More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2899 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2899  hypothetical protein  100 
 
 		 344 aa  687    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0256984  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2922  protein of unknown function UPF0118  57.73 
 
 		 357 aa  412  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.512956  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0633  hypothetical protein  53.59 
 
 		 348 aa  367  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0451762  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2454  hypothetical protein  53.41 
 
 		 346 aa  356  2.9999999999999997e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.435435  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2774  hypothetical protein  53.14 
 
 		 348 aa  348  8e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0632  hypothetical protein  38.44 
 
 		 348 aa  229  5e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000226632  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2773  hypothetical protein  34.11 
 
 		 350 aa  191  1e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2453  hypothetical protein  35.19 
 
 		 350 aa  191  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.426579  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  29.39 
 
 		 343 aa  138  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02140  putative permease  32.46 
 
 		 357 aa  138  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0913386  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2481  hypothetical protein  29.97 
 
 		 356 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.691389  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1408  hypothetical protein  29.28 
 
 		 372 aa  130  3e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.285024  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2087  hypothetical protein  28.96 
 
 		 353 aa  129  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.257402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3687  hypothetical protein  27.24 
 
 		 357 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000304887 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0823  protein of unknown function UPF0118  25.76 
 
 		 358 aa  124  3e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74505  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3187  putative permease  29.73 
 
 		 357 aa  123  4e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.295884  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1702  permease, putative  27.16 
 
 		 357 aa  123  4e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.303674  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1265  hypothetical protein  27.19 
 
 		 357 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0876555 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  26.02 
 
 		 374 aa  120  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1635  hypothetical protein  26.79 
 
 		 357 aa  119  7e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.546399  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1855  hypothetical protein  28.01 
 
 		 368 aa  119  7e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0735664  normal  0.142574 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2201  hypothetical protein  26.14 
 
 		 365 aa  119  7.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000750597  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1225  hypothetical protein  26.71 
 
 		 357 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.220929  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1667  hypothetical protein  27.19 
 
 		 357 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.629251 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0190  hypothetical protein  28.48 
 
 		 356 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4051  hypothetical protein  27.19 
 
 		 354 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02385  predicted inner membrane protein  27.06 
 
 		 353 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0762767  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1176  protein of unknown function UPF0118  27.06 
 
 		 353 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.412561  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  23.68 
 
 		 396 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3715  putative permease, PerM family  27.06 
 
 		 353 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3308  protein of unknown function UPF0118  28.3 
 
 		 452 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783017  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1183  hypothetical protein  27.06 
 
 		 353 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0538168 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2775  PerM family permease  27.06 
 
 		 353 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0215248  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2627  PerM family permease  27.06 
 
 		 353 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0928  permease  25.4 
 
 		 361 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.335153 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2640  PerM family permease  27.06 
 
 		 353 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02347  hypothetical protein  27.06 
 
 		 353 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.106827  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2867  putative permease, PerM family  27.06 
 
 		 353 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.697689  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0779  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  27.3 
 
 		 375 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.770407  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2435  hypothetical protein  27.3 
 
 		 358 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0853714  normal  0.0537169 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2994  hypothetical protein  26.28 
 
 		 360 aa  116  6e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687092 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02243  permease  27.71 
 
 		 388 aa  116  6e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1623  PerM family permease  26.93 
 
 		 367 aa  115  7.999999999999999e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.134997 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  25.71 
 
 		 379 aa  115  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002790  permease PerM  26.5 
 
 		 357 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1990  protein of unknown function UPF0118  25.63 
 
 		 372 aa  114  3e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2482  hypothetical protein  25.82 
 
 		 359 aa  114  3e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1003  permease  27.99 
 
 		 350 aa  113  4.0000000000000004e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0492002  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2382  membrane protein  25.71 
 
 		 355 aa  113  5e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  26.23 
 
 		 345 aa  113  5e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2861  permease PerM  26.47 
 
 		 362 aa  112  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2730  permease PerM  26.47 
 
 		 362 aa  112  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.659097  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2752  permease PerM  26.47 
 
 		 362 aa  112  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2688  permease PerM  26.47 
 
 		 355 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2640  permease PerM  26.47 
 
 		 355 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.419277  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3512  hypothetical protein  25.07 
 
 		 356 aa  111  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.293962  normal  0.922433 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  24.4 
 
 		 341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1649  hypothetical protein  26.26 
 
 		 360 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.673436  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1964  hypothetical protein  26.32 
 
 		 378 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1660  hypothetical protein  28.85 
 
 		 356 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0400  hypothetical protein  26.86 
 
 		 357 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1240  putative permease PerM  25.17 
 
 		 354 aa  110  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00935863  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3128  putative permease PerM  25.17 
 
 		 354 aa  110  5e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00611871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1357  hypothetical protein  25.17 
 
 		 354 aa  110  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1757  hypothetical protein  24.91 
 
 		 360 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.805933  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1297  hypothetical protein  28.16 
 
 		 382 aa  108  9.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.675511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1781  protein of unknown function UPF0118  26.02 
 
 		 368 aa  108  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.836553  hitchhiker  0.00769603 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  24.13 
 
 		 349 aa  108  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  25.08 
 
 		 349 aa  108  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4013  protein of unknown function UPF0118  31.4 
 
 		 389 aa  107  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00579473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  24.92 
 
 		 351 aa  108  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1742  putative permease PerM  26.2 
 
 		 354 aa  107  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0793  hypothetical protein  28.43 
 
 		 379 aa  107  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114477  normal  0.678459 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2977  hypothetical protein  26.71 
 
 		 353 aa  107  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.283703 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0728  protein of unknown function UPF0118  24.61 
 
 		 363 aa  107  4e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  26.54 
 
 		 393 aa  105  9e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  25.95 
 
 		 405 aa  105  1e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2574  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.21 
 
 		 356 aa  105  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  24.46 
 
 		 363 aa  105  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2339  protein of unknown function UPF0118  26.02 
 
 		 370 aa  105  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2065  hypothetical protein  26.02 
 
 		 370 aa  105  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.76219  normal  0.0900338 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0971  protein of unknown function UPF0118  27.58 
 
 		 389 aa  104  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0710399 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  25.41 
 
 		 351 aa  105  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1973  hypothetical protein  24.02 
 
 		 369 aa  104  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0953876  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0259  protein of unknown function UPF0118  27.92 
 
 		 356 aa  104  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  24.05 
 
 		 390 aa  104  2e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2025  protein of unknown function UPF0118  26.33 
 
 		 370 aa  104  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.653838 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  23.32 
 
 		 354 aa  103  4e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0961  protein of unknown function UPF0118  25.96 
 
 		 382 aa  103  5e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685895 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1495  protein of unknown function UPF0118  26.73 
 
 		 354 aa  103  5e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0496073  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2536  hypothetical protein  24.84 
 
 		 364 aa  103  5e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  23.1 
 
 		 355 aa  102  8e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1300  hypothetical protein  25.24 
 
 		 434 aa  102  9e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.493989  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  23.1 
 
 		 355 aa  102  9e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  22.78 
 
 		 355 aa  102  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  23.1 
 
 		 355 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  23.1 
 
 		 355 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  23.1 
 
 		 355 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1911  hypothetical protein  24.13 
 
 		 372 aa  101  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2345  hypothetical protein  25.18 
 
 		 366 aa  102  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000997744 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>