More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0456 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0456  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 		 460 aa  922    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.204189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2556  protein of unknown function UPF0118  28.74 
 
 		 429 aa  171  2e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05090  predicted permease  28.83 
 
 		 405 aa  144  3e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.114877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07790  predicted permease  25.55 
 
 		 492 aa  131  2.0000000000000002e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.132097 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0749  protein of unknown function UPF0118  26.26 
 
 		 417 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  25.28 
 
 		 343 aa  113  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  28.66 
 
 		 345 aa  111  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  26.92 
 
 		 344 aa  110  7.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  26.73 
 
 		 371 aa  108  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  25.14 
 
 		 361 aa  107  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  23.74 
 
 		 361 aa  105  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  25.78 
 
 		 351 aa  105  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  24.58 
 
 		 361 aa  104  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  24.3 
 
 		 373 aa  103  9e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  25.71 
 
 		 348 aa  103  9e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  24.3 
 
 		 361 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  24.3 
 
 		 361 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  24.86 
 
 		 361 aa  102  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  24.3 
 
 		 361 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  24.86 
 
 		 361 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3083  hypothetical protein  27.87 
 
 		 373 aa  101  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000376158  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  25.4 
 
 		 348 aa  101  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2291  hypothetical protein  25.72 
 
 		 424 aa  97.8  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3161  hypothetical protein  27.87 
 
 		 376 aa  97.4  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000118258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3145  permease  27.87 
 
 		 376 aa  97.4  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000188051  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  25.08 
 
 		 341 aa  97.4  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3380  hypothetical protein  27.87 
 
 		 373 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3410  hypothetical protein  27.87 
 
 		 376 aa  97.4  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1029  hypothetical protein  24.7 
 
 		 361 aa  97.1  6e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.951774  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3055  permease  27.87 
 
 		 376 aa  97.1  6e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0055436  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3381  membrane protein YubA  27.87 
 
 		 373 aa  97.1  6e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00559166  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1010  hypothetical protein  24.7 
 
 		 361 aa  97.1  6e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.389096  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1731  protein of unknown function UPF0118  27.24 
 
 		 373 aa  96.7  7e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3355  hypothetical protein  26.86 
 
 		 373 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3380  hypothetical protein  27.16 
 
 		 376 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.300528  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1871  membrane protein YubA  26.84 
 
 		 373 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2485  hypothetical protein  25.21 
 
 		 435 aa  95.5  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.957524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  24.54 
 
 		 354 aa  93.6  7e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2169  hypothetical protein  25.65 
 
 		 368 aa  93.6  7e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.215488  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  22.22 
 
 		 349 aa  91.7  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0663  protein of unknown function UPF0118  25.6 
 
 		 373 aa  92  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.177633 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7547  protein of unknown function UPF0118  23.95 
 
 		 392 aa  91.7  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43907  normal  0.494892 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  25.08 
 
 		 405 aa  90.9  4e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  26.62 
 
 		 354 aa  90.9  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  24.92 
 
 		 393 aa  91.3  4e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1781  protein of unknown function UPF0118  26.21 
 
 		 368 aa  90.5  6e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.836553  hitchhiker  0.00769603 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1880  hypothetical protein  25.9 
 
 		 372 aa  89.7  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0162246  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2385  protein of unknown function UPF0118  23.34 
 
 		 542 aa  89  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.322706 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2437  protein of unknown function UPF0118  22.39 
 
 		 386 aa  88.6  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000151216  normal  0.0209402 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2927  permease  26.54 
 
 		 365 aa  88.6  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241708  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  23.51 
 
 		 370 aa  88.2  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0522  hypothetical protein  23.68 
 
 		 377 aa  88.2  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.176917  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  23.46 
 
 		 402 aa  87  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  23.46 
 
 		 402 aa  87  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  20.57 
 
 		 355 aa  87  7e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  20.57 
 
 		 355 aa  87  7e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  20.57 
 
 		 355 aa  87  7e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  20.57 
 
 		 355 aa  87  7e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  20.57 
 
 		 355 aa  87  7e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14120  predicted permease  27.27 
 
 		 476 aa  87  7e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.209203  normal  0.521602 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0518  protein of unknown function UPF0118  25.57 
 
 		 397 aa  87  7e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.318359  normal  0.0533128 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2868  protein of unknown function UPF0118  25 
 
 		 400 aa  87  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  24.07 
 
 		 390 aa  86.7  8e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3012  protein of unknown function UPF0118  24.11 
 
 		 369 aa  86.3  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0602  hypothetical protein  26.35 
 
 		 361 aa  85.5  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0876326  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  22.56 
 
 		 396 aa  85.1  0.000000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1243  hypothetical protein  24.23 
 
 		 376 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.597847 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  19.94 
 
 		 355 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  19.94 
 
 		 355 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1226  hypothetical protein  24.23 
 
 		 376 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1252  hypothetical protein  24.76 
 
 		 376 aa  84.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4060  hypothetical protein  24.32 
 
 		 404 aa  84.3  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000137982  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2203  protein of unknown function UPF0118  23.06 
 
 		 397 aa  84.3  0.000000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0681126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3031  protein of unknown function UPF0118  21.74 
 
 		 377 aa  84  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  26.75 
 
 		 392 aa  83.6  0.000000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1556  hypothetical protein  30.98 
 
 		 407 aa  83.6  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8629  permease-like protein  26.21 
 
 		 423 aa  83.6  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0457  hypothetical protein  26.53 
 
 		 383 aa  83.6  0.000000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1354  hypothetical protein  25.93 
 
 		 375 aa  83.2  0.000000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000360215  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1485  protein of unknown function UPF0118  21.36 
 
 		 455 aa  82.4  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.823858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2478  hypothetical protein  26.36 
 
 		 369 aa  82.8  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4001  hypothetical protein  27.42 
 
 		 368 aa  82.4  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.591053 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2491  protein of unknown function UPF0118  23.82 
 
 		 353 aa  82  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2050  hypothetical protein  23.58 
 
 		 368 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116574  hitchhiker  0.00000000347502 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  23.29 
 
 		 351 aa  81.6  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2957  hypothetical protein  26.89 
 
 		 366 aa  81.3  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  19.94 
 
 		 355 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3102  hypothetical protein  23.51 
 
 		 352 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  25.63 
 
 		 529 aa  81.3  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0209  protein of unknown function UPF0118  24.8 
 
 		 399 aa  81.3  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0566  hypothetical protein  25.11 
 
 		 394 aa  80.9  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.182463  normal  0.0679598 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  23.87 
 
 		 369 aa  81.3  0.00000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3538  hypothetical protein  26.39 
 
 		 406 aa  80.9  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.25155 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2641  protein of unknown function UPF0118  25.14 
 
 		 408 aa  80.5  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.517547  normal  0.208528 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2001  permease  24.14 
 
 		 371 aa  80.1  0.00000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0568  hypothetical protein  23.99 
 
 		 366 aa  80.1  0.00000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0554  hypothetical protein  23.99 
 
 		 366 aa  79.7  0.00000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0221  protein of unknown function UPF0118  23.62 
 
 		 364 aa  79.7  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795849 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2165  hypothetical protein  22.01 
 
 		 414 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.128502  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  26.79 
 
 		 379 aa  79.3  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>