More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1381 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1381  hypothetical protein  100 
 
 		 384 aa  758    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2253  putative permease  44.74 
 
 		 389 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3095  hypothetical protein  44.08 
 
 		 393 aa  320  3e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2954  hypothetical protein  44.99 
 
 		 386 aa  318  1e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3452  hypothetical protein  41.44 
 
 		 394 aa  308  9e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1364  protein of unknown function UPF0118  43.29 
 
 		 420 aa  307  2.0000000000000002e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3669  hypothetical protein  41.6 
 
 		 390 aa  306  5.0000000000000004e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2927  transport protein  43.13 
 
 		 405 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.799818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2002  hypothetical protein  42.98 
 
 		 434 aa  276  5e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0749036  hitchhiker  0.0034214 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1509  hypothetical protein  34.79 
 
 		 399 aa  222  9.999999999999999e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2644  hypothetical protein  36.52 
 
 		 393 aa  211  2e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3776  protein of unknown function UPF0118  35.73 
 
 		 439 aa  177  3e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.165443 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3888  protein of unknown function UPF0118  35.73 
 
 		 439 aa  177  3e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2075  hypothetical protein  30.14 
 
 		 385 aa  169  9e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381466  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3144  hypothetical protein  30.17 
 
 		 393 aa  152  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0744058  normal  0.288256 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5963  protein of unknown function UPF0118  30.03 
 
 		 353 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.97133 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1066  hypothetical protein  29.06 
 
 		 359 aa  145  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.283585  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1194  protein of unknown function UPF0118  28.99 
 
 		 359 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.514771  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0257  response regulator receiver domain-containing protein  27.83 
 
 		 357 aa  144  3e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.492639 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1125  protein of unknown function UPF0118  29.14 
 
 		 359 aa  143  5e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3116  membrane transporter  31.1 
 
 		 388 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3845  hypothetical protein  31.1 
 
 		 406 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.521345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2158  hypothetical protein  28.77 
 
 		 387 aa  139  8.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4731  protein of unknown function UPF0118  29.76 
 
 		 649 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0106944 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3520  hypothetical protein  28.49 
 
 		 434 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.365519  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1983  protein of unknown function UPF0118  27.03 
 
 		 408 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4214  hypothetical protein  29.72 
 
 		 652 aa  125  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0784859  normal  0.378864 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4584  protein of unknown function UPF0118  29.72 
 
 		 652 aa  125  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.113593  normal  0.096848 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2482  hypothetical protein  29.11 
 
 		 662 aa  122  7e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8661  protein of unknown function UPF0118  27.46 
 
 		 386 aa  122  8e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0263  protein of unknown function UPF0118  25.41 
 
 		 369 aa  122  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.120153  normal  0.560864 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1431  hypothetical protein  29.97 
 
 		 606 aa  120  4.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.145958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02869  transport protein  25.89 
 
 		 338 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2143  hypothetical protein  28.31 
 
 		 366 aa  118  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2995  hypothetical protein  25.41 
 
 		 377 aa  116  5e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1696  putative phytochrome sensor protein  27.56 
 
 		 830 aa  115  8.999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1892  putative GAF sensor protein  26.5 
 
 		 824 aa  114  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.397553 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6648  putative phytochrome sensor protein  26.82 
 
 		 805 aa  113  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3553  hypothetical protein  27.48 
 
 		 647 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0625218 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0246  transport protein  24.8 
 
 		 369 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.33291  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2059  hypothetical protein  26.51 
 
 		 382 aa  111  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.295344  normal  0.388769 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001931  putative permease protein  23.74 
 
 		 356 aa  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6996  putative permease  25.67 
 
 		 372 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0216  hypothetical protein  25.07 
 
 		 369 aa  110  5e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5154  hypothetical protein  22.89 
 
 		 663 aa  107  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4144  putative phytochrome sensor protein  26.36 
 
 		 821 aa  107  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0677009 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2954  hypothetical protein  25.18 
 
 		 444 aa  107  5e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2560  hypothetical protein  25.44 
 
 		 644 aa  106  9e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1725  protein of unknown function UPF0118  25.78 
 
 		 680 aa  105  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2214  hypothetical protein  26.04 
 
 		 374 aa  105  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4272  hypothetical protein  27.99 
 
 		 374 aa  105  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2910  hypothetical protein  27.76 
 
 		 660 aa  104  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.381639  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4560  hypothetical protein  26.72 
 
 		 668 aa  103  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.119566 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5020  protein of unknown function UPF0118  27.3 
 
 		 679 aa  103  5e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247687  normal  0.0740005 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6859  protein of unknown function UPF0118  24.1 
 
 		 662 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.810171 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1390  hypothetical protein  25.34 
 
 		 368 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4144  putative GAF sensor protein  24.41 
 
 		 801 aa  97.4  4e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1590  putative transport protein  25.82 
 
 		 344 aa  96.7  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1649  putative transport protein  25.82 
 
 		 344 aa  96.7  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3145  hypothetical protein  23.8 
 
 		 660 aa  97.1  5e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.44353  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3196  hypothetical protein  23.8 
 
 		 660 aa  97.1  5e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1860  putative transport protein  25.82 
 
 		 344 aa  96.7  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0413  hypothetical protein  26.51 
 
 		 679 aa  96.7  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.169508 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  26.89 
 
 		 343 aa  96.3  9e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1693  putative transport protein  25.82 
 
 		 344 aa  95.9  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.31551  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1370  hypothetical protein  23.85 
 
 		 367 aa  95.5  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.635669 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1490  hypothetical protein  24.44 
 
 		 358 aa  95.5  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00480126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4702  protein of unknown function UPF0118  25.15 
 
 		 371 aa  95.5  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.605317  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1581  putative transport protein  25.52 
 
 		 344 aa  95.1  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.180816 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4026  hypothetical protein  25.82 
 
 		 374 aa  95.1  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23322 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0555  hypothetical protein  25.82 
 
 		 380 aa  94.7  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.11052 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1665  hypothetical protein  24.49 
 
 		 382 aa  95.1  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000108955  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3464  hypothetical protein  23.55 
 
 		 406 aa  94.4  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384592 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1700  hypothetical protein  24.08 
 
 		 359 aa  94  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.23154  normal  0.0296077 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2891  hypothetical protein  24.65 
 
 		 394 aa  94  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0951393  hitchhiker  0.00000885055 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0304  protein of unknown function UPF0118  27.64 
 
 		 650 aa  93.6  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.10955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2927  permease  28.02 
 
 		 365 aa  93.6  6e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241708  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1354  permease  23.16 
 
 		 350 aa  93.2  6e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5076  protein of unknown function UPF0118  25.88 
 
 		 675 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.864281 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2386  hypothetical protein  24.04 
 
 		 368 aa  92.4  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0461614  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4370  protein of unknown function UPF0118  27.45 
 
 		 652 aa  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3566  hypothetical protein  25.82 
 
 		 657 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0446712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01555  transport protein  28.49 
 
 		 296 aa  91.7  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2920  hypothetical protein  22.4 
 
 		 368 aa  90.9  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4116  protein of unknown function UPF0118  26.24 
 
 		 360 aa  90.5  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.614918  normal  0.119486 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3105  hypothetical protein  23.38 
 
 		 374 aa  90.1  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1544  hypothetical protein  23.01 
 
 		 368 aa  89.7  7e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.173707  normal  0.127911 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2087  hypothetical protein  26.09 
 
 		 353 aa  89  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.257402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002790  permease PerM  25.71 
 
 		 357 aa  89  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1485  hypothetical protein  23.01 
 
 		 368 aa  89  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00467252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1550  hypothetical protein  23.01 
 
 		 368 aa  89  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0232271  normal  0.172747 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2752  permease PerM  26.47 
 
 		 362 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2688  permease PerM  26.47 
 
 		 355 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2730  permease PerM  26.47 
 
 		 362 aa  88.6  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.659097  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6242  hypothetical protein  25.9 
 
 		 659 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.253941  normal  0.568466 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2861  permease PerM  26.47 
 
 		 362 aa  88.6  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2557  hypothetical protein  25 
 
 		 404 aa  88.6  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2640  permease PerM  26.47 
 
 		 355 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.419277  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1910  putative transport protein  24.16 
 
 		 344 aa  87  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1742  putative permease PerM  25.57 
 
 		 354 aa  87.4  4e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>