More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6357 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6357  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 		 363 aa  721    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2697  transport protein  33.64 
 
 		 371 aa  199  6e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0215163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0663  protein of unknown function UPF0118  31.76 
 
 		 373 aa  191  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.177633 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4013  protein of unknown function UPF0118  31.86 
 
 		 389 aa  179  8e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00579473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0136  protein of unknown function UPF0118  31.53 
 
 		 387 aa  175  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.291617  normal  0.459798 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2927  permease  30.3 
 
 		 365 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241708  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3310  protein of unknown function UPF0118  30.67 
 
 		 354 aa  160  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4116  protein of unknown function UPF0118  34.06 
 
 		 360 aa  156  6e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.614918  normal  0.119486 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2957  hypothetical protein  28.57 
 
 		 366 aa  155  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3362  protein of unknown function UPF0118  29.48 
 
 		 367 aa  139  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0425381  normal  0.231326 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2317  protein of unknown function UPF0118  25.82 
 
 		 377 aa  139  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.255461 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5612  protein of unknown function UPF0118  28.25 
 
 		 383 aa  131  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1233  protein of unknown function UPF0118  26.46 
 
 		 370 aa  126  7e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0667714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2298  hypothetical protein  25 
 
 		 371 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0296876 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1164  hypothetical protein  31.12 
 
 		 457 aa  116  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.23073  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4598  hypothetical protein  27.56 
 
 		 363 aa  110  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.267905  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  23.93 
 
 		 363 aa  105  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1477  protein of unknown function UPF0118  27.19 
 
 		 329 aa  99.4  8e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02243  permease  25.62 
 
 		 388 aa  99  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5154  hypothetical protein  25.21 
 
 		 663 aa  99.4  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  26.11 
 
 		 370 aa  98.6  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2488  hypothetical protein  26.86 
 
 		 358 aa  97.1  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.568242 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2560  hypothetical protein  24.53 
 
 		 644 aa  97.1  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2075  hypothetical protein  25.37 
 
 		 385 aa  96.7  6e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381466  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1773  hypothetical protein  27.22 
 
 		 357 aa  96.3  8e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000027115  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3355  hypothetical protein  26.79 
 
 		 373 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0322  hypothetical protein  27.94 
 
 		 487 aa  94.7  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.084246  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2050  hypothetical protein  25.47 
 
 		 368 aa  95.1  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116574  hitchhiker  0.00000000347502 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  24.24 
 
 		 344 aa  95.1  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  27.16 
 
 		 341 aa  94  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3380  hypothetical protein  26.17 
 
 		 376 aa  93.6  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.300528  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1871  membrane protein YubA  25.86 
 
 		 373 aa  93.6  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3381  membrane protein YubA  26.79 
 
 		 373 aa  93.6  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00559166  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5642  protein of unknown function UPF0118  33.54 
 
 		 361 aa  93.6  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.45964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1236  protein of unknown function UPF0118  28.48 
 
 		 439 aa  93.2  6e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000518014 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  25.32 
 
 		 390 aa  92.8  8e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3161  hypothetical protein  26.17 
 
 		 376 aa  92.4  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000118258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3145  permease  26.17 
 
 		 376 aa  92.4  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000188051  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3055  permease  26.17 
 
 		 376 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0055436  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3410  hypothetical protein  26.17 
 
 		 376 aa  92.4  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1161  hypothetical protein  27.36 
 
 		 415 aa  92  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3380  hypothetical protein  26.48 
 
 		 373 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3083  hypothetical protein  26.48 
 
 		 373 aa  92.4  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000376158  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3687  hypothetical protein  24.17 
 
 		 357 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000304887 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4560  hypothetical protein  19.95 
 
 		 668 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.119566 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  23.56 
 
 		 343 aa  91.3  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5020  protein of unknown function UPF0118  19.95 
 
 		 679 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247687  normal  0.0740005 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3144  hypothetical protein  22.97 
 
 		 393 aa  90.9  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0744058  normal  0.288256 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4214  hypothetical protein  23.66 
 
 		 652 aa  90.5  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0784859  normal  0.378864 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0457  hypothetical protein  26.39 
 
 		 383 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  27.67 
 
 		 361 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  27.67 
 
 		 373 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  27.67 
 
 		 348 aa  90.1  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  27.44 
 
 		 361 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  27.44 
 
 		 361 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4584  protein of unknown function UPF0118  23.45 
 
 		 652 aa  89.7  8e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.113593  normal  0.096848 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0571  hypothetical protein  26.51 
 
 		 347 aa  89.7  8e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.442056  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0725  protein of unknown function UPF0118  26.51 
 
 		 347 aa  89.7  8e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0808655  hitchhiker  0.000000275011 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  27.13 
 
 		 361 aa  89.4  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  27.13 
 
 		 361 aa  89.4  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1635  hypothetical protein  25.78 
 
 		 357 aa  89  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.546399  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  27.41 
 
 		 348 aa  89.4  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1156  permease  23.79 
 
 		 382 aa  89.4  1e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0866214  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  27.13 
 
 		 361 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  26.79 
 
 		 361 aa  88.2  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1762  hypothetical protein  25.32 
 
 		 329 aa  88.2  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1702  permease, putative  25.49 
 
 		 357 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.303674  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4731  protein of unknown function UPF0118  24.36 
 
 		 649 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0106944 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  26.11 
 
 		 392 aa  88.6  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2153  protein of unknown function UPF0118  28.62 
 
 		 358 aa  87.4  3e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2203  protein of unknown function UPF0118  25.63 
 
 		 397 aa  87.4  4e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0681126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3669  hypothetical protein  23.77 
 
 		 390 aa  87  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  25.15 
 
 		 354 aa  86.7  6e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  22.74 
 
 		 393 aa  86.7  6e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0728  protein of unknown function UPF0118  24.03 
 
 		 363 aa  86.7  7e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0279  hypothetical protein  28.57 
 
 		 423 aa  86.3  8e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0267805 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6859  protein of unknown function UPF0118  24.14 
 
 		 662 aa  86.3  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.810171 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2482  hypothetical protein  25.63 
 
 		 662 aa  85.9  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0632  hypothetical protein  24.58 
 
 		 348 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000226632  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3095  hypothetical protein  21.93 
 
 		 393 aa  85.1  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3308  protein of unknown function UPF0118  25.48 
 
 		 452 aa  84.7  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783017  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2994  hypothetical protein  27.17 
 
 		 360 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687092 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2774  hypothetical protein  24.52 
 
 		 348 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2491  protein of unknown function UPF0118  23.92 
 
 		 353 aa  84  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0657  permease  23.05 
 
 		 384 aa  82.8  0.000000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.036358  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4370  protein of unknown function UPF0118  21.37 
 
 		 652 aa  82.8  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4544  hypothetical protein  27.44 
 
 		 381 aa  82.8  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1973  hypothetical protein  25.92 
 
 		 369 aa  82.8  0.000000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0953876  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5076  protein of unknown function UPF0118  20.66 
 
 		 675 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.864281 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0456  protein of unknown function UPF0118  23.9 
 
 		 460 aa  82  0.00000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.204189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1225  hypothetical protein  23.51 
 
 		 357 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.220929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4482  protein of unknown function UPF0118  25.81 
 
 		 390 aa  82  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255906  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5305  hypothetical protein  24.91 
 
 		 464 aa  81.6  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.111321  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3372  sporulation integral membrane protein YtvI  24.79 
 
 		 353 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08190  predicted permease  25.75 
 
 		 455 aa  81.3  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0210651 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1905  hypothetical protein  24.17 
 
 		 379 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.358826 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  26.33 
 
 		 361 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1623  PerM family permease  23.53 
 
 		 367 aa  80.9  0.00000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.134997 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3116  membrane transporter  21.47 
 
 		 388 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2910  hypothetical protein  24.87 
 
 		 660 aa  81.3  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.381639  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>