More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2002 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_2002  hypothetical protein  100 
 
 		 434 aa  838    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0749036  hitchhiker  0.0034214 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3095  hypothetical protein  60.31 
 
 		 393 aa  458  9.999999999999999e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1364  protein of unknown function UPF0118  58.75 
 
 		 420 aa  451  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3669  hypothetical protein  60.44 
 
 		 390 aa  446  1.0000000000000001e-124  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2927  transport protein  59.49 
 
 		 405 aa  436  1e-121  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.799818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3452  hypothetical protein  55.14 
 
 		 394 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2253  putative permease  49.27 
 
 		 389 aa  336  5.999999999999999e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1381  hypothetical protein  42.98 
 
 		 384 aa  277  3e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2954  hypothetical protein  38.33 
 
 		 386 aa  236  9e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1509  hypothetical protein  39.61 
 
 		 399 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3888  protein of unknown function UPF0118  39.67 
 
 		 439 aa  222  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3776  protein of unknown function UPF0118  39.67 
 
 		 439 aa  222  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.165443 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2644  hypothetical protein  39.89 
 
 		 393 aa  218  2e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2075  hypothetical protein  33.99 
 
 		 385 aa  172  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381466  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0257  response regulator receiver domain-containing protein  29.57 
 
 		 357 aa  157  4e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.492639 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1125  protein of unknown function UPF0118  31.05 
 
 		 359 aa  155  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1194  protein of unknown function UPF0118  30.53 
 
 		 359 aa  151  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.514771  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1066  hypothetical protein  31.46 
 
 		 359 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.283585  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3144  hypothetical protein  29.56 
 
 		 393 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0744058  normal  0.288256 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3520  hypothetical protein  31.54 
 
 		 434 aa  139  7e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.365519  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2995  hypothetical protein  28.57 
 
 		 377 aa  137  6.0000000000000005e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2158  hypothetical protein  26.44 
 
 		 387 aa  136  9e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3845  hypothetical protein  30.72 
 
 		 406 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.521345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3116  membrane transporter  30.72 
 
 		 388 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02869  transport protein  30.97 
 
 		 338 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8661  protein of unknown function UPF0118  29.51 
 
 		 386 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1983  protein of unknown function UPF0118  28.45 
 
 		 408 aa  124  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2560  hypothetical protein  27.57 
 
 		 644 aa  124  4e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1431  hypothetical protein  28.42 
 
 		 606 aa  123  8e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.145958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001931  putative permease protein  25.76 
 
 		 356 aa  123  8e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5154  hypothetical protein  28.61 
 
 		 663 aa  120  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1725  protein of unknown function UPF0118  27.39 
 
 		 680 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0246  transport protein  29.94 
 
 		 369 aa  117  3e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.33291  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0263  protein of unknown function UPF0118  27.35 
 
 		 369 aa  117  5e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.120153  normal  0.560864 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5963  protein of unknown function UPF0118  28.21 
 
 		 353 aa  116  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.97133 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4731  protein of unknown function UPF0118  28.13 
 
 		 649 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0106944 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0216  hypothetical protein  29.38 
 
 		 369 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2482  hypothetical protein  27.45 
 
 		 662 aa  111  3e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2143  hypothetical protein  29.34 
 
 		 366 aa  111  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1696  putative phytochrome sensor protein  26.78 
 
 		 830 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6648  putative phytochrome sensor protein  27.72 
 
 		 805 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2059  hypothetical protein  28.07 
 
 		 382 aa  110  5e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.295344  normal  0.388769 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0555  hypothetical protein  25.62 
 
 		 380 aa  110  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.11052 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4214  hypothetical protein  27.45 
 
 		 652 aa  110  6e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0784859  normal  0.378864 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4584  protein of unknown function UPF0118  26.94 
 
 		 652 aa  110  6e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.113593  normal  0.096848 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2379  hypothetical protein  27.36 
 
 		 345 aa  109  9.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1892  putative GAF sensor protein  25.93 
 
 		 824 aa  109  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.397553 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0413  hypothetical protein  26.86 
 
 		 679 aa  108  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.169508 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6242  hypothetical protein  27.98 
 
 		 659 aa  108  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.253941  normal  0.568466 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2140  hypothetical protein  26.33 
 
 		 700 aa  107  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.425167  normal  0.975115 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0190  hypothetical protein  25.23 
 
 		 356 aa  107  4e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3464  hypothetical protein  27.56 
 
 		 406 aa  106  8e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384592 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4560  hypothetical protein  26.74 
 
 		 668 aa  105  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.119566 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5020  protein of unknown function UPF0118  26.74 
 
 		 679 aa  105  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247687  normal  0.0740005 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0136  protein of unknown function UPF0118  23.93 
 
 		 387 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.291617  normal  0.459798 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6859  protein of unknown function UPF0118  24.86 
 
 		 662 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.810171 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3553  hypothetical protein  24.56 
 
 		 647 aa  104  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0625218 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3345  hypothetical protein  36.73 
 
 		 432 aa  102  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1354  permease  26.23 
 
 		 350 aa  102  2e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0304  protein of unknown function UPF0118  27.12 
 
 		 650 aa  101  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.10955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1490  hypothetical protein  24.78 
 
 		 358 aa  102  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00480126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_2996  hypothetical protein  36.04 
 
 		 414 aa  99  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.229433 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3566  hypothetical protein  26.1 
 
 		 657 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0446712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2891  hypothetical protein  24.29 
 
 		 394 aa  98.6  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0951393  hitchhiker  0.00000885055 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2214  hypothetical protein  25.61 
 
 		 374 aa  98.6  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5344  hypothetical protein  25.07 
 
 		 647 aa  98.6  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0275026 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4144  putative phytochrome sensor protein  25.21 
 
 		 821 aa  98.6  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0677009 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0928  permease  36.59 
 
 		 361 aa  98.2  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.335153 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2482  hypothetical protein  26.79 
 
 		 359 aa  97.8  4e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4013  protein of unknown function UPF0118  26.04 
 
 		 389 aa  97.1  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00579473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5076  protein of unknown function UPF0118  26.3 
 
 		 675 aa  96.7  7e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.864281 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2910  hypothetical protein  24.17 
 
 		 660 aa  96.3  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.381639  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0663  protein of unknown function UPF0118  24.93 
 
 		 373 aa  95.5  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.177633 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1544  hypothetical protein  25.29 
 
 		 368 aa  95.9  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.173707  normal  0.127911 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3659  hypothetical protein  36.68 
 
 		 390 aa  95.1  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0638108 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3310  protein of unknown function UPF0118  26.46 
 
 		 354 aa  95.5  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2070  hypothetical protein  25.94 
 
 		 348 aa  94.7  3e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2927  permease  25.56 
 
 		 365 aa  94.7  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241708  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1044  protein of unknown function UPF0118  32.46 
 
 		 345 aa  94.4  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.157129 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1694  hypothetical protein  35.33 
 
 		 360 aa  94.4  4e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.258631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3864  hypothetical protein  25.14 
 
 		 356 aa  93.6  6e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.285096  normal  0.3601 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01555  transport protein  29.03 
 
 		 296 aa  93.6  7e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02299  hypothetical protein  26.76 
 
 		 345 aa  93.2  7e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.622561  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002790  permease PerM  27.2 
 
 		 357 aa  93.2  8e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4144  putative GAF sensor protein  23.71 
 
 		 801 aa  92.4  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3882  putative GAF sensor protein  23.02 
 
 		 782 aa  92.4  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1485  hypothetical protein  25.16 
 
 		 368 aa  92.8  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00467252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1550  hypothetical protein  25.16 
 
 		 368 aa  92.8  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0232271  normal  0.172747 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1685  protein of unknown function UPF0118  24.35 
 
 		 369 aa  91.7  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0357703  normal  0.026776 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2681  hypothetical protein  24.35 
 
 		 369 aa  91.7  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.185142  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1697  hypothetical protein  35.03 
 
 		 360 aa  92  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.588209  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1700  hypothetical protein  24.07 
 
 		 359 aa  91.7  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.23154  normal  0.0296077 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2065  protein of unknown function UPF0118  34.9 
 
 		 358 aa  91.7  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.742659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2778  hypothetical protein  24.35 
 
 		 369 aa  91.7  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0204087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2702  hypothetical protein  24.35 
 
 		 369 aa  91.3  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00759105  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3314  hypothetical protein  28.5 
 
 		 353 aa  91.3  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5287  protein of unknown function UPF0118  25.75 
 
 		 677 aa  90.9  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2517  hypothetical protein  32.02 
 
 		 361 aa  90.9  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1324  membrane transporter  25.75 
 
 		 680 aa  90.9  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.542629  normal  0.0320057 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2557  hypothetical protein  25.99 
 
 		 404 aa  90.9  4e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>