More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4013 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4013  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 		 389 aa  763    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00579473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5612  protein of unknown function UPF0118  48.52 
 
 		 383 aa  290  3e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2927  permease  36.42 
 
 		 365 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241708  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0136  protein of unknown function UPF0118  35.96 
 
 		 387 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.291617  normal  0.459798 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4116  protein of unknown function UPF0118  37.74 
 
 		 360 aa  204  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.614918  normal  0.119486 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0663  protein of unknown function UPF0118  34.22 
 
 		 373 aa  190  2.9999999999999997e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.177633 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3310  protein of unknown function UPF0118  35.42 
 
 		 354 aa  177  3e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2697  transport protein  31.6 
 
 		 371 aa  175  9.999999999999999e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0215163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6357  protein of unknown function UPF0118  31.86 
 
 		 363 aa  172  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2957  hypothetical protein  31.29 
 
 		 366 aa  169  1e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2317  protein of unknown function UPF0118  29.97 
 
 		 377 aa  151  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.255461 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  30.56 
 
 		 370 aa  139  7e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3362  protein of unknown function UPF0118  30.23 
 
 		 367 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0425381  normal  0.231326 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2050  hypothetical protein  29.85 
 
 		 368 aa  133  6.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116574  hitchhiker  0.00000000347502 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1233  protein of unknown function UPF0118  28.53 
 
 		 370 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0667714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3669  hypothetical protein  28.53 
 
 		 390 aa  128  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3095  hypothetical protein  28.01 
 
 		 393 aa  128  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0555  hypothetical protein  28.61 
 
 		 380 aa  125  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.11052 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  30.33 
 
 		 343 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  31.79 
 
 		 354 aa  124  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  33.84 
 
 		 345 aa  122  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0632  hypothetical protein  27.95 
 
 		 348 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000226632  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3355  hypothetical protein  31.93 
 
 		 373 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1762  hypothetical protein  29.81 
 
 		 329 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3083  hypothetical protein  30.72 
 
 		 373 aa  117  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000376158  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2453  protein of unknown function UPF0118  29.97 
 
 		 356 aa  117  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.563612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1871  membrane protein YubA  31.33 
 
 		 373 aa  116  5e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  31.44 
 
 		 374 aa  117  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3380  hypothetical protein  31.02 
 
 		 376 aa  116  6e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.300528  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5154  hypothetical protein  31.1 
 
 		 663 aa  116  6e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3380  hypothetical protein  30.77 
 
 		 373 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3161  hypothetical protein  30.77 
 
 		 376 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000118258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3145  permease  30.77 
 
 		 376 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000188051  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3055  permease  30.77 
 
 		 376 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0055436  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6648  putative phytochrome sensor protein  30.47 
 
 		 805 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3410  hypothetical protein  30.77 
 
 		 376 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2859  protein of unknown function UPF0118  29.36 
 
 		 356 aa  116  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.262918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  26.57 
 
 		 363 aa  115  8.999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  29.07 
 
 		 392 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3381  membrane protein YubA  31.02 
 
 		 373 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00559166  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2560  hypothetical protein  29.08 
 
 		 644 aa  114  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  27.52 
 
 		 349 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1364  protein of unknown function UPF0118  28.09 
 
 		 420 aa  112  8.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  28.88 
 
 		 344 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  27.38 
 
 		 402 aa  112  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5162  hypothetical protein  31.02 
 
 		 382 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235316  normal  0.0183443 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3452  hypothetical protein  26.59 
 
 		 394 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2298  hypothetical protein  25 
 
 		 371 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0296876 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1773  hypothetical protein  28.06 
 
 		 357 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000027115  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  27.38 
 
 		 402 aa  112  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  28.12 
 
 		 405 aa  110  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0633  hypothetical protein  26.56 
 
 		 348 aa  110  6e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0451762  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02243  permease  29.77 
 
 		 388 aa  109  9.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2774  hypothetical protein  28.84 
 
 		 348 aa  108  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  30.7 
 
 		 361 aa  108  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1242  protein of unknown function UPF0118  30 
 
 		 374 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  hitchhiker  0.00297495 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  30.48 
 
 		 390 aa  108  2e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2899  hypothetical protein  31.4 
 
 		 344 aa  107  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0256984  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1477  protein of unknown function UPF0118  28.7 
 
 		 329 aa  107  5e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4731  protein of unknown function UPF0118  27.36 
 
 		 649 aa  106  6e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0106944 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1964  hypothetical protein  26.44 
 
 		 378 aa  106  6e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1431  hypothetical protein  28.45 
 
 		 606 aa  106  6e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.145958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5545  protein of unknown function UPF0118  30.12 
 
 		 375 aa  106  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0252141  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2339  protein of unknown function UPF0118  30.82 
 
 		 370 aa  106  7e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8661  protein of unknown function UPF0118  28.9 
 
 		 386 aa  106  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2065  hypothetical protein  30.82 
 
 		 370 aa  106  7e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.76219  normal  0.0900338 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  27.75 
 
 		 396 aa  106  8e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4144  putative phytochrome sensor protein  29.89 
 
 		 821 aa  106  8e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0677009 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0190  hypothetical protein  27.86 
 
 		 356 aa  106  9e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2806  hypothetical protein  28.96 
 
 		 372 aa  105  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.217461  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1408  hypothetical protein  30.53 
 
 		 372 aa  105  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.285024  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1096  protein of unknown function UPF0118  28.93 
 
 		 374 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.771823  hitchhiker  0.00624948 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  30 
 
 		 361 aa  105  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2624  ABC transporter permease  28.48 
 
 		 356 aa  105  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.138735  normal  0.255995 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2575  hypothetical protein  28.43 
 
 		 415 aa  104  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41372  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2994  hypothetical protein  29.52 
 
 		 360 aa  104  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687092 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0657  permease  29.55 
 
 		 384 aa  103  4e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.036358  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2233  hypothetical protein  26.03 
 
 		 379 aa  103  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.195735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1635  hypothetical protein  28.1 
 
 		 357 aa  103  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.546399  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2454  hypothetical protein  28.85 
 
 		 346 aa  102  8e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.435435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  29.35 
 
 		 348 aa  102  8e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  29.47 
 
 		 393 aa  103  8e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  29.35 
 
 		 373 aa  102  9e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  28.06 
 
 		 379 aa  102  9e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  29.35 
 
 		 361 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  29.35 
 
 		 361 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2488  hypothetical protein  31.6 
 
 		 358 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.568242 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  29.35 
 
 		 348 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3329  hypothetical protein  28.12 
 
 		 365 aa  102  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63767  normal  0.12265 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  29.35 
 
 		 361 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  29.35 
 
 		 361 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  29.17 
 
 		 369 aa  101  2e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6859  protein of unknown function UPF0118  29.43 
 
 		 662 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.810171 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2075  hypothetical protein  27.48 
 
 		 385 aa  102  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381466  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  29.26 
 
 		 361 aa  100  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  29.26 
 
 		 361 aa  100  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2491  protein of unknown function UPF0118  29.24 
 
 		 353 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1354  hypothetical protein  29.39 
 
 		 375 aa  100  3e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000360215  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4214  hypothetical protein  27.23 
 
 		 652 aa  100  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0784859  normal  0.378864 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1297  hypothetical protein  27.27 
 
 		 382 aa  100  5e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.675511  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>