More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0322 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0322  hypothetical protein  100 
 
 
487 aa  937    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.084246  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0279  hypothetical protein  85.12 
 
 
423 aa  653    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0267805 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0238  hypothetical protein  45.45 
 
 
421 aa  332  8e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.817468 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0457  hypothetical protein  49.28 
 
 
383 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0169  hypothetical protein  50 
 
 
381 aa  306  6e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0178  hypothetical protein  50 
 
 
381 aa  306  6e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0159  hypothetical protein  50 
 
 
381 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0479062 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1164  hypothetical protein  47.43 
 
 
457 aa  301  2e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.23073  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0978  hypothetical protein  48.18 
 
 
452 aa  300  4e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.42646  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4482  protein of unknown function UPF0118  51.3 
 
 
390 aa  296  5e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255906  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5305  hypothetical protein  47.5 
 
 
464 aa  295  1e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.111321  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1236  protein of unknown function UPF0118  47.43 
 
 
439 aa  283  5.000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000518014 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0195  hypothetical protein  48.39 
 
 
384 aa  283  7.000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566996  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7052  protein of unknown function UPF0118  51.73 
 
 
402 aa  281  2e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10207  transmembrane protein  46.45 
 
 
367 aa  278  2e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39490  predicted permease  50 
 
 
403 aa  273  6e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.233759  normal  0.317185 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08190  predicted permease  44.03 
 
 
455 aa  272  1e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0210651 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1161  hypothetical protein  44.95 
 
 
415 aa  267  2.9999999999999995e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2637  protein of unknown function UPF0118  47.94 
 
 
421 aa  260  4e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0938  protein of unknown function UPF0118  45.43 
 
 
420 aa  260  4e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4772  protein of unknown function UPF0118  50.14 
 
 
475 aa  259  1e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.808425  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1895  protein of unknown function UPF0118  44.29 
 
 
483 aa  244  1.9999999999999999e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588951  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23100  predicted permease  42.98 
 
 
477 aa  240  4e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.741637  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1098  protein of unknown function UPF0118  46.97 
 
 
396 aa  236  7e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.370016  normal  0.531721 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05050  predicted permease  42.09 
 
 
405 aa  226  9e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.187674  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1700  hypothetical protein  38.56 
 
 
429 aa  219  1e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00039584 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1468  protein of unknown function UPF0118  40.67 
 
 
368 aa  215  1.9999999999999998e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.916675  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2291  hypothetical protein  41.21 
 
 
407 aa  209  6e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.370535  normal  0.257699 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2203  protein of unknown function UPF0118  40.38 
 
 
397 aa  202  1.9999999999999998e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0681126  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08290  predicted permease  39.94 
 
 
367 aa  198  2.0000000000000003e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21060  predicted permease  37.87 
 
 
436 aa  196  1e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.152627  normal  0.29168 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2286  protein of unknown function UPF0118  34.82 
 
 
418 aa  194  4e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0673264  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2806  protein of unknown function UPF0118  40.55 
 
 
387 aa  189  1e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00669184 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1881  hypothetical protein  36.01 
 
 
435 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3105  hypothetical protein  40.55 
 
 
389 aa  180  4e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2026  protein of unknown function UPF0118  34.7 
 
 
398 aa  179  7e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6766  permease-like protein  42.59 
 
 
432 aa  178  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2803  protein of unknown function UPF0118  35.07 
 
 
441 aa  178  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.168707  normal  0.0979616 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3393  protein of unknown function UPF0118  31.94 
 
 
426 aa  178  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.334585  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0907  protein of unknown function UPF0118  37.43 
 
 
423 aa  177  4e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00600861  normal  0.0221352 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1252  hypothetical protein  34.78 
 
 
376 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4850  hypothetical protein  35.71 
 
 
394 aa  171  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1050  protein of unknown function UPF0118  39.8 
 
 
384 aa  171  3e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2128  protein of unknown function UPF0118  35.22 
 
 
444 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.813628  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1226  hypothetical protein  35.06 
 
 
376 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1243  hypothetical protein  35.06 
 
 
376 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.597847 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3823  protein of unknown function UPF0118  34.88 
 
 
390 aa  159  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0609806  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3110  protein of unknown function UPF0118  35.67 
 
 
414 aa  158  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0503  protein of unknown function UPF0118  33.55 
 
 
416 aa  152  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14120  predicted permease  34.5 
 
 
476 aa  144  2e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.209203  normal  0.521602 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  32.41 
 
 
529 aa  140  6e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4624  protein of unknown function UPF0118  35.65 
 
 
393 aa  140  7.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7599  hypothetical protein  33.86 
 
 
355 aa  133  7.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0354819  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2613  protein of unknown function UPF0118  32.86 
 
 
392 aa  131  3e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.047245  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  30.03 
 
 
358 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6257  protein of unknown function UPF0118  35.93 
 
 
389 aa  128  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.707833  normal  0.194644 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  27.67 
 
 
405 aa  119  9.999999999999999e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2641  protein of unknown function UPF0118  31 
 
 
408 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.517547  normal  0.208528 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2165  hypothetical protein  32.06 
 
 
414 aa  117  5e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.128502  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  31.37 
 
 
354 aa  110  5e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7547  protein of unknown function UPF0118  27.44 
 
 
392 aa  107  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43907  normal  0.494892 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0120  protein of unknown function UPF0118  26.45 
 
 
436 aa  107  7e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  27.04 
 
 
402 aa  106  7e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  27.04 
 
 
402 aa  106  7e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0221  protein of unknown function UPF0118  27.3 
 
 
364 aa  103  7e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00795849 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0558  hypothetical protein  28.94 
 
 
362 aa  103  7e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0561744  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8629  permease-like protein  29.57 
 
 
423 aa  103  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  27.32 
 
 
373 aa  102  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1247  protein of unknown function UPF0118  27.17 
 
 
388 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3615  hypothetical protein  28.89 
 
 
412 aa  102  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2485  hypothetical protein  28.31 
 
 
435 aa  101  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.957524  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  28.88 
 
 
348 aa  101  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1485  protein of unknown function UPF0118  28.61 
 
 
455 aa  100  4e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.823858  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  28.66 
 
 
361 aa  101  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  28.66 
 
 
361 aa  101  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0518  protein of unknown function UPF0118  31.64 
 
 
397 aa  101  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.318359  normal  0.0533128 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  29.05 
 
 
361 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  28.66 
 
 
361 aa  101  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  29.28 
 
 
348 aa  100  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1352  protein of unknown function UPF0118  27.98 
 
 
438 aa  100  6e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  28.88 
 
 
390 aa  100  7e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1731  protein of unknown function UPF0118  30.07 
 
 
373 aa  100  8e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  28.26 
 
 
361 aa  99.8  9e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  27.83 
 
 
361 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  27.83 
 
 
361 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2329  protein of unknown function UPF0118  32.34 
 
 
436 aa  97.4  5e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000385102 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6357  protein of unknown function UPF0118  28.38 
 
 
363 aa  95.9  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  28.7 
 
 
361 aa  95.5  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1973  hypothetical protein  28.83 
 
 
369 aa  95.5  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0953876  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1387  protein of unknown function UPF0118  28.83 
 
 
369 aa  94.7  4e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0061  hypothetical protein  27.03 
 
 
383 aa  92.8  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1762  hypothetical protein  27.71 
 
 
329 aa  92.8  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15290  predicted permease  26.17 
 
 
415 aa  92.4  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2868  protein of unknown function UPF0118  29.81 
 
 
400 aa  91.7  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1849  hypothetical protein  29.67 
 
 
365 aa  91.7  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.326919  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  28.48 
 
 
344 aa  91.3  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2291  hypothetical protein  26.36 
 
 
424 aa  90.9  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0708  protein of unknown function UPF0118  30.41 
 
 
429 aa  90.5  6e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4013  protein of unknown function UPF0118  28.12 
 
 
389 aa  90.5  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00579473  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0195  protein of unknown function UPF0118  29.34 
 
 
486 aa  90.1  9e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>