More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2291 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2291  hypothetical protein  100 
 
 		 407 aa  790    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.370535  normal  0.257699 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6766  permease-like protein  64.83 
 
 		 432 aa  372  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5305  hypothetical protein  40.64 
 
 		 464 aa  254  3e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.111321  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1700  hypothetical protein  41.8 
 
 		 429 aa  237  3e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039584 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1161  hypothetical protein  41.85 
 
 		 415 aa  233  5e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0279  hypothetical protein  40.41 
 
 		 423 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0267805 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0457  hypothetical protein  38.39 
 
 		 383 aa  212  9e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0322  hypothetical protein  40.71 
 
 		 487 aa  211  1e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.084246  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0169  hypothetical protein  38.66 
 
 		 381 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0178  hypothetical protein  38.66 
 
 		 381 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0159  hypothetical protein  38.87 
 
 		 381 aa  205  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0479062 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1164  hypothetical protein  34.99 
 
 		 457 aa  205  2e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.23073  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0195  hypothetical protein  40.18 
 
 		 384 aa  202  9e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1236  protein of unknown function UPF0118  34.23 
 
 		 439 aa  192  6e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000518014 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0978  hypothetical protein  34.5 
 
 		 452 aa  192  1e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.42646  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7052  protein of unknown function UPF0118  37.78 
 
 		 402 aa  191  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0238  hypothetical protein  36.57 
 
 		 421 aa  187  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.817468 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10207  transmembrane protein  37.16 
 
 		 367 aa  186  7e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39490  predicted permease  39.66 
 
 		 403 aa  183  4.0000000000000006e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.233759  normal  0.317185 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0938  protein of unknown function UPF0118  37.2 
 
 		 420 aa  180  4e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4482  protein of unknown function UPF0118  34.1 
 
 		 390 aa  178  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255906  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08190  predicted permease  32.74 
 
 		 455 aa  175  9.999999999999999e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0210651 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1098  protein of unknown function UPF0118  41.13 
 
 		 396 aa  172  6.999999999999999e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.370016  normal  0.531721 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4772  protein of unknown function UPF0118  39.25 
 
 		 475 aa  170  5e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.808425  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2637  protein of unknown function UPF0118  36.5 
 
 		 421 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23100  predicted permease  33.56 
 
 		 477 aa  159  1e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.741637  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3105  hypothetical protein  33.33 
 
 		 389 aa  158  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1895  protein of unknown function UPF0118  33.8 
 
 		 483 aa  155  1e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2203  protein of unknown function UPF0118  31.33 
 
 		 397 aa  154  2.9999999999999998e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0681126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0907  protein of unknown function UPF0118  35.17 
 
 		 423 aa  154  2.9999999999999998e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00600861  normal  0.0221352 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21060  predicted permease  30.79 
 
 		 436 aa  153  5.9999999999999996e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.152627  normal  0.29168 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2803  protein of unknown function UPF0118  33.23 
 
 		 441 aa  149  8e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.168707  normal  0.0979616 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3393  protein of unknown function UPF0118  29.02 
 
 		 426 aa  146  7.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.334585  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2806  protein of unknown function UPF0118  35.67 
 
 		 387 aa  145  9e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00669184 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2128  protein of unknown function UPF0118  31.75 
 
 		 444 aa  145  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.813628  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1468  protein of unknown function UPF0118  33.12 
 
 		 368 aa  145  1e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.916675  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14120  predicted permease  30.38 
 
 		 476 aa  145  2e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.209203  normal  0.521602 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1881  hypothetical protein  30.83 
 
 		 435 aa  145  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05050  predicted permease  31.87 
 
 		 405 aa  144  2e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.187674  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1050  protein of unknown function UPF0118  35.74 
 
 		 384 aa  143  5e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1252  hypothetical protein  30.82 
 
 		 376 aa  143  6e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3823  protein of unknown function UPF0118  32.08 
 
 		 390 aa  138  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0609806  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4850  hypothetical protein  32.88 
 
 		 394 aa  139  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0503  protein of unknown function UPF0118  31.95 
 
 		 416 aa  138  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3110  protein of unknown function UPF0118  32.92 
 
 		 414 aa  138  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1226  hypothetical protein  32.47 
 
 		 376 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1243  hypothetical protein  32.47 
 
 		 376 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.597847 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4624  protein of unknown function UPF0118  35.8 
 
 		 393 aa  133  5e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2026  protein of unknown function UPF0118  30.64 
 
 		 398 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2286  protein of unknown function UPF0118  30.56 
 
 		 418 aa  128  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0673264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7599  hypothetical protein  31.66 
 
 		 355 aa  124  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0354819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08290  predicted permease  30.62 
 
 		 367 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2613  protein of unknown function UPF0118  32.15 
 
 		 392 aa  102  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.047245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2868  protein of unknown function UPF0118  28.89 
 
 		 400 aa  98.6  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6257  protein of unknown function UPF0118  35.78 
 
 		 389 aa  97.4  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.707833  normal  0.194644 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0209  protein of unknown function UPF0118  27.89 
 
 		 399 aa  94.7  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  28.35 
 
 		 358 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  27.16 
 
 		 529 aa  95.5  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2641  protein of unknown function UPF0118  30 
 
 		 408 aa  92.4  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.517547  normal  0.208528 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1731  protein of unknown function UPF0118  28.96 
 
 		 373 aa  92  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0779  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  27.97 
 
 		 375 aa  91.3  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.770407  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2435  hypothetical protein  27.97 
 
 		 358 aa  90.9  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0853714  normal  0.0537169 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1300  hypothetical protein  27.25 
 
 		 434 aa  89  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.493989  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1485  protein of unknown function UPF0118  25.97 
 
 		 455 aa  87.4  5e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.823858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1841  permease  25 
 
 		 563 aa  86.3  0.000000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4013  protein of unknown function UPF0118  25.88 
 
 		 389 aa  84.7  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00579473  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0221  protein of unknown function UPF0118  26.43 
 
 		 364 aa  82.4  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795849 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1247  protein of unknown function UPF0118  26.33 
 
 		 388 aa  82.4  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0742  protein of unknown function UPF0118  26.86 
 
 		 361 aa  82  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  23.25 
 
 		 396 aa  82  0.00000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15290  predicted permease  25 
 
 		 415 aa  82  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0061  hypothetical protein  28.32 
 
 		 383 aa  82  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3308  protein of unknown function UPF0118  24.12 
 
 		 452 aa  81.3  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783017  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1387  protein of unknown function UPF0118  23.5 
 
 		 369 aa  81.3  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1139  hypothetical protein  26.13 
 
 		 526 aa  80.5  0.00000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3565  hypothetical protein  27.89 
 
 		 356 aa  79.7  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  23.99 
 
 		 343 aa  80.1  0.00000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0400  hypothetical protein  27.33 
 
 		 357 aa  79  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2006  hypothetical protein  25.38 
 
 		 363 aa  79  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000247505  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2732  hypothetical protein  26.05 
 
 		 345 aa  77  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2759  protein of unknown function UPF0118  27.76 
 
 		 368 aa  77  0.0000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.163255  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0518  protein of unknown function UPF0118  31.1 
 
 		 397 aa  76.6  0.0000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.318359  normal  0.0533128 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  25.37 
 
 		 390 aa  76.6  0.0000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2491  protein of unknown function UPF0118  24.09 
 
 		 353 aa  76.6  0.0000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  24.53 
 
 		 355 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2165  hypothetical protein  28.1 
 
 		 414 aa  76.3  0.0000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.128502  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  24.53 
 
 		 355 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3615  hypothetical protein  28.26 
 
 		 412 aa  75.9  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3031  protein of unknown function UPF0118  24.06 
 
 		 377 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0793  hypothetical protein  25.86 
 
 		 379 aa  75.1  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114477  normal  0.678459 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1762  hypothetical protein  27.05 
 
 		 329 aa  75.1  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0602  hypothetical protein  26.49 
 
 		 361 aa  74.7  0.000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0876326  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2668  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  29.58 
 
 		 665 aa  74.3  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  24.21 
 
 		 355 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  24.57 
 
 		 371 aa  74.7  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0136  protein of unknown function UPF0118  23.77 
 
 		 387 aa  74.3  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.291617  normal  0.459798 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  23.55 
 
 		 361 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2201  hypothetical protein  26.27 
 
 		 365 aa  74.3  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000750597  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2859  protein of unknown function UPF0118  27.91 
 
 		 356 aa  74.7  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.262918  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2453  protein of unknown function UPF0118  28.22 
 
 		 356 aa  74.7  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.563612  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>