More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3110 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3110  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 		 414 aa  809    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3393  protein of unknown function UPF0118  57.33 
 
 		 426 aa  412  1e-114  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.334585  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1252  hypothetical protein  58.99 
 
 		 376 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1226  hypothetical protein  58.56 
 
 		 376 aa  357  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1243  hypothetical protein  58.56 
 
 		 376 aa  357  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.597847 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4850  hypothetical protein  58.04 
 
 		 394 aa  357  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3823  protein of unknown function UPF0118  55.3 
 
 		 390 aa  323  3e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0609806  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2128  protein of unknown function UPF0118  52.47 
 
 		 444 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.813628  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14120  predicted permease  46.68 
 
 		 476 aa  290  4e-77  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.209203  normal  0.521602 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0503  protein of unknown function UPF0118  43.61 
 
 		 416 aa  279  8e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0907  protein of unknown function UPF0118  46.84 
 
 		 423 aa  276  7e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00600861  normal  0.0221352 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4482  protein of unknown function UPF0118  38.79 
 
 		 390 aa  199  6e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255906  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0322  hypothetical protein  36.06 
 
 		 487 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.084246  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1236  protein of unknown function UPF0118  35.44 
 
 		 439 aa  196  5.000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000518014 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0279  hypothetical protein  36.94 
 
 		 423 aa  196  5.000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0267805 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08190  predicted permease  36.08 
 
 		 455 aa  191  2e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0210651 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2203  protein of unknown function UPF0118  35.2 
 
 		 397 aa  190  5e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0681126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1164  hypothetical protein  34.83 
 
 		 457 aa  189  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.23073  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0457  hypothetical protein  33.14 
 
 		 383 aa  189  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5305  hypothetical protein  34.01 
 
 		 464 aa  187  4e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.111321  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0169  hypothetical protein  34.54 
 
 		 381 aa  186  8e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0178  hypothetical protein  34.54 
 
 		 381 aa  186  8e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0159  hypothetical protein  34.54 
 
 		 381 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0479062 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39490  predicted permease  37.85 
 
 		 403 aa  181  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.233759  normal  0.317185 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0978  hypothetical protein  35.17 
 
 		 452 aa  180  4.999999999999999e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.42646  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1881  hypothetical protein  35.11 
 
 		 435 aa  179  8e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0195  hypothetical protein  34.23 
 
 		 384 aa  176  6e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10207  transmembrane protein  35.65 
 
 		 367 aa  176  6e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4772  protein of unknown function UPF0118  36.94 
 
 		 475 aa  175  9.999999999999999e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.808425  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2291  hypothetical protein  35.38 
 
 		 407 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.370535  normal  0.257699 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1700  hypothetical protein  32.15 
 
 		 429 aa  174  3.9999999999999995e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039584 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0238  hypothetical protein  34.9 
 
 		 421 aa  172  6.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.817468 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0938  protein of unknown function UPF0118  35.85 
 
 		 420 aa  172  7.999999999999999e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1161  hypothetical protein  35.44 
 
 		 415 aa  172  7.999999999999999e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2637  protein of unknown function UPF0118  36.14 
 
 		 421 aa  169  7e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2806  protein of unknown function UPF0118  37.64 
 
 		 387 aa  165  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00669184 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1895  protein of unknown function UPF0118  35.05 
 
 		 483 aa  162  1e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3105  hypothetical protein  36.22 
 
 		 389 aa  159  7e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7052  protein of unknown function UPF0118  34.79 
 
 		 402 aa  159  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2803  protein of unknown function UPF0118  35.35 
 
 		 441 aa  158  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.168707  normal  0.0979616 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08290  predicted permease  34.94 
 
 		 367 aa  156  6e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1050  protein of unknown function UPF0118  36.5 
 
 		 384 aa  151  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1098  protein of unknown function UPF0118  35.47 
 
 		 396 aa  148  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.370016  normal  0.531721 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6766  permease-like protein  34.53 
 
 		 432 aa  147  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23100  predicted permease  30.38 
 
 		 477 aa  139  1e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.741637  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7599  hypothetical protein  34.84 
 
 		 355 aa  136  8e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0354819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21060  predicted permease  30.15 
 
 		 436 aa  135  9.999999999999999e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.152627  normal  0.29168 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6257  protein of unknown function UPF0118  33.77 
 
 		 389 aa  130  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.707833  normal  0.194644 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4624  protein of unknown function UPF0118  38.12 
 
 		 393 aa  127  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1468  protein of unknown function UPF0118  31.78 
 
 		 368 aa  126  8.000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.916675  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05050  predicted permease  36.23 
 
 		 405 aa  125  1e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.187674  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2026  protein of unknown function UPF0118  29.7 
 
 		 398 aa  125  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  30.4 
 
 		 354 aa  124  4e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  27.73 
 
 		 361 aa  122  9e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2001  permease  23.82 
 
 		 371 aa  121  1.9999999999999998e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2286  protein of unknown function UPF0118  31.19 
 
 		 418 aa  121  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0673264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  27.47 
 
 		 361 aa  121  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  27.45 
 
 		 373 aa  120  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  27.47 
 
 		 361 aa  121  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  27.47 
 
 		 361 aa  121  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  27.65 
 
 		 361 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  27.65 
 
 		 361 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15290  predicted permease  26.4 
 
 		 415 aa  117  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  28 
 
 		 348 aa  116  6e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  26.72 
 
 		 361 aa  116  6e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1247  protein of unknown function UPF0118  29.5 
 
 		 388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  27.73 
 
 		 348 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2641  protein of unknown function UPF0118  28.77 
 
 		 408 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.517547  normal  0.208528 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2165  hypothetical protein  30.74 
 
 		 414 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.128502  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  26.69 
 
 		 392 aa  112  9e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  26.89 
 
 		 361 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  28.42 
 
 		 358 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1029  hypothetical protein  25.22 
 
 		 361 aa  108  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.951774  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1010  hypothetical protein  25.22 
 
 		 361 aa  108  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.389096  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  26.4 
 
 		 390 aa  108  1e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1841  permease  31.11 
 
 		 563 aa  107  3e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  28.02 
 
 		 354 aa  107  5e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2868  protein of unknown function UPF0118  30.55 
 
 		 400 aa  107  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  25.84 
 
 		 369 aa  106  6e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2732  hypothetical protein  26.59 
 
 		 345 aa  106  7e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1485  protein of unknown function UPF0118  25.82 
 
 		 455 aa  106  7e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.823858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0120  protein of unknown function UPF0118  25.45 
 
 		 436 aa  106  7e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  24.44 
 
 		 351 aa  104  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0742  protein of unknown function UPF0118  26.84 
 
 		 361 aa  103  5e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2201  hypothetical protein  28.53 
 
 		 365 aa  103  5e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000750597  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3832  protein of unknown function UPF0118  30.9 
 
 		 372 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  23.96 
 
 		 343 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2437  protein of unknown function UPF0118  27.04 
 
 		 386 aa  102  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000151216  normal  0.0209402 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1300  hypothetical protein  29.37 
 
 		 434 aa  101  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.493989  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0221  protein of unknown function UPF0118  26.36 
 
 		 364 aa  102  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795849 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  24.93 
 
 		 393 aa  100  3e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  25.34 
 
 		 371 aa  100  4e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1352  protein of unknown function UPF0118  26.44 
 
 		 438 aa  98.2  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3355  hypothetical protein  27.55 
 
 		 373 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1762  hypothetical protein  26.9 
 
 		 329 aa  98.2  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1871  membrane protein YubA  27.27 
 
 		 373 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3380  hypothetical protein  27.27 
 
 		 376 aa  96.7  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.300528  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3397  hypothetical protein  26.63 
 
 		 412 aa  97.1  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.947024  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3308  protein of unknown function UPF0118  25.92 
 
 		 452 aa  97.1  6e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783017  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7547  protein of unknown function UPF0118  25.73 
 
 		 392 aa  96.7  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43907  normal  0.494892 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>