More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2697 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2697  transport protein  100 
 
 		 371 aa  735    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0215163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6357  protein of unknown function UPF0118  33.14 
 
 		 363 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2927  permease  33.04 
 
 		 365 aa  188  1e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241708  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0663  protein of unknown function UPF0118  32.58 
 
 		 373 aa  187  3e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.177633 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4013  protein of unknown function UPF0118  31.14 
 
 		 389 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00579473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0136  protein of unknown function UPF0118  31.89 
 
 		 387 aa  184  3e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.291617  normal  0.459798 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4116  protein of unknown function UPF0118  33.84 
 
 		 360 aa  169  6e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.614918  normal  0.119486 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3310  protein of unknown function UPF0118  29.57 
 
 		 354 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2957  hypothetical protein  29.61 
 
 		 366 aa  155  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2317  protein of unknown function UPF0118  26.73 
 
 		 377 aa  153  5e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.255461 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5612  protein of unknown function UPF0118  28.06 
 
 		 383 aa  142  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3362  protein of unknown function UPF0118  28.57 
 
 		 367 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0425381  normal  0.231326 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2298  hypothetical protein  28.34 
 
 		 371 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0296876 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1233  protein of unknown function UPF0118  28.57 
 
 		 370 aa  133  6e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0667714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2075  hypothetical protein  27.22 
 
 		 385 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381466  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3144  hypothetical protein  25.42 
 
 		 393 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0744058  normal  0.288256 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  24.92 
 
 		 370 aa  101  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  24.02 
 
 		 390 aa  98.2  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3669  hypothetical protein  25.82 
 
 		 390 aa  97.8  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2575  hypothetical protein  27.33 
 
 		 415 aa  95.5  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41372  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3116  membrane transporter  23.44 
 
 		 388 aa  94.7  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1773  hypothetical protein  26.67 
 
 		 357 aa  95.1  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000027115  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3095  hypothetical protein  24.04 
 
 		 393 aa  94.7  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3845  hypothetical protein  23.44 
 
 		 406 aa  93.6  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.521345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1125  protein of unknown function UPF0118  22.42 
 
 		 359 aa  93.6  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2050  hypothetical protein  28.69 
 
 		 368 aa  92  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116574  hitchhiker  0.00000000347502 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1194  protein of unknown function UPF0118  22.42 
 
 		 359 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.514771  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3687  hypothetical protein  23.53 
 
 		 357 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000304887 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1066  hypothetical protein  23.1 
 
 		 359 aa  90.9  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.283585  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  24.14 
 
 		 349 aa  90.9  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1964  hypothetical protein  24.02 
 
 		 378 aa  90.1  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4051  hypothetical protein  26.6 
 
 		 354 aa  89.7  8e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2059  hypothetical protein  22.59 
 
 		 382 aa  89.7  8e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.295344  normal  0.388769 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5963  protein of unknown function UPF0118  24.65 
 
 		 353 aa  89.4  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.97133 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1225  hypothetical protein  27.49 
 
 		 357 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.220929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  23.08 
 
 		 343 aa  89.4  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0632  hypothetical protein  26.61 
 
 		 348 aa  89  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000226632  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5154  hypothetical protein  22.61 
 
 		 663 aa  88.2  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6648  putative phytochrome sensor protein  22.93 
 
 		 805 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2774  hypothetical protein  25.94 
 
 		 348 aa  87.8  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2214  hypothetical protein  24.56 
 
 		 374 aa  87.8  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1667  hypothetical protein  26.11 
 
 		 357 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.629251 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1702  permease, putative  26.6 
 
 		 357 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.303674  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1265  hypothetical protein  26.13 
 
 		 357 aa  87  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0876555 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2002  hypothetical protein  21.41 
 
 		 434 aa  87  5e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0749036  hitchhiker  0.0034214 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3055  permease  24.84 
 
 		 376 aa  86.3  9e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0055436  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3355  hypothetical protein  25.78 
 
 		 373 aa  85.9  9e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2994  hypothetical protein  27.62 
 
 		 360 aa  85.9  9e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687092 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3161  hypothetical protein  24.84 
 
 		 376 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000118258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3145  permease  24.84 
 
 		 376 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000188051  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3410  hypothetical protein  24.84 
 
 		 376 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2169  hypothetical protein  27.5 
 
 		 368 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.215488  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3380  hypothetical protein  24.84 
 
 		 373 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2158  hypothetical protein  24.36 
 
 		 387 aa  84.7  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5344  hypothetical protein  22.96 
 
 		 647 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0275026 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3381  membrane protein YubA  24.53 
 
 		 373 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00559166  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1880  hypothetical protein  27.27 
 
 		 372 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0162246  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  24.02 
 
 		 396 aa  84.3  0.000000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1696  putative phytochrome sensor protein  21.32 
 
 		 830 aa  84.3  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  22.7 
 
 		 363 aa  84.3  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3380  hypothetical protein  24.53 
 
 		 376 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.300528  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1871  membrane protein YubA  24.53 
 
 		 373 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  23.32 
 
 		 393 aa  84  0.000000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5379  protein of unknown function UPF0118  23.43 
 
 		 650 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.613329  normal  0.237029 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2014  hypothetical protein  24.59 
 
 		 352 aa  83.6  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2009  hypothetical protein  24.59 
 
 		 352 aa  83.6  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2995  hypothetical protein  22.99 
 
 		 377 aa  83.6  0.000000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1635  hypothetical protein  23.94 
 
 		 357 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.546399  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1892  putative GAF sensor protein  20.94 
 
 		 824 aa  83.2  0.000000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.397553 
 
 
-
 
NC_004310  BR0713  permease, putative  27.68 
 
 		 382 aa  83.2  0.000000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.658083  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2253  putative permease  24.79 
 
 		 389 aa  83.2  0.000000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4584  protein of unknown function UPF0118  21.28 
 
 		 652 aa  83.2  0.000000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.113593  normal  0.096848 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0793  hypothetical protein  27.33 
 
 		 379 aa  82.4  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114477  normal  0.678459 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4731  protein of unknown function UPF0118  20.88 
 
 		 649 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0106944 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0555  hypothetical protein  21.99 
 
 		 380 aa  82.8  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.11052 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0061  hypothetical protein  26.44 
 
 		 383 aa  82.4  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0304  protein of unknown function UPF0118  20.73 
 
 		 650 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.10955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1354  hypothetical protein  25.45 
 
 		 375 aa  81.6  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000360215  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3083  hypothetical protein  26.07 
 
 		 373 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000376158  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4560  hypothetical protein  22.07 
 
 		 668 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.119566 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0703  putative permease  27.38 
 
 		 382 aa  80.9  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4214  hypothetical protein  20.95 
 
 		 652 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0784859  normal  0.378864 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0571  hypothetical protein  21.56 
 
 		 347 aa  81.3  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.442056  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0725  protein of unknown function UPF0118  21.56 
 
 		 347 aa  81.3  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0808655  hitchhiker  0.000000275011 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  29.56 
 
 		 349 aa  80.9  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  25.32 
 
 		 341 aa  81.3  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3452  hypothetical protein  23.88 
 
 		 394 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5020  protein of unknown function UPF0118  22.07 
 
 		 679 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247687  normal  0.0740005 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  25.3 
 
 		 369 aa  80.9  0.00000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0257  response regulator receiver domain-containing protein  21.62 
 
 		 357 aa  80.1  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.492639 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1781  protein of unknown function UPF0118  24.85 
 
 		 368 aa  80.1  0.00000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.836553  hitchhiker  0.00769603 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2153  protein of unknown function UPF0118  26.33 
 
 		 358 aa  80.5  0.00000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2806  hypothetical protein  29.59 
 
 		 372 aa  80.1  0.00000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.217461  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2435  hypothetical protein  23.18 
 
 		 358 aa  80.1  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0853714  normal  0.0537169 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0779  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  23.18 
 
 		 375 aa  79.7  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.770407  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2927  transport protein  22.31 
 
 		 405 aa  79.7  0.00000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.799818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  26.9 
 
 		 379 aa  79.3  0.00000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1233  membrane transporter  22.89 
 
 		 650 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0210631  normal  0.375468 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1381  hypothetical protein  23.23 
 
 		 384 aa  79.3  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0728  protein of unknown function UPF0118  24.67 
 
 		 363 aa  79  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>