More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4772 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4772  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 		 475 aa  912    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.808425  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0322  hypothetical protein  50.14 
 
 		 487 aa  290  3e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.084246  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0279  hypothetical protein  49.58 
 
 		 423 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0267805 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0978  hypothetical protein  46.03 
 
 		 452 aa  273  6e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.42646  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0169  hypothetical protein  48.83 
 
 		 381 aa  272  8.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0178  hypothetical protein  48.83 
 
 		 381 aa  272  8.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0159  hypothetical protein  48.83 
 
 		 381 aa  272  1e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0479062 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0457  hypothetical protein  46.22 
 
 		 383 aa  272  1e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5305  hypothetical protein  46.02 
 
 		 464 aa  271  2e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.111321  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23100  predicted permease  44.47 
 
 		 477 aa  271  2e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.741637  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7052  protein of unknown function UPF0118  53.44 
 
 		 402 aa  271  2e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4482  protein of unknown function UPF0118  50.44 
 
 		 390 aa  265  1e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255906  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0238  hypothetical protein  48.82 
 
 		 421 aa  263  6e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.817468 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1164  hypothetical protein  44.35 
 
 		 457 aa  253  4.0000000000000004e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.23073  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0195  hypothetical protein  47.65 
 
 		 384 aa  251  1e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566996  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0938  protein of unknown function UPF0118  49.28 
 
 		 420 aa  252  1e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08190  predicted permease  43.66 
 
 		 455 aa  251  2e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0210651 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1236  protein of unknown function UPF0118  46.8 
 
 		 439 aa  249  7e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000518014 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39490  predicted permease  51.82 
 
 		 403 aa  244  1.9999999999999999e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.233759  normal  0.317185 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1161  hypothetical protein  45.19 
 
 		 415 aa  241  2e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10207  transmembrane protein  47.58 
 
 		 367 aa  240  5e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2637  protein of unknown function UPF0118  46.2 
 
 		 421 aa  230  3e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1098  protein of unknown function UPF0118  50.3 
 
 		 396 aa  219  7.999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.370016  normal  0.531721 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1895  protein of unknown function UPF0118  43.18 
 
 		 483 aa  218  2e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588951  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05050  predicted permease  45.7 
 
 		 405 aa  214  2.9999999999999995e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.187674  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08290  predicted permease  40.51 
 
 		 367 aa  202  9.999999999999999e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2203  protein of unknown function UPF0118  40.06 
 
 		 397 aa  199  7e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0681126  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2291  hypothetical protein  39.25 
 
 		 407 aa  193  7e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.370535  normal  0.257699 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21060  predicted permease  35.77 
 
 		 436 aa  187  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.152627  normal  0.29168 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3393  protein of unknown function UPF0118  37.14 
 
 		 426 aa  186  6e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.334585  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1700  hypothetical protein  36.69 
 
 		 429 aa  182  1e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039584 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2128  protein of unknown function UPF0118  40.12 
 
 		 444 aa  182  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.813628  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3105  hypothetical protein  37.93 
 
 		 389 aa  171  3e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3823  protein of unknown function UPF0118  40.71 
 
 		 390 aa  171  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0609806  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1050  protein of unknown function UPF0118  40.06 
 
 		 384 aa  169  8e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1468  protein of unknown function UPF0118  36.09 
 
 		 368 aa  169  1e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.916675  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2803  protein of unknown function UPF0118  36.9 
 
 		 441 aa  168  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.168707  normal  0.0979616 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1252  hypothetical protein  40 
 
 		 376 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1881  hypothetical protein  34.8 
 
 		 435 aa  167  5e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0503  protein of unknown function UPF0118  35.96 
 
 		 416 aa  166  8e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2026  protein of unknown function UPF0118  37.16 
 
 		 398 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2806  protein of unknown function UPF0118  40.82 
 
 		 387 aa  162  9e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00669184 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2286  protein of unknown function UPF0118  35.52 
 
 		 418 aa  162  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0673264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1226  hypothetical protein  40.75 
 
 		 376 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1243  hypothetical protein  40.75 
 
 		 376 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.597847 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4850  hypothetical protein  43.23 
 
 		 394 aa  160  5e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4624  protein of unknown function UPF0118  41.62 
 
 		 393 aa  155  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6766  permease-like protein  39.81 
 
 		 432 aa  154  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0907  protein of unknown function UPF0118  35.25 
 
 		 423 aa  152  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00600861  normal  0.0221352 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14120  predicted permease  36.52 
 
 		 476 aa  150  6e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.209203  normal  0.521602 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3110  protein of unknown function UPF0118  36.94 
 
 		 414 aa  145  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7599  hypothetical protein  35.1 
 
 		 355 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0354819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6257  protein of unknown function UPF0118  38.02 
 
 		 389 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.707833  normal  0.194644 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2613  protein of unknown function UPF0118  34.84 
 
 		 392 aa  108  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.047245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  24.06 
 
 		 390 aa  102  2e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  28.18 
 
 		 529 aa  98.2  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0657  permease  28 
 
 		 384 aa  90.9  4e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.036358  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1841  permease  24.44 
 
 		 563 aa  87.8  3e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1056  hypothetical protein  27.56 
 
 		 398 aa  87.8  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0061  hypothetical protein  33.33 
 
 		 383 aa  87.4  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  24.15 
 
 		 402 aa  87  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  24.15 
 
 		 402 aa  87  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  23.84 
 
 		 405 aa  86.7  8e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2557  hypothetical protein  24.92 
 
 		 404 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1762  hypothetical protein  28 
 
 		 329 aa  86.3  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  23.73 
 
 		 373 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  27.43 
 
 		 363 aa  85.5  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1352  protein of unknown function UPF0118  26.22 
 
 		 438 aa  85.5  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  24.4 
 
 		 361 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2165  hypothetical protein  28.99 
 
 		 414 aa  84.7  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.128502  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15290  predicted permease  26.39 
 
 		 415 aa  84.7  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3144  hypothetical protein  30.33 
 
 		 393 aa  85.1  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0744058  normal  0.288256 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  23.73 
 
 		 361 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  23.73 
 
 		 361 aa  84  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  23.73 
 
 		 361 aa  84  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  24.62 
 
 		 361 aa  84  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1387  protein of unknown function UPF0118  29.39 
 
 		 369 aa  84  0.000000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  23.73 
 
 		 361 aa  84.3  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1485  protein of unknown function UPF0118  28.42 
 
 		 455 aa  83.6  0.000000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.823858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2485  hypothetical protein  26.49 
 
 		 435 aa  83.6  0.000000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.957524  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  24.77 
 
 		 348 aa  83.6  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  24.77 
 
 		 348 aa  83.6  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2596  hypothetical protein  27.27 
 
 		 371 aa  83.2  0.000000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4060  hypothetical protein  25.32 
 
 		 404 aa  83.2  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000137982  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  24.46 
 
 		 361 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  24.46 
 
 		 361 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0120  protein of unknown function UPF0118  24.43 
 
 		 436 aa  81.3  0.00000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  27.36 
 
 		 393 aa  80.9  0.00000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3480  protein of unknown function UPF0118  34.31 
 
 		 412 aa  80.5  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.904351  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3544  protein of unknown function UPF0118  33.82 
 
 		 412 aa  80.1  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2291  hypothetical protein  27.03 
 
 		 424 aa  80.1  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0209  protein of unknown function UPF0118  31.25 
 
 		 399 aa  80.1  0.00000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1247  protein of unknown function UPF0118  26.81 
 
 		 388 aa  80.1  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  24.39 
 
 		 354 aa  80.1  0.00000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3397  hypothetical protein  34.45 
 
 		 412 aa  79.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.947024  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  31.42 
 
 		 371 aa  79.7  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4013  protein of unknown function UPF0118  26.54 
 
 		 389 aa  79.3  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00579473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  26.97 
 
 		 354 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1694  hypothetical protein  33.33 
 
 		 360 aa  79  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.258631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3845  hypothetical protein  27.86 
 
 		 406 aa  79  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.521345  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>