More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2995 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2995  hypothetical protein  100 
 
 		 377 aa  743    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8661  protein of unknown function UPF0118  47.26 
 
 		 386 aa  305  8.000000000000001e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1983  protein of unknown function UPF0118  43.61 
 
 		 408 aa  273  3e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3144  hypothetical protein  34.11 
 
 		 393 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0744058  normal  0.288256 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3116  membrane transporter  34.35 
 
 		 388 aa  193  3e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3845  hypothetical protein  34.35 
 
 		 406 aa  193  4e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.521345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2075  hypothetical protein  31.87 
 
 		 385 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381466  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3520  hypothetical protein  32.75 
 
 		 434 aa  176  8e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.365519  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2158  hypothetical protein  28 
 
 		 387 aa  172  5.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02869  transport protein  29.45 
 
 		 338 aa  171  1e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0257  response regulator receiver domain-containing protein  30.86 
 
 		 357 aa  170  5e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.492639 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0263  protein of unknown function UPF0118  30.97 
 
 		 369 aa  168  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.120153  normal  0.560864 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3464  hypothetical protein  32.27 
 
 		 406 aa  166  6.9999999999999995e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384592 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001931  putative permease protein  30.81 
 
 		 356 aa  162  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5963  protein of unknown function UPF0118  30.84 
 
 		 353 aa  161  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.97133 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2214  hypothetical protein  27.97 
 
 		 374 aa  152  1e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4026  hypothetical protein  28.97 
 
 		 374 aa  149  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23322 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1364  protein of unknown function UPF0118  29.51 
 
 		 420 aa  149  7e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2143  hypothetical protein  30.24 
 
 		 366 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6996  putative permease  29.62 
 
 		 372 aa  145  8.000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2954  hypothetical protein  29.33 
 
 		 444 aa  144  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4272  hypothetical protein  28.73 
 
 		 374 aa  143  4e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0246  transport protein  29.74 
 
 		 369 aa  142  9.999999999999999e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.33291  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4702  protein of unknown function UPF0118  30.96 
 
 		 371 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.605317  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3669  hypothetical protein  29.43 
 
 		 390 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2059  hypothetical protein  29.19 
 
 		 382 aa  140  4.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.295344  normal  0.388769 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3105  hypothetical protein  29.54 
 
 		 374 aa  139  7.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1324  hypothetical protein  34.01 
 
 		 408 aa  139  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0575147  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0216  hypothetical protein  29.45 
 
 		 369 aa  136  5e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3452  hypothetical protein  29.92 
 
 		 394 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1370  hypothetical protein  27.98 
 
 		 367 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.635669 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1390  hypothetical protein  27.99 
 
 		 368 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2253  putative permease  27.48 
 
 		 389 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01555  transport protein  36.6 
 
 		 296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2002  hypothetical protein  27.6 
 
 		 434 aa  124  3e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0749036  hitchhiker  0.0034214 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0484  hypothetical protein  29.91 
 
 		 406 aa  122  8e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1260  hypothetical protein  28.11 
 
 		 366 aa  122  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2927  transport protein  28.32 
 
 		 405 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.799818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3095  hypothetical protein  27.04 
 
 		 393 aa  120  4.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2644  hypothetical protein  31.23 
 
 		 393 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0992  protein of unknown function UPF0118  26.38 
 
 		 396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.537691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0864  protein of unknown function UPF0118  26.22 
 
 		 388 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.407336  normal  0.786267 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1381  hypothetical protein  25.44 
 
 		 384 aa  108  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0336  hypothetical protein  28.15 
 
 		 376 aa  107  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.115948 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2560  hypothetical protein  26.52 
 
 		 644 aa  107  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2065  protein of unknown function UPF0118  30.03 
 
 		 358 aa  105  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.742659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1066  hypothetical protein  24.69 
 
 		 359 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.283585  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0304  protein of unknown function UPF0118  28.85 
 
 		 650 aa  101  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.10955  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6859  protein of unknown function UPF0118  30.36 
 
 		 662 aa  97.8  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.810171 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1194  protein of unknown function UPF0118  24.93 
 
 		 359 aa  97.8  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.514771  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4013  protein of unknown function UPF0118  28.78 
 
 		 389 aa  97.1  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00579473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2158  protein of unknown function UPF0118  25.77 
 
 		 653 aa  97.1  4e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1665  hypothetical protein  26.3 
 
 		 382 aa  97.4  4e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000108955  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1544  hypothetical protein  23.92 
 
 		 368 aa  97.1  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.173707  normal  0.127911 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2386  hypothetical protein  25 
 
 		 368 aa  96.3  8e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0461614  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2909  hypothetical protein  25.52 
 
 		 372 aa  95.5  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2379  hypothetical protein  27.44 
 
 		 345 aa  95.9  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2681  hypothetical protein  25.5 
 
 		 369 aa  94.7  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.185142  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2778  hypothetical protein  25.5 
 
 		 369 aa  94.7  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0204087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1685  protein of unknown function UPF0118  25.5 
 
 		 369 aa  94.7  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0357703  normal  0.026776 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4731  protein of unknown function UPF0118  25.42 
 
 		 649 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0106944 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1125  protein of unknown function UPF0118  25 
 
 		 359 aa  95.1  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2927  permease  27.58 
 
 		 365 aa  95.1  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241708  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2891  hypothetical protein  25.14 
 
 		 394 aa  95.1  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0951393  hitchhiker  0.00000885055 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1485  hypothetical protein  23.88 
 
 		 368 aa  95.1  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00467252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1550  hypothetical protein  23.88 
 
 		 368 aa  95.1  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0232271  normal  0.172747 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2702  hypothetical protein  25.5 
 
 		 369 aa  94.4  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00759105  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1490  hypothetical protein  25.69 
 
 		 358 aa  94.4  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00480126  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2920  hypothetical protein  23.32 
 
 		 368 aa  93.2  6e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1693  putative transport protein  27.5 
 
 		 344 aa  93.6  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.31551  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1860  putative transport protein  27.5 
 
 		 344 aa  92.8  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1649  putative transport protein  27.5 
 
 		 344 aa  92.8  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1590  putative transport protein  27.5 
 
 		 344 aa  92.8  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4584  protein of unknown function UPF0118  25 
 
 		 652 aa  92  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.113593  normal  0.096848 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1581  putative transport protein  27.5 
 
 		 344 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.180816 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1669  putative transport protein  26.87 
 
 		 352 aa  91.7  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1561  putative transport protein  26.87 
 
 		 352 aa  91.7  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.421411  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2557  hypothetical protein  26.05 
 
 		 404 aa  92  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1709  putative transport protein  26.87 
 
 		 352 aa  91.7  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0814358  hitchhiker  0.000224346 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5154  hypothetical protein  24.85 
 
 		 663 aa  90.9  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3314  hypothetical protein  27.38 
 
 		 353 aa  90.1  6e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1700  hypothetical protein  24.29 
 
 		 359 aa  90.1  6e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.23154  normal  0.0296077 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4214  hypothetical protein  24.71 
 
 		 652 aa  89.7  7e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0784859  normal  0.378864 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1910  putative transport protein  26.65 
 
 		 344 aa  89.4  9e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1354  permease  23.58 
 
 		 350 aa  89.4  9e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2954  hypothetical protein  28.31 
 
 		 386 aa  89.4  9e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4116  protein of unknown function UPF0118  27.27 
 
 		 360 aa  89  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.614918  normal  0.119486 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2311  hypothetical protein  25 
 
 		 354 aa  89.4  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0719  protein of unknown function UPF0118  26.12 
 
 		 370 aa  89  1e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000137163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0555  hypothetical protein  22.68 
 
 		 380 aa  89.4  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.11052 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4560  hypothetical protein  24.24 
 
 		 668 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.119566 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5020  protein of unknown function UPF0118  24.24 
 
 		 679 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247687  normal  0.0740005 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1509  hypothetical protein  27.54 
 
 		 399 aa  88.2  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1431  hypothetical protein  26.33 
 
 		 606 aa  88.6  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.145958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3566  hypothetical protein  24.48 
 
 		 657 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0446712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1694  hypothetical protein  26.04 
 
 		 360 aa  87.4  4e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.258631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2398  hypothetical protein  24.85 
 
 		 389 aa  87  5e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.17382  normal  0.699282 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1889  putative transport protein  27.38 
 
 		 350 aa  86.7  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000651778 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2482  hypothetical protein  23.74 
 
 		 662 aa  86.3  8e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2517  hypothetical protein  27.17 
 
 		 361 aa  85.9  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>