More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2613 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2613  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 		 392 aa  730    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.047245  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2026  protein of unknown function UPF0118  47.88 
 
 		 398 aa  299  6e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21060  predicted permease  44.14 
 
 		 436 aa  299  7e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.152627  normal  0.29168 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2286  protein of unknown function UPF0118  43.65 
 
 		 418 aa  263  3e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0673264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1468  protein of unknown function UPF0118  42.69 
 
 		 368 aa  241  2e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.916675  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0457  hypothetical protein  36.2 
 
 		 383 aa  182  7e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5305  hypothetical protein  35.91 
 
 		 464 aa  174  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.111321  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0238  hypothetical protein  35.83 
 
 		 421 aa  169  8e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.817468 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0195  hypothetical protein  35.93 
 
 		 384 aa  167  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0279  hypothetical protein  34.05 
 
 		 423 aa  160  5e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0267805 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0169  hypothetical protein  33.42 
 
 		 381 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0178  hypothetical protein  33.42 
 
 		 381 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0159  hypothetical protein  33.42 
 
 		 381 aa  157  4e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0479062 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0322  hypothetical protein  33.96 
 
 		 487 aa  156  6e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.084246  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1161  hypothetical protein  36.61 
 
 		 415 aa  150  3e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0978  hypothetical protein  34.05 
 
 		 452 aa  150  3e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.42646  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2203  protein of unknown function UPF0118  31.99 
 
 		 397 aa  144  2e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0681126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10207  transmembrane protein  36.34 
 
 		 367 aa  142  8e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1164  hypothetical protein  35.14 
 
 		 457 aa  139  6e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.23073  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1236  protein of unknown function UPF0118  34.86 
 
 		 439 aa  139  7.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000518014 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39490  predicted permease  34.51 
 
 		 403 aa  138  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.233759  normal  0.317185 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3105  hypothetical protein  34.2 
 
 		 389 aa  136  8e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05050  predicted permease  34.88 
 
 		 405 aa  134  3.9999999999999996e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.187674  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08190  predicted permease  32.89 
 
 		 455 aa  133  5e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0210651 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2806  protein of unknown function UPF0118  33.43 
 
 		 387 aa  132  6.999999999999999e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00669184 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1881  hypothetical protein  31.55 
 
 		 435 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1050  protein of unknown function UPF0118  35.94 
 
 		 384 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2291  hypothetical protein  32.17 
 
 		 407 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.370535  normal  0.257699 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4624  protein of unknown function UPF0118  30.95 
 
 		 393 aa  126  6e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1700  hypothetical protein  31.43 
 
 		 429 aa  125  1e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039584 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7052  protein of unknown function UPF0118  33.72 
 
 		 402 aa  120  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23100  predicted permease  29.4 
 
 		 477 aa  120  3.9999999999999996e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.741637  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4772  protein of unknown function UPF0118  35.63 
 
 		 475 aa  116  5e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.808425  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0938  protein of unknown function UPF0118  36.67 
 
 		 420 aa  116  6e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2803  protein of unknown function UPF0118  32.52 
 
 		 441 aa  115  8.999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.168707  normal  0.0979616 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1895  protein of unknown function UPF0118  33.53 
 
 		 483 aa  111  3e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0907  protein of unknown function UPF0118  31.2 
 
 		 423 aa  110  6e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00600861  normal  0.0221352 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2637  protein of unknown function UPF0118  32.55 
 
 		 421 aa  109  7.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4482  protein of unknown function UPF0118  30.55 
 
 		 390 aa  109  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255906  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3393  protein of unknown function UPF0118  27.88 
 
 		 426 aa  108  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.334585  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3823  protein of unknown function UPF0118  32.41 
 
 		 390 aa  107  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0609806  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2128  protein of unknown function UPF0118  29.79 
 
 		 444 aa  106  5e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.813628  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0503  protein of unknown function UPF0118  30.06 
 
 		 416 aa  106  7e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6766  permease-like protein  31.52 
 
 		 432 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08290  predicted permease  30.93 
 
 		 367 aa  104  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14120  predicted permease  31.98 
 
 		 476 aa  98.6  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.209203  normal  0.521602 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3110  protein of unknown function UPF0118  27.95 
 
 		 414 aa  98.2  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7599  hypothetical protein  33.85 
 
 		 355 aa  95.9  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0354819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4850  hypothetical protein  31.85 
 
 		 394 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1098  protein of unknown function UPF0118  37.91 
 
 		 396 aa  91.3  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.370016  normal  0.531721 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1226  hypothetical protein  31.73 
 
 		 376 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1243  hypothetical protein  31.73 
 
 		 376 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.597847 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  28.96 
 
 		 529 aa  90.9  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1252  hypothetical protein  32.75 
 
 		 376 aa  90.5  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6257  protein of unknown function UPF0118  33.07 
 
 		 389 aa  84.3  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.707833  normal  0.194644 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  23.12 
 
 		 343 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2868  protein of unknown function UPF0118  33.18 
 
 		 400 aa  81.6  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0518  protein of unknown function UPF0118  28.94 
 
 		 397 aa  80.9  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.318359  normal  0.0533128 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  28.96 
 
 		 358 aa  80.9  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1731  protein of unknown function UPF0118  26.59 
 
 		 373 aa  77  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1247  protein of unknown function UPF0118  26.03 
 
 		 388 aa  77  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  27.07 
 
 		 354 aa  74.7  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3012  protein of unknown function UPF0118  36.72 
 
 		 369 aa  73.9  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2641  protein of unknown function UPF0118  28.13 
 
 		 408 aa  73.9  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.517547  normal  0.208528 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02243  permease  27.18 
 
 		 388 aa  72  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  22.11 
 
 		 405 aa  72.8  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  21.26 
 
 		 402 aa  72.4  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  21.26 
 
 		 402 aa  72.4  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2478  hypothetical protein  39.13 
 
 		 369 aa  72.4  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0061  hypothetical protein  26.29 
 
 		 383 aa  71.6  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3786  protein of unknown function UPF0118  27.86 
 
 		 386 aa  71.6  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.262236  normal  0.0203414 
 
 
-
 
NC_002950  PG1950  hypothetical protein  23.06 
 
 		 386 aa  70.9  0.00000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2818  hypothetical protein  27.74 
 
 		 363 aa  70.9  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0558  hypothetical protein  28.38 
 
 		 362 aa  70.5  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0561744  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2732  hypothetical protein  23.53 
 
 		 345 aa  70.5  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  19.88 
 
 		 355 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2201  hypothetical protein  24.92 
 
 		 365 aa  69.3  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000750597  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  19.81 
 
 		 355 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  19.81 
 
 		 355 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  19.81 
 
 		 355 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  19.81 
 
 		 355 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  19.81 
 
 		 355 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0663  protein of unknown function UPF0118  25.47 
 
 		 373 aa  68.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.177633 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0456  protein of unknown function UPF0118  30.99 
 
 		 460 aa  67.8  0.0000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.204189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2339  protein of unknown function UPF0118  29.87 
 
 		 370 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0823  protein of unknown function UPF0118  25.93 
 
 		 358 aa  67.8  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74505  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2065  hypothetical protein  29.87 
 
 		 370 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.76219  normal  0.0900338 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  26.4 
 
 		 393 aa  67.8  0.0000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1482  hypothetical protein  24.62 
 
 		 324 aa  67.8  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3310  protein of unknown function UPF0118  25.96 
 
 		 354 aa  67.4  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2025  protein of unknown function UPF0118  27.18 
 
 		 370 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.653838 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0209  protein of unknown function UPF0118  27.98 
 
 		 399 aa  66.6  0.0000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0120  protein of unknown function UPF0118  31.55 
 
 		 436 aa  66.2  0.0000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  19.58 
 
 		 355 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3397  hypothetical protein  33.33 
 
 		 412 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.947024  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3462  hypothetical protein  26.07 
 
 		 418 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0247174 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  22.36 
 
 		 373 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3480  protein of unknown function UPF0118  29.21 
 
 		 412 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.904351  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3615  hypothetical protein  29.67 
 
 		 412 aa  65.5  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1485  protein of unknown function UPF0118  25.99 
 
 		 455 aa  64.3  0.000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.823858  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>