More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4116 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4116  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 		 360 aa  705    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.614918  normal  0.119486 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0136  protein of unknown function UPF0118  61.7 
 
 		 387 aa  435  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.291617  normal  0.459798 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2927  permease  49.86 
 
 		 365 aa  328  8e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241708  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0663  protein of unknown function UPF0118  47.7 
 
 		 373 aa  300  3e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.177633 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3310  protein of unknown function UPF0118  47.06 
 
 		 354 aa  273  3e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4013  protein of unknown function UPF0118  37.65 
 
 		 389 aa  219  7e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00579473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2317  protein of unknown function UPF0118  35.51 
 
 		 377 aa  209  6e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.255461 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2957  hypothetical protein  37.68 
 
 		 366 aa  203  4e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3362  protein of unknown function UPF0118  35.06 
 
 		 367 aa  199  9e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0425381  normal  0.231326 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5612  protein of unknown function UPF0118  35.23 
 
 		 383 aa  180  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1233  protein of unknown function UPF0118  34.1 
 
 		 370 aa  177  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0667714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2697  transport protein  33.64 
 
 		 371 aa  176  5e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0215163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6357  protein of unknown function UPF0118  34.12 
 
 		 363 aa  162  9e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2050  hypothetical protein  28.25 
 
 		 368 aa  127  3e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116574  hitchhiker  0.00000000347502 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  27.59 
 
 		 370 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1773  hypothetical protein  26.59 
 
 		 357 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000027115  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  28.29 
 
 		 343 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2298  hypothetical protein  27.65 
 
 		 371 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0296876 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  25.91 
 
 		 405 aa  114  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  26.21 
 
 		 402 aa  111  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  26.21 
 
 		 402 aa  111  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3083  hypothetical protein  28.74 
 
 		 373 aa  110  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000376158  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2001  permease  26.99 
 
 		 371 aa  109  6e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3669  hypothetical protein  26.84 
 
 		 390 aa  109  7.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0190  hypothetical protein  27.41 
 
 		 356 aa  108  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3381  membrane protein YubA  29.13 
 
 		 373 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00559166  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2774  hypothetical protein  27.78 
 
 		 348 aa  107  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3380  hypothetical protein  28.06 
 
 		 376 aa  107  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.300528  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3144  hypothetical protein  25.3 
 
 		 393 aa  106  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0744058  normal  0.288256 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3355  hypothetical protein  28.06 
 
 		 373 aa  106  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3161  hypothetical protein  28.83 
 
 		 376 aa  106  6e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000118258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3145  permease  28.83 
 
 		 376 aa  106  6e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000188051  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3410  hypothetical protein  28.83 
 
 		 376 aa  106  6e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  26.73 
 
 		 351 aa  106  6e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3380  hypothetical protein  28.83 
 
 		 373 aa  106  6e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1871  membrane protein YubA  27.46 
 
 		 373 aa  106  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6648  putative phytochrome sensor protein  24.79 
 
 		 805 aa  106  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3055  permease  28.83 
 
 		 376 aa  106  7e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0055436  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0633  hypothetical protein  24.54 
 
 		 348 aa  106  7e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0451762  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  27.71 
 
 		 392 aa  104  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1364  protein of unknown function UPF0118  25.48 
 
 		 420 aa  104  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3095  hypothetical protein  26.89 
 
 		 393 aa  103  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  28.3 
 
 		 341 aa  103  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0571  hypothetical protein  27.38 
 
 		 347 aa  103  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.442056  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0725  protein of unknown function UPF0118  27.38 
 
 		 347 aa  103  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0808655  hitchhiker  0.000000275011 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1669  putative transport protein  27.47 
 
 		 352 aa  102  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1693  putative transport protein  27.95 
 
 		 344 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.31551  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2575  hypothetical protein  26.38 
 
 		 415 aa  102  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41372  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1709  putative transport protein  27.47 
 
 		 352 aa  102  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0814358  hitchhiker  0.000224346 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1556  hypothetical protein  30.67 
 
 		 407 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1561  putative transport protein  27.47 
 
 		 352 aa  102  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.421411  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1581  putative transport protein  27.5 
 
 		 344 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.180816 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1649  putative transport protein  27.5 
 
 		 344 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0632  hypothetical protein  28.62 
 
 		 348 aa  101  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000226632  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1860  putative transport protein  27.5 
 
 		 344 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1590  putative transport protein  27.5 
 
 		 344 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2158  hypothetical protein  25.53 
 
 		 387 aa  100  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1408  hypothetical protein  28.74 
 
 		 372 aa  100  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.285024  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  27.05 
 
 		 345 aa  100  6e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  26.65 
 
 		 390 aa  99.8  7e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2065  protein of unknown function UPF0118  27.59 
 
 		 358 aa  99.4  8e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.742659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1428  hypothetical protein  24.41 
 
 		 547 aa  98.6  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1354  permease  28.7 
 
 		 350 aa  98.6  2e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0225  protein of unknown function UPF0118  27.78 
 
 		 345 aa  98.6  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000651141  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  26.07 
 
 		 369 aa  97.8  2e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1889  putative transport protein  25.71 
 
 		 350 aa  97.4  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000651778 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2087  hypothetical protein  28.43 
 
 		 353 aa  97.4  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.257402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0793  hypothetical protein  25.47 
 
 		 379 aa  97.1  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114477  normal  0.678459 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2927  transport protein  22.55 
 
 		 405 aa  97.1  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.799818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0555  hypothetical protein  25.68 
 
 		 380 aa  96.3  7e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.11052 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  23.12 
 
 		 396 aa  96.3  8e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2668  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  25.32 
 
 		 665 aa  96.3  8e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3424  hypothetical protein  26.22 
 
 		 403 aa  95.1  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000157289  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4060  hypothetical protein  25.88 
 
 		 404 aa  95.5  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000137982  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0713  permease, putative  24.39 
 
 		 382 aa  94.7  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.658083  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2253  putative permease  27.22 
 
 		 389 aa  95.1  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0257  response regulator receiver domain-containing protein  23.42 
 
 		 357 aa  94.7  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.492639 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0263  protein of unknown function UPF0118  22.96 
 
 		 369 aa  94.4  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.120153  normal  0.560864 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3129  hypothetical protein  23.71 
 
 		 418 aa  95.1  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0304  protein of unknown function UPF0118  22.44 
 
 		 650 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.10955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  26.67 
 
 		 344 aa  94  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3407  hypothetical protein  30.84 
 
 		 407 aa  94  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3329  hypothetical protein  25.08 
 
 		 365 aa  93.6  5e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63767  normal  0.12265 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2995  hypothetical protein  27.76 
 
 		 377 aa  93.2  6e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0703  putative permease  24.09 
 
 		 382 aa  93.2  7e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1973  hypothetical protein  27.94 
 
 		 369 aa  92.8  9e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0953876  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2752  permease PerM  25.62 
 
 		 362 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3845  hypothetical protein  22.05 
 
 		 406 aa  92  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.521345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2055  hypothetical protein  27.86 
 
 		 380 aa  92.4  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00006507  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  24.92 
 
 		 374 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3116  membrane transporter  22.05 
 
 		 388 aa  92  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1964  hypothetical protein  22.15 
 
 		 378 aa  92.4  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  23.34 
 
 		 355 aa  92  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  23.34 
 
 		 355 aa  92  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  23.6 
 
 		 355 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  23.6 
 
 		 355 aa  91.7  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  23.6 
 
 		 355 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2861  permease PerM  25.62 
 
 		 362 aa  92  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  23.6 
 
 		 355 aa  91.3  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2640  permease PerM  25.62 
 
 		 355 aa  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.419277  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>