More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1468 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1468  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 
368 aa  702    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.916675  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21060  predicted permease  57.1 
 
 
436 aa  392  1e-108  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.152627  normal  0.29168 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2026  protein of unknown function UPF0118  51.09 
 
 
398 aa  338  9e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2286  protein of unknown function UPF0118  52.91 
 
 
418 aa  330  3e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0673264  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2613  protein of unknown function UPF0118  42.9 
 
 
392 aa  224  2e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.047245  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0322  hypothetical protein  39.34 
 
 
487 aa  220  3e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.084246  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0279  hypothetical protein  40.27 
 
 
423 aa  214  9.999999999999999e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0267805 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0159  hypothetical protein  38.81 
 
 
381 aa  210  4e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0479062 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0169  hypothetical protein  38.27 
 
 
381 aa  206  4e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0178  hypothetical protein  38.27 
 
 
381 aa  206  4e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5305  hypothetical protein  37.46 
 
 
464 aa  201  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.111321  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0457  hypothetical protein  36.76 
 
 
383 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10207  transmembrane protein  38.81 
 
 
367 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0195  hypothetical protein  38.21 
 
 
384 aa  193  5e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566996  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1164  hypothetical protein  37.5 
 
 
457 aa  192  7e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.23073  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1700  hypothetical protein  37.96 
 
 
429 aa  192  9e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00039584 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0238  hypothetical protein  33.52 
 
 
421 aa  188  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.817468 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08190  predicted permease  36.31 
 
 
455 aa  184  3e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0210651 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0938  protein of unknown function UPF0118  36.89 
 
 
420 aa  179  8e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7052  protein of unknown function UPF0118  36.76 
 
 
402 aa  177  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0978  hypothetical protein  35.19 
 
 
452 aa  176  8e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.42646  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1161  hypothetical protein  37.01 
 
 
415 aa  175  9.999999999999999e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3105  hypothetical protein  34.99 
 
 
389 aa  172  7.999999999999999e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1236  protein of unknown function UPF0118  36.04 
 
 
439 aa  169  7e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000518014 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2806  protein of unknown function UPF0118  39.01 
 
 
387 aa  169  8e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00669184 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4482  protein of unknown function UPF0118  35.47 
 
 
390 aa  169  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255906  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2203  protein of unknown function UPF0118  34.96 
 
 
397 aa  167  2e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0681126  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1098  protein of unknown function UPF0118  39.02 
 
 
396 aa  163  6e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.370016  normal  0.531721 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1895  protein of unknown function UPF0118  38.48 
 
 
483 aa  160  2e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588951  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39490  predicted permease  35.97 
 
 
403 aa  160  4e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.233759  normal  0.317185 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2637  protein of unknown function UPF0118  33.15 
 
 
421 aa  157  3e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4772  protein of unknown function UPF0118  36.29 
 
 
475 aa  155  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.808425  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05050  predicted permease  37.13 
 
 
405 aa  152  1e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.187674  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2291  hypothetical protein  34.12 
 
 
407 aa  150  4e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.370535  normal  0.257699 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08290  predicted permease  34.25 
 
 
367 aa  148  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1050  protein of unknown function UPF0118  37.46 
 
 
384 aa  143  6e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4624  protein of unknown function UPF0118  33.33 
 
 
393 aa  139  7e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6766  permease-like protein  33.85 
 
 
432 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1881  hypothetical protein  29.53 
 
 
435 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23100  predicted permease  28.92 
 
 
477 aa  126  6e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.741637  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0907  protein of unknown function UPF0118  35.33 
 
 
423 aa  125  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00600861  normal  0.0221352 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1252  hypothetical protein  32.14 
 
 
376 aa  122  8e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  27.35 
 
 
358 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2803  protein of unknown function UPF0118  30.06 
 
 
441 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.168707  normal  0.0979616 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1226  hypothetical protein  33.61 
 
 
376 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1243  hypothetical protein  33.61 
 
 
376 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.597847 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4850  hypothetical protein  33.19 
 
 
394 aa  114  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14120  predicted permease  30.29 
 
 
476 aa  110  5e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.209203  normal  0.521602 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2128  protein of unknown function UPF0118  31.6 
 
 
444 aa  109  7.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.813628  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3823  protein of unknown function UPF0118  29.63 
 
 
390 aa  107  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0609806  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3393  protein of unknown function UPF0118  28.47 
 
 
426 aa  105  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.334585  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1731  protein of unknown function UPF0118  31.21 
 
 
373 aa  104  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7599  hypothetical protein  35.58 
 
 
355 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0354819  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0503  protein of unknown function UPF0118  28 
 
 
416 aa  103  7e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6257  protein of unknown function UPF0118  37.44 
 
 
389 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.707833  normal  0.194644 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1762  hypothetical protein  25.62 
 
 
329 aa  99.4  9e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  25.76 
 
 
343 aa  99  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  26.62 
 
 
354 aa  95.5  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3110  protein of unknown function UPF0118  30.53 
 
 
414 aa  95.1  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  26.67 
 
 
354 aa  93.2  7e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1453  protein of unknown function UPF0118  27.56 
 
 
384 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0209  protein of unknown function UPF0118  29.73 
 
 
399 aa  88.6  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2732  hypothetical protein  25.14 
 
 
345 aa  87.8  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1352  protein of unknown function UPF0118  28.31 
 
 
438 aa  88.2  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1247  protein of unknown function UPF0118  26.26 
 
 
388 aa  87.4  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2868  protein of unknown function UPF0118  27.18 
 
 
400 aa  86.3  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0518  protein of unknown function UPF0118  35.57 
 
 
397 aa  86.3  8e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.318359  normal  0.0533128 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2478  hypothetical protein  29.96 
 
 
369 aa  85.5  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09400  predicted permease  39.62 
 
 
357 aa  85.5  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.291782 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  27.02 
 
 
361 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  27.02 
 
 
348 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  26.71 
 
 
373 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  25 
 
 
390 aa  83.2  0.000000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1950  hypothetical protein  22.63 
 
 
386 aa  82.8  0.000000000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  29.25 
 
 
529 aa  82.4  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1387  protein of unknown function UPF0118  30.96 
 
 
369 aa  82  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  26.71 
 
 
361 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  26.71 
 
 
361 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  26.71 
 
 
348 aa  82  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  26.71 
 
 
361 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0061  hypothetical protein  27.37 
 
 
383 aa  81.6  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  20.87 
 
 
351 aa  81.6  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  25.91 
 
 
361 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3397  hypothetical protein  31.53 
 
 
412 aa  80.9  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.947024  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  27.13 
 
 
361 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  23.74 
 
 
393 aa  80.5  0.00000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  23.86 
 
 
355 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  23.86 
 
 
355 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  23.86 
 
 
355 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  23.86 
 
 
355 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  23.86 
 
 
355 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  23.45 
 
 
355 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3565  hypothetical protein  27.9 
 
 
356 aa  79.7  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0708  protein of unknown function UPF0118  26.11 
 
 
429 aa  79.3  0.00000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  25.78 
 
 
361 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3544  protein of unknown function UPF0118  31.07 
 
 
412 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  25.78 
 
 
361 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  26.51 
 
 
371 aa  79.3  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  23.87 
 
 
355 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3480  protein of unknown function UPF0118  31.07 
 
 
412 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.904351  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>