More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3145 on replicon NC_009467
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009467  Acry_3196  hypothetical protein  100 
 
 		 660 aa  1293    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3145  hypothetical protein  100 
 
 		 660 aa  1293    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.44353  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0304  protein of unknown function UPF0118  49.54 
 
 		 650 aa  587  1e-166  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.10955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1060  hypothetical protein  52.13 
 
 		 645 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6242  hypothetical protein  49.61 
 
 		 659 aa  561  1e-158  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.253941  normal  0.568466 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5020  protein of unknown function UPF0118  47.91 
 
 		 679 aa  548  1e-155  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247687  normal  0.0740005 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4560  hypothetical protein  47.91 
 
 		 668 aa  548  1e-155  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.119566 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1725  protein of unknown function UPF0118  48.23 
 
 		 680 aa  545  1e-154  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5076  protein of unknown function UPF0118  48.55 
 
 		 675 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.864281 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0209  protein of unknown function UPF0118  50.56 
 
 		 651 aa  536  1e-151  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3812  hypothetical protein  50.56 
 
 		 651 aa  535  1e-151  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5287  protein of unknown function UPF0118  48.57 
 
 		 677 aa  535  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0413  hypothetical protein  49.44 
 
 		 679 aa  526  1e-148  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.169508 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1324  membrane transporter  48.56 
 
 		 680 aa  523  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.542629  normal  0.0320057 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5344  hypothetical protein  45.09 
 
 		 647 aa  490  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0275026 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4370  protein of unknown function UPF0118  42.92 
 
 		 652 aa  482  1e-134  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1233  membrane transporter  43.55 
 
 		 650 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0210631  normal  0.375468 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5379  protein of unknown function UPF0118  43.23 
 
 		 650 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.613329  normal  0.237029 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2140  hypothetical protein  45.31 
 
 		 700 aa  464  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.425167  normal  0.975115 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2910  hypothetical protein  42.32 
 
 		 660 aa  461  9.999999999999999e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.381639  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2158  protein of unknown function UPF0118  44.37 
 
 		 653 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1866  hypothetical protein  44.62 
 
 		 689 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2482  hypothetical protein  42.22 
 
 		 662 aa  451  1e-125  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3566  hypothetical protein  41.52 
 
 		 657 aa  435  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0446712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4214  hypothetical protein  42.5 
 
 		 652 aa  426  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0784859  normal  0.378864 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4731  protein of unknown function UPF0118  41.61 
 
 		 649 aa  429  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0106944 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4584  protein of unknown function UPF0118  42.5 
 
 		 652 aa  426  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.113593  normal  0.096848 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2560  hypothetical protein  40.28 
 
 		 644 aa  417  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6648  putative phytochrome sensor protein  40.64 
 
 		 805 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5154  hypothetical protein  39.97 
 
 		 663 aa  414  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3553  hypothetical protein  42.95 
 
 		 647 aa  410  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0625218 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1704  hypothetical protein  45.17 
 
 		 650 aa  411  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.61682 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6859  protein of unknown function UPF0118  37.19 
 
 		 662 aa  392  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.810171 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1431  hypothetical protein  39.32 
 
 		 606 aa  388  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.145958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4144  putative phytochrome sensor protein  37.72 
 
 		 821 aa  353  5e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0677009 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1892  putative GAF sensor protein  37.18 
 
 		 824 aa  348  2e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.397553 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1696  putative phytochrome sensor protein  36.6 
 
 		 830 aa  345  1e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4144  putative GAF sensor protein  34.05 
 
 		 801 aa  315  1.9999999999999998e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3882  putative GAF sensor protein  33.23 
 
 		 782 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3382  putative phytochrome sensor protein  38.73 
 
 		 879 aa  228  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164288 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1066  hypothetical protein  28.43 
 
 		 359 aa  131  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.283585  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3144  hypothetical protein  27.37 
 
 		 393 aa  130  8.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0744058  normal  0.288256 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2909  hypothetical protein  27.89 
 
 		 372 aa  128  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1125  protein of unknown function UPF0118  27.94 
 
 		 359 aa  127  9e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1194  protein of unknown function UPF0118  27.7 
 
 		 359 aa  126  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.514771  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2075  hypothetical protein  25.68 
 
 		 385 aa  121  4.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381466  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3116  membrane transporter  25.41 
 
 		 388 aa  118  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3845  hypothetical protein  25.41 
 
 		 406 aa  118  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.521345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1700  hypothetical protein  25.07 
 
 		 359 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.23154  normal  0.0296077 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1665  hypothetical protein  25.85 
 
 		 382 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000108955  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2778  hypothetical protein  26.3 
 
 		 369 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0204087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1544  hypothetical protein  26.17 
 
 		 368 aa  115  3e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.173707  normal  0.127911 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2891  hypothetical protein  25.34 
 
 		 394 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0951393  hitchhiker  0.00000885055 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1485  hypothetical protein  26.42 
 
 		 368 aa  114  5e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00467252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1550  hypothetical protein  26.42 
 
 		 368 aa  114  5e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0232271  normal  0.172747 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2681  hypothetical protein  26.68 
 
 		 369 aa  114  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.185142  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2702  hypothetical protein  26.68 
 
 		 369 aa  114  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00759105  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1685  protein of unknown function UPF0118  26.68 
 
 		 369 aa  114  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0357703  normal  0.026776 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1490  hypothetical protein  24.93 
 
 		 358 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00480126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2557  hypothetical protein  25.93 
 
 		 404 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5963  protein of unknown function UPF0118  25 
 
 		 353 aa  110  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.97133 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2386  hypothetical protein  25.19 
 
 		 368 aa  110  9.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0461614  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3881  hypothetical protein  25.28 
 
 		 349 aa  109  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.198688 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2065  protein of unknown function UPF0118  26.99 
 
 		 358 aa  108  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.742659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02299  hypothetical protein  25.14 
 
 		 345 aa  107  6e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.622561  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2360  hypothetical protein  27.54 
 
 		 406 aa  107  6e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2920  hypothetical protein  24.68 
 
 		 368 aa  107  7e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3090  putative transport protein  27.91 
 
 		 350 aa  107  8e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2379  hypothetical protein  25.48 
 
 		 345 aa  106  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412006  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2311  hypothetical protein  24.61 
 
 		 354 aa  105  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2143  hypothetical protein  30.92 
 
 		 366 aa  105  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2253  putative permease  26.74 
 
 		 389 aa  103  7e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1364  protein of unknown function UPF0118  24.75 
 
 		 420 aa  103  7e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0257  response regulator receiver domain-containing protein  24.21 
 
 		 357 aa  103  8e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.492639 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3095  hypothetical protein  24.87 
 
 		 393 aa  103  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2517  hypothetical protein  24.94 
 
 		 361 aa  101  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1118  transport protein  22.75 
 
 		 339 aa  99.4  2e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2398  hypothetical protein  24.08 
 
 		 389 aa  99.4  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.17382  normal  0.699282 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2430  hypothetical protein  27.53 
 
 		 360 aa  99.8  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3851  inner membrane protein YhhT  26.46 
 
 		 349 aa  99.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02869  transport protein  26.7 
 
 		 338 aa  99  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001931  putative permease protein  25.64 
 
 		 356 aa  99  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19450  predicted permease  28.41 
 
 		 438 aa  99  3e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1694  hypothetical protein  30.56 
 
 		 360 aa  98.2  4e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.258631  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03323  predicted inner membrane protein  25.56 
 
 		 349 aa  97.8  6e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0241  protein of unknown function UPF0118  25.56 
 
 		 349 aa  97.8  6e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03276  hypothetical protein  25.56 
 
 		 349 aa  97.8  6e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3673  hypothetical protein  25.56 
 
 		 349 aa  97.8  6e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3758  hypothetical protein  24.72 
 
 		 349 aa  97.8  6e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3848  hypothetical protein  25.56 
 
 		 349 aa  97.8  6e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4794  inner membrane protein YhhT  25.56 
 
 		 349 aa  97.8  6e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0242  hypothetical protein  25.56 
 
 		 349 aa  97.1  9e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3956  hypothetical protein  25.56 
 
 		 349 aa  97.1  9e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6996  putative permease  25.28 
 
 		 372 aa  97.1  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3784  inner membrane protein YhhT  26.18 
 
 		 349 aa  96.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3894  hypothetical protein  26.18 
 
 		 349 aa  96.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3774  inner membrane protein YhhT  26.18 
 
 		 349 aa  96.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.505829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1381  hypothetical protein  25.48 
 
 		 384 aa  95.9  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2158  hypothetical protein  24.02 
 
 		 387 aa  96.3  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1669  putative transport protein  25 
 
 		 352 aa  95.5  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>