More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5344 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_5344  hypothetical protein  100 
 
 		 647 aa  1280    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0275026 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1233  membrane transporter  67.66 
 
 		 650 aa  839    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0210631  normal  0.375468 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5379  protein of unknown function UPF0118  67.45 
 
 		 650 aa  825    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.613329  normal  0.237029 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1704  hypothetical protein  54.01 
 
 		 650 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.61682 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5287  protein of unknown function UPF0118  47.13 
 
 		 677 aa  523  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0304  protein of unknown function UPF0118  45.28 
 
 		 650 aa  522  1e-147  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.10955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1324  membrane transporter  46.57 
 
 		 680 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.542629  normal  0.0320057 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6242  hypothetical protein  45.32 
 
 		 659 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.253941  normal  0.568466 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5020  protein of unknown function UPF0118  44.63 
 
 		 679 aa  492  1e-137  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247687  normal  0.0740005 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4560  hypothetical protein  44.63 
 
 		 668 aa  491  1e-137  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.119566 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5076  protein of unknown function UPF0118  44.93 
 
 		 675 aa  488  1e-136  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.864281 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1060  hypothetical protein  46.82 
 
 		 645 aa  482  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1725  protein of unknown function UPF0118  43.93 
 
 		 680 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3812  hypothetical protein  44.55 
 
 		 651 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3196  hypothetical protein  44.39 
 
 		 660 aa  468  9.999999999999999e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0209  protein of unknown function UPF0118  44.13 
 
 		 651 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3145  hypothetical protein  44.39 
 
 		 660 aa  468  9.999999999999999e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.44353  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0413  hypothetical protein  46.42 
 
 		 679 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.169508 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2482  hypothetical protein  41.75 
 
 		 662 aa  440  9.999999999999999e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2910  hypothetical protein  40.72 
 
 		 660 aa  435  1e-120  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.381639  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2158  protein of unknown function UPF0118  41.46 
 
 		 653 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2140  hypothetical protein  43.8 
 
 		 700 aa  419  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.425167  normal  0.975115 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4370  protein of unknown function UPF0118  39.69 
 
 		 652 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4731  protein of unknown function UPF0118  39.75 
 
 		 649 aa  405  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0106944 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4214  hypothetical protein  41.14 
 
 		 652 aa  397  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0784859  normal  0.378864 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4584  protein of unknown function UPF0118  41.14 
 
 		 652 aa  397  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.113593  normal  0.096848 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3566  hypothetical protein  43.03 
 
 		 657 aa  394  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0446712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3553  hypothetical protein  41.86 
 
 		 647 aa  390  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0625218 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1866  hypothetical protein  41.97 
 
 		 689 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1431  hypothetical protein  39.66 
 
 		 606 aa  386  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.145958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6648  putative phytochrome sensor protein  40.22 
 
 		 805 aa  379  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5154  hypothetical protein  37.86 
 
 		 663 aa  379  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6859  protein of unknown function UPF0118  36.99 
 
 		 662 aa  369  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.810171 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2560  hypothetical protein  38.22 
 
 		 644 aa  360  4e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1892  putative GAF sensor protein  38.32 
 
 		 824 aa  346  7e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.397553 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1696  putative phytochrome sensor protein  38.15 
 
 		 830 aa  345  1e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4144  putative phytochrome sensor protein  35.02 
 
 		 821 aa  311  2e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0677009 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4144  putative GAF sensor protein  34.84 
 
 		 801 aa  308  2.0000000000000002e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3882  putative GAF sensor protein  34.17 
 
 		 782 aa  299  9e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3382  putative phytochrome sensor protein  35.65 
 
 		 879 aa  231  4e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164288 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2891  hypothetical protein  27.22 
 
 		 394 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0951393  hitchhiker  0.00000885055 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1490  hypothetical protein  25.07 
 
 		 358 aa  117  8.999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00480126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1700  hypothetical protein  26.32 
 
 		 359 aa  114  7.000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.23154  normal  0.0296077 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2920  hypothetical protein  25.28 
 
 		 368 aa  114  7.000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1485  hypothetical protein  25.56 
 
 		 368 aa  114  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00467252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1550  hypothetical protein  25.56 
 
 		 368 aa  114  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0232271  normal  0.172747 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2557  hypothetical protein  25.55 
 
 		 404 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1544  hypothetical protein  25.28 
 
 		 368 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.173707  normal  0.127911 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2681  hypothetical protein  24.93 
 
 		 369 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.185142  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2702  hypothetical protein  24.93 
 
 		 369 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00759105  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2778  hypothetical protein  25 
 
 		 369 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0204087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1685  protein of unknown function UPF0118  24.93 
 
 		 369 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0357703  normal  0.026776 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2386  hypothetical protein  24.17 
 
 		 368 aa  110  6e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0461614  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2065  protein of unknown function UPF0118  29.1 
 
 		 358 aa  109  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.742659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2075  hypothetical protein  26.54 
 
 		 385 aa  108  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381466  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2360  hypothetical protein  25.34 
 
 		 406 aa  108  5e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1889  putative transport protein  28.85 
 
 		 350 aa  105  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000651778 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1665  hypothetical protein  24.73 
 
 		 382 aa  105  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000108955  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3144  hypothetical protein  26.92 
 
 		 393 aa  104  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0744058  normal  0.288256 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02299  hypothetical protein  26.76 
 
 		 345 aa  104  6e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.622561  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3881  hypothetical protein  23.63 
 
 		 349 aa  103  7e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.198688 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1561  putative transport protein  23.77 
 
 		 352 aa  103  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.421411  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1364  protein of unknown function UPF0118  27.88 
 
 		 420 aa  103  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1709  putative transport protein  23.77 
 
 		 352 aa  103  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0814358  hitchhiker  0.000224346 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2379  hypothetical protein  24.8 
 
 		 345 aa  103  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1669  putative transport protein  23.77 
 
 		 352 aa  103  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1694  hypothetical protein  29.86 
 
 		 360 aa  102  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.258631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2398  hypothetical protein  24.93 
 
 		 389 aa  102  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.17382  normal  0.699282 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3848  hypothetical protein  23.43 
 
 		 349 aa  100  7e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3758  hypothetical protein  23.43 
 
 		 349 aa  100  7e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03323  predicted inner membrane protein  23.14 
 
 		 349 aa  99  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0241  protein of unknown function UPF0118  23.14 
 
 		 349 aa  99  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3956  hypothetical protein  23.43 
 
 		 349 aa  99.4  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3673  hypothetical protein  23.14 
 
 		 349 aa  99  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3845  hypothetical protein  28.69 
 
 		 406 aa  99.4  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.521345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3116  membrane transporter  28.69 
 
 		 388 aa  99.4  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3090  putative transport protein  28.7 
 
 		 350 aa  99.4  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03276  hypothetical protein  23.14 
 
 		 349 aa  99  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4794  inner membrane protein YhhT  23.14 
 
 		 349 aa  99  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0663  protein of unknown function UPF0118  23.3 
 
 		 373 aa  99.4  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.177633 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0242  hypothetical protein  23.43 
 
 		 349 aa  99.4  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3851  inner membrane protein YhhT  25.07 
 
 		 349 aa  99.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2253  putative permease  24.38 
 
 		 389 aa  98.2  4e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1649  putative transport protein  26 
 
 		 344 aa  98.2  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1860  putative transport protein  26 
 
 		 344 aa  98.2  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1590  putative transport protein  26 
 
 		 344 aa  98.2  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1693  putative transport protein  25.71 
 
 		 344 aa  98.2  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.31551  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4013  protein of unknown function UPF0118  24.88 
 
 		 389 aa  97.8  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00579473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3095  hypothetical protein  26.27 
 
 		 393 aa  97.8  6e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3774  inner membrane protein YhhT  24.78 
 
 		 349 aa  97.1  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.505829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3894  hypothetical protein  24.78 
 
 		 349 aa  97.1  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3784  inner membrane protein YhhT  24.78 
 
 		 349 aa  97.1  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1066  hypothetical protein  26.2 
 
 		 359 aa  96.7  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.283585  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1581  putative transport protein  25.71 
 
 		 344 aa  96.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.180816 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0257  response regulator receiver domain-containing protein  25.49 
 
 		 357 aa  96.3  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.492639 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0123  hypothetical protein  27.73 
 
 		 338 aa  95.1  3e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0266583  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2158  hypothetical protein  27.4 
 
 		 387 aa  95.5  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1905  hypothetical protein  27.83 
 
 		 379 aa  94.7  5e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.358826 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02869  transport protein  27.68 
 
 		 338 aa  94.7  5e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1640  transport protein  22.13 
 
 		 336 aa  94.7  5e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>