More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3362 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3362  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 		 367 aa  730    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0425381  normal  0.231326 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1233  protein of unknown function UPF0118  42.3 
 
 		 370 aa  267  2e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0667714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0136  protein of unknown function UPF0118  34.08 
 
 		 387 aa  248  2e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.291617  normal  0.459798 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0663  protein of unknown function UPF0118  34.5 
 
 		 373 aa  235  8e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.177633 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2927  permease  35.09 
 
 		 365 aa  231  2e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241708  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2317  protein of unknown function UPF0118  37.78 
 
 		 377 aa  229  5e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.255461 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4116  protein of unknown function UPF0118  37.22 
 
 		 360 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.614918  normal  0.119486 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2957  hypothetical protein  35.45 
 
 		 366 aa  210  3e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3310  protein of unknown function UPF0118  34.47 
 
 		 354 aa  199  6e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6357  protein of unknown function UPF0118  29.48 
 
 		 363 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4013  protein of unknown function UPF0118  29.75 
 
 		 389 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00579473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2697  transport protein  29.21 
 
 		 371 aa  162  1e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0215163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5612  protein of unknown function UPF0118  31.2 
 
 		 383 aa  157  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2298  hypothetical protein  26.05 
 
 		 371 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0296876 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4598  hypothetical protein  25 
 
 		 363 aa  103  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.267905  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  28.08 
 
 		 351 aa  102  9e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1889  putative transport protein  25.66 
 
 		 350 aa  100  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000651778 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0555  hypothetical protein  21.88 
 
 		 380 aa  98.2  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.11052 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1669  putative transport protein  24.86 
 
 		 352 aa  96.7  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0823  protein of unknown function UPF0118  27.51 
 
 		 358 aa  97.1  5e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74505  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1561  putative transport protein  24.86 
 
 		 352 aa  96.7  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.421411  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1709  putative transport protein  24.86 
 
 		 352 aa  96.7  5e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0814358  hitchhiker  0.000224346 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1164  hypothetical protein  29.73 
 
 		 457 aa  96.3  8e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.23073  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  27.71 
 
 		 371 aa  95.5  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  25.32 
 
 		 344 aa  94.4  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  25.37 
 
 		 358 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0322  hypothetical protein  28.05 
 
 		 487 aa  93.2  7e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.084246  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2087  hypothetical protein  27.54 
 
 		 353 aa  92.8  9e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.257402  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  27.44 
 
 		 396 aa  92.4  1e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  26.8 
 
 		 369 aa  91.7  2e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  20.5 
 
 		 349 aa  91.3  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1910  putative transport protein  25.22 
 
 		 344 aa  90.9  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3308  protein of unknown function UPF0118  24.52 
 
 		 452 aa  87.8  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783017  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1773  hypothetical protein  27.2 
 
 		 357 aa  87.8  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000027115  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1194  protein of unknown function UPF0118  25.08 
 
 		 359 aa  87.8  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.514771  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2379  hypothetical protein  24.78 
 
 		 345 aa  86.7  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1581  putative transport protein  24.77 
 
 		 344 aa  86.7  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.180816 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1640  transport protein  23.38 
 
 		 336 aa  85.9  9e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3380  hypothetical protein  24.6 
 
 		 376 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.300528  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0304  protein of unknown function UPF0118  24.8 
 
 		 650 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.10955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2995  hypothetical protein  26.85 
 
 		 377 aa  85.5  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1880  hypothetical protein  26.46 
 
 		 372 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0162246  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1125  protein of unknown function UPF0118  24.77 
 
 		 359 aa  85.5  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02243  permease  21.07 
 
 		 388 aa  85.5  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3314  hypothetical protein  27.09 
 
 		 353 aa  85.5  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0159  hypothetical protein  25.57 
 
 		 381 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0479062 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1693  putative transport protein  24.47 
 
 		 344 aa  85.5  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.31551  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1357  hypothetical protein  29.12 
 
 		 354 aa  85.5  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3128  putative permease PerM  29.12 
 
 		 354 aa  85.5  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00611871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0169  hypothetical protein  25.57 
 
 		 381 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2169  hypothetical protein  27.08 
 
 		 368 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.215488  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3381  membrane protein YubA  24.28 
 
 		 373 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00559166  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1240  putative permease PerM  29.12 
 
 		 354 aa  85.5  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00935863  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0178  hypothetical protein  25.57 
 
 		 381 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1590  putative transport protein  24.47 
 
 		 344 aa  84.3  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1860  putative transport protein  24.47 
 
 		 344 aa  84.3  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1649  putative transport protein  24.47 
 
 		 344 aa  84.3  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1364  protein of unknown function UPF0118  24.8 
 
 		 420 aa  84  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0457  hypothetical protein  25.63 
 
 		 383 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2382  membrane protein  27.33 
 
 		 355 aa  84.3  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3144  hypothetical protein  22.94 
 
 		 393 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0744058  normal  0.288256 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2927  transport protein  22.55 
 
 		 405 aa  84.3  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.799818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  25 
 
 		 361 aa  84  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2430  hypothetical protein  26.54 
 
 		 360 aa  84  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2311  hypothetical protein  24.35 
 
 		 354 aa  83.6  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2891  hypothetical protein  26.26 
 
 		 394 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0951393  hitchhiker  0.00000885055 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3464  hypothetical protein  22.92 
 
 		 406 aa  83.2  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384592 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1066  hypothetical protein  22.12 
 
 		 359 aa  83.2  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.283585  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2158  hypothetical protein  23.21 
 
 		 387 aa  83.2  0.000000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2153  protein of unknown function UPF0118  26.73 
 
 		 358 aa  83.2  0.000000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2014  hypothetical protein  25.66 
 
 		 352 aa  83.2  0.000000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2009  hypothetical protein  25.66 
 
 		 352 aa  83.2  0.000000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0061  hypothetical protein  23.92 
 
 		 383 aa  83.2  0.000000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4544  hypothetical protein  25.3 
 
 		 381 aa  83.2  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2557  hypothetical protein  24.86 
 
 		 404 aa  83.2  0.000000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3380  hypothetical protein  23.96 
 
 		 373 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1665  hypothetical protein  25.52 
 
 		 382 aa  82.8  0.000000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000108955  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0244  protein of unknown function UPF0118  27.78 
 
 		 376 aa  82.4  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1354  hypothetical protein  26.71 
 
 		 375 aa  82.4  0.00000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000360215  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6996  putative permease  25.08 
 
 		 372 aa  82.4  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3161  hypothetical protein  23.96 
 
 		 376 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000118258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3145  permease  23.96 
 
 		 376 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000188051  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3055  permease  23.96 
 
 		 376 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0055436  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3345  hypothetical protein  27.54 
 
 		 432 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3410  hypothetical protein  23.96 
 
 		 376 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1871  membrane protein YubA  23.96 
 
 		 373 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2977  hypothetical protein  29.27 
 
 		 353 aa  82.4  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.283703 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3758  hypothetical protein  24.62 
 
 		 349 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1144  hypothetical protein  25.36 
 
 		 354 aa  81.6  0.00000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  unclonable  0.00155039  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1973  hypothetical protein  27.06 
 
 		 369 aa  82  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0953876  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3355  hypothetical protein  23.64 
 
 		 373 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4060  hypothetical protein  23.48 
 
 		 404 aa  81.3  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000137982  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  22.22 
 
 		 402 aa  82  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3083  hypothetical protein  23.64 
 
 		 373 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000376158  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  22.22 
 
 		 402 aa  82  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1700  hypothetical protein  24.51 
 
 		 359 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.23154  normal  0.0296077 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6648  putative phytochrome sensor protein  23.16 
 
 		 805 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1003  permease  26.8 
 
 		 350 aa  81.6  0.00000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0492002  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3095  hypothetical protein  23.91 
 
 		 393 aa  81.6  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1829  hypothetical protein  28.34 
 
 		 360 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.2453  normal  0.256539 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>