predicted permease  26.96 
 
 		 438 aa  97.4  3e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7304  hypothetical protein  29.64 
 
 		 351 aa  95.5  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3357  protein of unknown function UPF0118  25.36 
 
 		 358 aa  94.7  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.53694  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23200  predicted permease  25.07 
 
 		 398 aa  94.4  3e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1118  transport protein  23.42 
 
 		 339 aa  91.7  2e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1640  transport protein  27.19 
 
 		 336 aa  87  4e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4918  protein of unknown function UPF0118  25.22 
 
 		 364 aa  83.6  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1364  protein of unknown function UPF0118  25.97 
 
 		 420 aa  82  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1025  hypothetical protein  27.1 
 
 		 406 aa  82  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.297957 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0123  hypothetical protein  27.53 
 
 		 338 aa  80.9  0.00000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0266583  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2560  hypothetical protein  28.95 
 
 		 644 aa  80.9  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6859  protein of unknown function UPF0118  23.17 
 
 		 662 aa  80.1  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.810171 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2135  protein of unknown function UPF0118  24.21 
 
 		 443 aa  77.8  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1704  hypothetical protein  27 
 
 		 650 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.61682 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1233  membrane transporter  28.16 
 
 		 650 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0210631  normal  0.375468 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5344  hypothetical protein  29.41 
 
 		 647 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0275026 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1044  protein of unknown function UPF0118  23.81 
 
 		 345 aa  77.4  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.157129 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5379  protein of unknown function UPF0118  28.57 
 
 		 650 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.613329  normal  0.237029 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1194  protein of unknown function UPF0118  25.71 
 
 		 359 aa  77  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.514771  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1937  permease-like protein  25.36 
 
 		 350 aa  76.6  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3464  hypothetical protein  25.85 
 
 		 406 aa  76.3  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384592 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3145  hypothetical protein  28.77 
 
 		 660 aa  76.3  0.0000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.44353  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3196  hypothetical protein  28.77 
 
 		 660 aa  76.3  0.0000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1125  protein of unknown function UPF0118  25.71 
 
 		 359 aa  75.9  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5154  hypothetical protein  30.93 
 
 		 663 aa  75.9  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1066  hypothetical protein  25.24 
 
 		 359 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.283585  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>