More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5612 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5612  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 		 383 aa  756    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4013  protein of unknown function UPF0118  48.52 
 
 		 389 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00579473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0136  protein of unknown function UPF0118  31.43 
 
 		 387 aa  202  9.999999999999999e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.291617  normal  0.459798 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2927  permease  30.4 
 
 		 365 aa  195  1e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241708  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4116  protein of unknown function UPF0118  36.71 
 
 		 360 aa  193  4e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.614918  normal  0.119486 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0663  protein of unknown function UPF0118  33.07 
 
 		 373 aa  184  3e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.177633 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3310  protein of unknown function UPF0118  31.53 
 
 		 354 aa  172  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2957  hypothetical protein  28.85 
 
 		 366 aa  161  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2697  transport protein  28.96 
 
 		 371 aa  158  1e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0215163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1233  protein of unknown function UPF0118  30.95 
 
 		 370 aa  158  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0667714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6357  protein of unknown function UPF0118  28.09 
 
 		 363 aa  157  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3362  protein of unknown function UPF0118  31.2 
 
 		 367 aa  154  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0425381  normal  0.231326 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2317  protein of unknown function UPF0118  26.29 
 
 		 377 aa  135  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.255461 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  30.12 
 
 		 343 aa  126  6e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1364  protein of unknown function UPF0118  28.25 
 
 		 420 aa  117  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1773  hypothetical protein  27.73 
 
 		 357 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000027115  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  31.56 
 
 		 390 aa  115  2.0000000000000002e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3669  hypothetical protein  27.27 
 
 		 390 aa  113  5e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3095  hypothetical protein  27.7 
 
 		 393 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3144  hypothetical protein  25.57 
 
 		 393 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0744058  normal  0.288256 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0555  hypothetical protein  26.46 
 
 		 380 aa  110  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.11052 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  26.22 
 
 		 349 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  26.61 
 
 		 392 aa  110  5e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1892  putative GAF sensor protein  27.16 
 
 		 824 aa  108  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.397553 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  26.05 
 
 		 349 aa  107  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6648  putative phytochrome sensor protein  25.83 
 
 		 805 aa  107  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1696  putative phytochrome sensor protein  27.46 
 
 		 830 aa  107  4e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  26.72 
 
 		 396 aa  106  9e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2806  hypothetical protein  25.6 
 
 		 372 aa  105  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.217461  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2002  hypothetical protein  24.93 
 
 		 434 aa  105  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0749036  hitchhiker  0.0034214 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3116  membrane transporter  27.59 
 
 		 388 aa  104  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3845  hypothetical protein  27.59 
 
 		 406 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.521345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4051  hypothetical protein  26.91 
 
 		 354 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  29.43 
 
 		 361 aa  103  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1225  hypothetical protein  26.57 
 
 		 357 aa  103  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.220929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1265  hypothetical protein  26.79 
 
 		 357 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0876555 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1762  hypothetical protein  27.12 
 
 		 329 aa  102  9e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  27.4 
 
 		 369 aa  102  9e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1667  hypothetical protein  26.61 
 
 		 357 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.629251 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1702  permease, putative  26.39 
 
 		 357 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.303674  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3687  hypothetical protein  25.72 
 
 		 357 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000304887 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2995  hypothetical protein  27.05 
 
 		 377 aa  102  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001931  putative permease protein  26.02 
 
 		 356 aa  102  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  26.73 
 
 		 393 aa  102  1e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  29.97 
 
 		 345 aa  101  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3452  hypothetical protein  25.21 
 
 		 394 aa  102  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5379  protein of unknown function UPF0118  25.8 
 
 		 650 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.613329  normal  0.237029 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0304  protein of unknown function UPF0118  26.22 
 
 		 650 aa  101  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.10955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2233  hypothetical protein  25.47 
 
 		 379 aa  101  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.195735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  27.59 
 
 		 344 aa  100  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3083  hypothetical protein  27.22 
 
 		 373 aa  100  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000376158  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02299  hypothetical protein  27.12 
 
 		 345 aa  100  4e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.622561  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1589  protein of unknown function UPF0118  25.6 
 
 		 355 aa  100  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1352  protein of unknown function UPF0118  24.09 
 
 		 438 aa  100  5e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8661  protein of unknown function UPF0118  26.97 
 
 		 386 aa  100  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3381  membrane protein YubA  27.71 
 
 		 373 aa  100  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00559166  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3355  hypothetical protein  27.76 
 
 		 373 aa  99.8  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3314  hypothetical protein  24.49 
 
 		 353 aa  100  6e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0632  hypothetical protein  25.7 
 
 		 348 aa  100  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000226632  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5344  hypothetical protein  23.68 
 
 		 647 aa  99.8  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0275026 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  25 
 
 		 405 aa  99.8  8e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3380  hypothetical protein  27.39 
 
 		 376 aa  99.8  8e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.300528  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3615  hypothetical protein  28.25 
 
 		 412 aa  99.8  8e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5020  protein of unknown function UPF0118  24.59 
 
 		 679 aa  99.4  9e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247687  normal  0.0740005 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4731  protein of unknown function UPF0118  27.57 
 
 		 649 aa  99  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0106944 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4560  hypothetical protein  24.59 
 
 		 668 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.119566 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  25.68 
 
 		 351 aa  98.6  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1233  membrane transporter  25.8 
 
 		 650 aa  99  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0210631  normal  0.375468 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  28.48 
 
 		 361 aa  98.6  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3161  hypothetical protein  27.39 
 
 		 376 aa  98.2  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000118258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3145  permease  27.39 
 
 		 376 aa  98.2  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000188051  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3055  permease  27.39 
 
 		 376 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0055436  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3410  hypothetical protein  27.39 
 
 		 376 aa  98.2  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1665  hypothetical protein  25.82 
 
 		 382 aa  98.2  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000108955  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3380  hypothetical protein  27.39 
 
 		 373 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  27.85 
 
 		 361 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1194  protein of unknown function UPF0118  24.6 
 
 		 359 aa  97.8  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.514771  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1871  membrane protein YubA  27.13 
 
 		 373 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  27.85 
 
 		 361 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2927  transport protein  24.6 
 
 		 405 aa  97.1  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.799818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0263  protein of unknown function UPF0118  23.68 
 
 		 369 aa  97.1  5e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.120153  normal  0.560864 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2891  hypothetical protein  26.36 
 
 		 394 aa  97.1  5e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0951393  hitchhiker  0.00000885055 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1125  protein of unknown function UPF0118  24.6 
 
 		 359 aa  96.7  6e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1700  hypothetical protein  25.64 
 
 		 359 aa  96.7  6e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.23154  normal  0.0296077 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3881  hypothetical protein  24.79 
 
 		 349 aa  96.7  6e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.198688 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3329  hypothetical protein  28.19 
 
 		 365 aa  96.3  8e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63767  normal  0.12265 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  27.53 
 
 		 361 aa  96.3  8e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2298  hypothetical protein  22.44 
 
 		 371 aa  96.3  8e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0296876 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0749  protein of unknown function UPF0118  25.31 
 
 		 417 aa  95.9  9e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  27.53 
 
 		 373 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  27.53 
 
 		 361 aa  95.9  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  27.53 
 
 		 361 aa  95.9  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  27.53 
 
 		 348 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2482  hypothetical protein  23.67 
 
 		 662 aa  95.9  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1669  putative transport protein  24.32 
 
 		 352 aa  95.9  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  27.53 
 
 		 348 aa  95.9  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1709  putative transport protein  24.32 
 
 		 352 aa  95.9  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0814358  hitchhiker  0.000224346 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1561  putative transport protein  24.32 
 
 		 352 aa  95.9  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.421411  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  27.53 
 
 		 361 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4214  hypothetical protein  26.29 
 
 		 652 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0784859  normal  0.378864 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>