More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2055 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_2055  hypothetical protein  100 
 
 		 380 aa  750    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00006507  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  27.83 
 
 		 363 aa  102  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  24.78 
 
 		 361 aa  101  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  25.38 
 
 		 393 aa  99.4  9e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0728  protein of unknown function UPF0118  26.53 
 
 		 363 aa  99  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  23.86 
 
 		 361 aa  96.7  7e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  23.86 
 
 		 361 aa  96.7  7e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  25.96 
 
 		 354 aa  96.7  7e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  25.57 
 
 		 351 aa  95.9  9e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  24.4 
 
 		 373 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  24.4 
 
 		 361 aa  95.5  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  24.4 
 
 		 361 aa  95.5  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  24.4 
 
 		 361 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  24.4 
 
 		 361 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  24.29 
 
 		 348 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  24.29 
 
 		 348 aa  95.1  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  27.78 
 
 		 355 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  27.78 
 
 		 355 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1623  PerM family permease  26.27 
 
 		 367 aa  94  4e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.134997 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0136  protein of unknown function UPF0118  27.51 
 
 		 387 aa  94  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.291617  normal  0.459798 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  25.07 
 
 		 361 aa  93.6  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  23.82 
 
 		 343 aa  92.8  9e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  25.96 
 
 		 370 aa  92.4  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  27.47 
 
 		 355 aa  92.4  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  27.47 
 
 		 355 aa  92.4  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  27.47 
 
 		 355 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  27.47 
 
 		 355 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2050  hypothetical protein  27.14 
 
 		 368 aa  92.4  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116574  hitchhiker  0.00000000347502 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  27.47 
 
 		 355 aa  92.4  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1855  hypothetical protein  26.27 
 
 		 368 aa  92  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0735664  normal  0.142574 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002790  permease PerM  25.42 
 
 		 357 aa  91.7  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2927  permease  26.07 
 
 		 365 aa  91.7  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241708  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  24.06 
 
 		 390 aa  91.7  2e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1156  permease  23.15 
 
 		 382 aa  91.7  2e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0866214  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1144  hypothetical protein  23.98 
 
 		 354 aa  90.1  5e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  unclonable  0.00155039  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1003  permease  28.38 
 
 		 350 aa  90.5  5e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0492002  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  23.21 
 
 		 396 aa  90.1  6e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  26.18 
 
 		 355 aa  89.7  8e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  25.97 
 
 		 402 aa  89.4  9e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  25.97 
 
 		 402 aa  89.4  9e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1635  hypothetical protein  28.2 
 
 		 357 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.546399  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0663  protein of unknown function UPF0118  25.9 
 
 		 373 aa  88.6  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.177633 
 
 
-
 
NC_002950  PG1950  hypothetical protein  24.58 
 
 		 386 aa  87.8  3e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  24.85 
 
 		 369 aa  87.4  3e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2994  hypothetical protein  26.43 
 
 		 360 aa  87  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687092 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3308  protein of unknown function UPF0118  25.75 
 
 		 452 aa  87  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783017  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0657  permease  23.7 
 
 		 384 aa  86.3  7e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.036358  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  23.1 
 
 		 405 aa  85.1  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2859  protein of unknown function UPF0118  25.36 
 
 		 356 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.262918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2774  hypothetical protein  24.8 
 
 		 356 aa  84.3  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0353755  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2453  protein of unknown function UPF0118  25.36 
 
 		 356 aa  84.3  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.563612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1762  hypothetical protein  22.99 
 
 		 329 aa  84.3  0.000000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1439  hypothetical protein  24.54 
 
 		 366 aa  84  0.000000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0335022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4116  protein of unknown function UPF0118  28.09 
 
 		 360 aa  83.6  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.614918  normal  0.119486 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1964  hypothetical protein  24.58 
 
 		 378 aa  83.2  0.000000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4523  hypothetical protein  28.09 
 
 		 355 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0610501  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4051  hypothetical protein  28.12 
 
 		 354 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1667  hypothetical protein  28.12 
 
 		 357 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.629251 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1702  permease, putative  26.82 
 
 		 357 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.303674  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3310  protein of unknown function UPF0118  25.65 
 
 		 354 aa  81.6  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3687  hypothetical protein  27.11 
 
 		 357 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000304887 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1265  hypothetical protein  28.69 
 
 		 357 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0876555 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03191  hypothetical protein  25.07 
 
 		 356 aa  82  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4001  hypothetical protein  25.15 
 
 		 368 aa  81.6  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.591053 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1773  hypothetical protein  25.22 
 
 		 357 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000027115  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3102  hypothetical protein  26.17 
 
 		 352 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1242  protein of unknown function UPF0118  26.51 
 
 		 374 aa  81.3  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  hitchhiker  0.00297495 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0120  protein of unknown function UPF0118  25.9 
 
 		 436 aa  80.9  0.00000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0571  hypothetical protein  25.98 
 
 		 347 aa  80.9  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.442056  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0725  protein of unknown function UPF0118  25.98 
 
 		 347 aa  80.9  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0808655  hitchhiker  0.000000275011 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1556  hypothetical protein  25.28 
 
 		 407 aa  80.1  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1297  hypothetical protein  29.59 
 
 		 382 aa  79.3  0.00000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.675511  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2624  ABC transporter permease  24.39 
 
 		 356 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.138735  normal  0.255995 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4473  hypothetical protein  27.78 
 
 		 356 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17401  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1354  hypothetical protein  25.75 
 
 		 375 aa  79  0.0000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000360215  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  24.93 
 
 		 379 aa  79.3  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0910  hypothetical protein  22.22 
 
 		 379 aa  79  0.0000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1225  hypothetical protein  27.49 
 
 		 357 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.220929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2899  hypothetical protein  22.22 
 
 		 344 aa  79  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0256984  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2491  protein of unknown function UPF0118  23.4 
 
 		 353 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1096  protein of unknown function UPF0118  25.3 
 
 		 374 aa  77.8  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.771823  hitchhiker  0.00624948 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  24.5 
 
 		 349 aa  77.8  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0225  protein of unknown function UPF0118  22.36 
 
 		 345 aa  77.4  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000651141  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0633  hypothetical protein  24.71 
 
 		 348 aa  77  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0451762  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  24.46 
 
 		 341 aa  77  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1880  hypothetical protein  24.79 
 
 		 372 aa  76.6  0.0000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0162246  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0742  protein of unknown function UPF0118  28.13 
 
 		 361 aa  76.3  0.0000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2668  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  25.93 
 
 		 665 aa  76.3  0.0000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1315  protein of unknown function UPF0118  27.92 
 
 		 369 aa  76.3  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.494628  normal  0.216518 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0823  protein of unknown function UPF0118  24.86 
 
 		 358 aa  75.5  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74505  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2250  permease  26.2 
 
 		 368 aa  75.5  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  26.25 
 
 		 374 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3144  hypothetical protein  24.72 
 
 		 393 aa  74.7  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0744058  normal  0.288256 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02243  permease  26.61 
 
 		 388 aa  74.7  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2536  hypothetical protein  25.9 
 
 		 364 aa  75.1  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2759  protein of unknown function UPF0118  24.72 
 
 		 368 aa  75.1  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.163255  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2169  hypothetical protein  25.07 
 
 		 368 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.215488  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  23.6 
 
 		 351 aa  75.1  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  27.03 
 
 		 345 aa  74.3  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0961  protein of unknown function UPF0118  25.63 
 
 		 382 aa  74.3  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685895 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>