More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01555 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01555  transport protein  100 
 
 		 296 aa  592  1e-168  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4272  hypothetical protein  45.97 
 
 		 374 aa  261  8.999999999999999e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0257  response regulator receiver domain-containing protein  33.22 
 
 		 357 aa  188  9e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.492639 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02869  transport protein  34.92 
 
 		 338 aa  182  5.0000000000000004e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0263  protein of unknown function UPF0118  34.24 
 
 		 369 aa  181  2e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.120153  normal  0.560864 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001931  putative permease protein  34.05 
 
 		 356 aa  172  6.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2158  hypothetical protein  34.57 
 
 		 387 aa  149  5e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0246  transport protein  33.56 
 
 		 369 aa  149  6e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.33291  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2075  hypothetical protein  29.51 
 
 		 385 aa  146  5e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381466  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0216  hypothetical protein  32.89 
 
 		 369 aa  144  2e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3144  hypothetical protein  29.21 
 
 		 393 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0744058  normal  0.288256 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3116  membrane transporter  29.54 
 
 		 388 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3845  hypothetical protein  30.14 
 
 		 406 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.521345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2995  hypothetical protein  36.6 
 
 		 377 aa  133  3.9999999999999996e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8661  protein of unknown function UPF0118  33.79 
 
 		 386 aa  129  6e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1983  protein of unknown function UPF0118  36.36 
 
 		 408 aa  127  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2214  hypothetical protein  30.74 
 
 		 374 aa  126  4.0000000000000003e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3520  hypothetical protein  27.27 
 
 		 434 aa  125  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.365519  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2059  hypothetical protein  29.73 
 
 		 382 aa  119  9e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.295344  normal  0.388769 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5963  protein of unknown function UPF0118  29.17 
 
 		 353 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.97133 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3464  hypothetical protein  29.6 
 
 		 406 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384592 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3105  hypothetical protein  27.3 
 
 		 374 aa  113  5e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2927  transport protein  31.38 
 
 		 405 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.799818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2253  putative permease  32.22 
 
 		 389 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3452  hypothetical protein  26.57 
 
 		 394 aa  107  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2954  hypothetical protein  26.07 
 
 		 444 aa  107  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1324  hypothetical protein  34.87 
 
 		 408 aa  100  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0575147  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3669  hypothetical protein  25.44 
 
 		 390 aa  100  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1364  protein of unknown function UPF0118  25.8 
 
 		 420 aa  99  8e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6996  putative permease  32.53 
 
 		 372 aa  97.4  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0484  hypothetical protein  36.42 
 
 		 406 aa  96.7  4e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3095  hypothetical protein  28.49 
 
 		 393 aa  96.3  6e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2002  hypothetical protein  29.03 
 
 		 434 aa  95.5  9e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0749036  hitchhiker  0.0034214 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1390  hypothetical protein  31.18 
 
 		 368 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1066  hypothetical protein  27.62 
 
 		 359 aa  94  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.283585  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1194  protein of unknown function UPF0118  28.8 
 
 		 359 aa  93.6  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.514771  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1370  hypothetical protein  30.12 
 
 		 367 aa  93.6  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.635669 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1125  protein of unknown function UPF0118  28.8 
 
 		 359 aa  93.6  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4702  protein of unknown function UPF0118  30.72 
 
 		 371 aa  92.8  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.605317  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2143  hypothetical protein  27.56 
 
 		 366 aa  93.2  5e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0864  protein of unknown function UPF0118  30.12 
 
 		 388 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.407336  normal  0.786267 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1381  hypothetical protein  28.85 
 
 		 384 aa  88.6  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0992  protein of unknown function UPF0118  29.52 
 
 		 396 aa  88.2  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.537691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2909  hypothetical protein  27.1 
 
 		 372 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2158  protein of unknown function UPF0118  26.67 
 
 		 653 aa  83.2  0.000000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4026  hypothetical protein  30.72 
 
 		 374 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23322 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2697  transport protein  23.19 
 
 		 371 aa  81.6  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0215163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2386  hypothetical protein  27.45 
 
 		 368 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0461614  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4175  hypothetical protein  31.84 
 
 		 339 aa  81.3  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0228535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3314  hypothetical protein  30.57 
 
 		 353 aa  80.9  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2379  hypothetical protein  29.8 
 
 		 345 aa  80.9  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2430  hypothetical protein  29.63 
 
 		 360 aa  80.1  0.00000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1665  hypothetical protein  26.26 
 
 		 382 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000108955  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0336  hypothetical protein  30.12 
 
 		 376 aa  79.3  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.115948 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1544  hypothetical protein  27.45 
 
 		 368 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.173707  normal  0.127911 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5076  protein of unknown function UPF0118  25.85 
 
 		 675 aa  79  0.00000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.864281 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2644  hypothetical protein  27.92 
 
 		 393 aa  79  0.00000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3310  protein of unknown function UPF0118  24.44 
 
 		 354 aa  79  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2557  hypothetical protein  27.09 
 
 		 404 aa  79  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4116  protein of unknown function UPF0118  26.67 
 
 		 360 aa  77.8  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.614918  normal  0.119486 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2920  hypothetical protein  26.47 
 
 		 368 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6648  putative phytochrome sensor protein  30 
 
 		 805 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1485  hypothetical protein  26.96 
 
 		 368 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00467252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1550  hypothetical protein  26.96 
 
 		 368 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0232271  normal  0.172747 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2140  hypothetical protein  29.08 
 
 		 700 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.425167  normal  0.975115 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2517  hypothetical protein  27.52 
 
 		 361 aa  77.4  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1685  protein of unknown function UPF0118  26.27 
 
 		 369 aa  77  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0357703  normal  0.026776 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2681  hypothetical protein  26.27 
 
 		 369 aa  77  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.185142  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2778  hypothetical protein  26.27 
 
 		 369 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0204087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  22.18 
 
 		 355 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  22.18 
 
 		 355 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1509  hypothetical protein  24.91 
 
 		 399 aa  77  0.0000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2702  hypothetical protein  26.27 
 
 		 369 aa  77  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00759105  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2891  hypothetical protein  28.8 
 
 		 394 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0951393  hitchhiker  0.00000885055 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6242  hypothetical protein  28.12 
 
 		 659 aa  76.3  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.253941  normal  0.568466 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5344  hypothetical protein  25.52 
 
 		 647 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0275026 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0632  hypothetical protein  25 
 
 		 348 aa  75.9  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000226632  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5154  hypothetical protein  25.63 
 
 		 663 aa  75.9  0.0000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4560  hypothetical protein  27.13 
 
 		 668 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.119566 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5020  protein of unknown function UPF0118  27.13 
 
 		 679 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247687  normal  0.0740005 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1260  hypothetical protein  30.95 
 
 		 366 aa  75.1  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2070  hypothetical protein  27.94 
 
 		 348 aa  75.1  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2360  hypothetical protein  26.47 
 
 		 406 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2560  hypothetical protein  25.26 
 
 		 644 aa  75.5  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1490  hypothetical protein  26.47 
 
 		 358 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00480126  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2311  hypothetical protein  29.45 
 
 		 354 aa  74.3  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2482  hypothetical protein  25.26 
 
 		 662 aa  74.3  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0136  protein of unknown function UPF0118  27.19 
 
 		 387 aa  74.7  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.291617  normal  0.459798 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1700  hypothetical protein  28.27 
 
 		 359 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.23154  normal  0.0296077 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1060  hypothetical protein  26.52 
 
 		 645 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  21.05 
 
 		 355 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  21.05 
 
 		 355 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  21.05 
 
 		 355 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  21.05 
 
 		 355 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  21.05 
 
 		 355 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1693  putative transport protein  27.31 
 
 		 344 aa  72.8  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.31551  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1581  putative transport protein  27.31 
 
 		 344 aa  72.8  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.180816 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1649  putative transport protein  27.31 
 
 		 344 aa  72.8  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1860  putative transport protein  27.31 
 
 		 344 aa  72.8  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2954  hypothetical protein  25.5 
 
 		 386 aa  72.8  0.000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>