More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_3012 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_3012  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 		 369 aa  716    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2477  hypothetical protein  57.26 
 
 		 378 aa  363  3e-99  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2478  hypothetical protein  52.57 
 
 		 369 aa  355  5e-97  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1315  protein of unknown function UPF0118  51.22 
 
 		 369 aa  312  6.999999999999999e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.494628  normal  0.216518 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  37.03 
 
 		 371 aa  240  2e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  28.13 
 
 		 344 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  28 
 
 		 351 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  27.63 
 
 		 390 aa  114  3e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  28.66 
 
 		 393 aa  112  8.000000000000001e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1623  PerM family permease  26.87 
 
 		 367 aa  112  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.134997 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  25.14 
 
 		 343 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  27.68 
 
 		 405 aa  109  7.000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1164  hypothetical protein  29.73 
 
 		 457 aa  109  7.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.23073  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2050  hypothetical protein  26.18 
 
 		 368 aa  109  9.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116574  hitchhiker  0.00000000347502 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1855  hypothetical protein  26.65 
 
 		 368 aa  109  9.000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0735664  normal  0.142574 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1855  hypothetical protein  28.18 
 
 		 380 aa  108  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.631285 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3355  hypothetical protein  28.57 
 
 		 373 aa  108  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1871  membrane protein YubA  27.84 
 
 		 373 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3380  hypothetical protein  29.6 
 
 		 373 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3055  permease  29.6 
 
 		 376 aa  107  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0055436  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3161  hypothetical protein  29.6 
 
 		 376 aa  107  5e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000118258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3145  permease  29.6 
 
 		 376 aa  107  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000188051  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3410  hypothetical protein  29.6 
 
 		 376 aa  107  5e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3083  hypothetical protein  29.38 
 
 		 373 aa  106  5e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000376158  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  25.31 
 
 		 354 aa  106  7e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3381  membrane protein YubA  29.28 
 
 		 373 aa  105  9e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00559166  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1144  hypothetical protein  24.8 
 
 		 354 aa  104  2e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  unclonable  0.00155039  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3380  hypothetical protein  28.57 
 
 		 376 aa  104  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.300528  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1156  permease  26.67 
 
 		 382 aa  104  2e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0866214  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0457  hypothetical protein  28.37 
 
 		 383 aa  104  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  29.39 
 
 		 379 aa  103  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1056  hypothetical protein  27.3 
 
 		 398 aa  103  4e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  27.19 
 
 		 374 aa  103  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1773  hypothetical protein  25.23 
 
 		 357 aa  102  7e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000027115  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  24.63 
 
 		 349 aa  102  8e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4001  hypothetical protein  28.19 
 
 		 368 aa  102  9e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.591053 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2203  protein of unknown function UPF0118  28.11 
 
 		 397 aa  102  9e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0681126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2065  hypothetical protein  29.12 
 
 		 370 aa  102  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.76219  normal  0.0900338 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2339  protein of unknown function UPF0118  29.12 
 
 		 370 aa  102  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2994  hypothetical protein  30.36 
 
 		 360 aa  102  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687092 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  25.14 
 
 		 370 aa  101  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  24.43 
 
 		 351 aa  101  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2025  protein of unknown function UPF0118  28.85 
 
 		 370 aa  100  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.653838 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0456  protein of unknown function UPF0118  25.07 
 
 		 460 aa  100  3e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.204189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0728  protein of unknown function UPF0118  27.35 
 
 		 363 aa  100  5e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  25 
 
 		 361 aa  100  5e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0910  hypothetical protein  26.12 
 
 		 379 aa  99.8  7e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3687  hypothetical protein  29.12 
 
 		 357 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000304887 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4544  hypothetical protein  26.33 
 
 		 381 aa  98.2  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0195  hypothetical protein  27.9 
 
 		 384 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  23.73 
 
 		 349 aa  98.2  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1242  protein of unknown function UPF0118  27.63 
 
 		 374 aa  97.4  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  hitchhiker  0.00297495 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  27.02 
 
 		 392 aa  97.4  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  25.23 
 
 		 396 aa  97.4  4e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1964  hypothetical protein  28.66 
 
 		 378 aa  97.4  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  25.64 
 
 		 369 aa  96.7  6e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2164  hypothetical protein  27.39 
 
 		 369 aa  96.3  8e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  26.72 
 
 		 363 aa  95.9  9e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0224  protein of unknown function UPF0118  25.83 
 
 		 345 aa  95.9  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000072412  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  25.08 
 
 		 345 aa  95.5  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02243  permease  25.42 
 
 		 388 aa  95.5  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0120  protein of unknown function UPF0118  25.77 
 
 		 436 aa  95.1  2e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1667  hypothetical protein  28.8 
 
 		 357 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.629251 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  24.29 
 
 		 361 aa  94.7  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  24.29 
 
 		 361 aa  94.7  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08190  predicted permease  32.09 
 
 		 455 aa  94.7  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0210651 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10207  transmembrane protein  27.65 
 
 		 367 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  24.29 
 
 		 348 aa  94.7  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  24.29 
 
 		 361 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4051  hypothetical protein  28.8 
 
 		 354 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1265  hypothetical protein  28.34 
 
 		 357 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0876555 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  23.97 
 
 		 373 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0938  protein of unknown function UPF0118  28.35 
 
 		 420 aa  94  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  23.66 
 
 		 361 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1635  hypothetical protein  29.2 
 
 		 357 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.546399  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0779  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  27 
 
 		 375 aa  94.4  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.770407  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1113  hypothetical protein  26.98 
 
 		 363 aa  94.4  3e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0939063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  23.66 
 
 		 361 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0061  hypothetical protein  25.84 
 
 		 383 aa  94  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0961  protein of unknown function UPF0118  28.35 
 
 		 382 aa  94.4  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685895 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2435  hypothetical protein  27 
 
 		 358 aa  94.4  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0853714  normal  0.0537169 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0725  protein of unknown function UPF0118  28.86 
 
 		 347 aa  93.6  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0808655  hitchhiker  0.000000275011 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1702  permease, putative  28.53 
 
 		 357 aa  94  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.303674  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0571  hypothetical protein  28.86 
 
 		 347 aa  93.6  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.442056  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  23.97 
 
 		 361 aa  93.6  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  23.96 
 
 		 361 aa  93.6  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  23.71 
 
 		 402 aa  93.2  6e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  23.71 
 
 		 402 aa  93.2  6e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1297  hypothetical protein  27.3 
 
 		 382 aa  93.2  6e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.675511  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  23.97 
 
 		 348 aa  93.2  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2575  hypothetical protein  26.75 
 
 		 415 aa  93.2  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41372  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1252  hypothetical protein  30.85 
 
 		 376 aa  93.2  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  27.98 
 
 		 529 aa  93.2  7e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1428  hypothetical protein  28.57 
 
 		 547 aa  92  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1226  hypothetical protein  30.24 
 
 		 376 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2922  protein of unknown function UPF0118  25.46 
 
 		 357 aa  92  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.512956  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0400  hypothetical protein  27.51 
 
 		 357 aa  92  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2899  hypothetical protein  22.52 
 
 		 344 aa  92.4  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0256984  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1243  hypothetical protein  30.24 
 
 		 376 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.597847 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  22.94 
 
 		 341 aa  91.7  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>