More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1164 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1164  hypothetical protein  100 
 
 		 457 aa  882    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.23073  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1236  protein of unknown function UPF0118  76.61 
 
 		 439 aa  538  9.999999999999999e-153  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000518014 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0457  hypothetical protein  45.58 
 
 		 383 aa  309  8e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0322  hypothetical protein  47.37 
 
 		 487 aa  304  2.0000000000000002e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.084246  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08190  predicted permease  48.21 
 
 		 455 aa  302  8.000000000000001e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0210651 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0938  protein of unknown function UPF0118  50.44 
 
 		 420 aa  302  9e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0279  hypothetical protein  43.75 
 
 		 423 aa  296  6e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0267805 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0195  hypothetical protein  47.83 
 
 		 384 aa  290  3e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566996  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05050  predicted permease  46.15 
 
 		 405 aa  284  2.0000000000000002e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.187674  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2637  protein of unknown function UPF0118  51.57 
 
 		 421 aa  284  2.0000000000000002e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0169  hypothetical protein  43.28 
 
 		 381 aa  282  7.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0178  hypothetical protein  43.28 
 
 		 381 aa  282  7.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0159  hypothetical protein  43.28 
 
 		 381 aa  281  2e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0479062 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1895  protein of unknown function UPF0118  48.34 
 
 		 483 aa  274  2.0000000000000002e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23100  predicted permease  39.29 
 
 		 477 aa  271  1e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.741637  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0978  hypothetical protein  43.15 
 
 		 452 aa  263  6e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.42646  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10207  transmembrane protein  43.4 
 
 		 367 aa  259  1e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5305  hypothetical protein  40.52 
 
 		 464 aa  258  1e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.111321  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7052  protein of unknown function UPF0118  45.36 
 
 		 402 aa  256  9e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39490  predicted permease  46.53 
 
 		 403 aa  254  3e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.233759  normal  0.317185 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0238  hypothetical protein  42.07 
 
 		 421 aa  250  4e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.817468 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4482  protein of unknown function UPF0118  43.82 
 
 		 390 aa  249  6e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255906  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1098  protein of unknown function UPF0118  46.24 
 
 		 396 aa  237  4e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.370016  normal  0.531721 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1161  hypothetical protein  37.31 
 
 		 415 aa  234  3e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4772  protein of unknown function UPF0118  44.35 
 
 		 475 aa  220  5e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.808425  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0907  protein of unknown function UPF0118  41.62 
 
 		 423 aa  201  1.9999999999999998e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00600861  normal  0.0221352 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08290  predicted permease  39.29 
 
 		 367 aa  200  3.9999999999999996e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3393  protein of unknown function UPF0118  35.85 
 
 		 426 aa  192  1e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.334585  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2291  hypothetical protein  37.46 
 
 		 407 aa  191  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.370535  normal  0.257699 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21060  predicted permease  35.8 
 
 		 436 aa  188  1e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.152627  normal  0.29168 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1700  hypothetical protein  36.42 
 
 		 429 aa  189  1e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039584 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1468  protein of unknown function UPF0118  37.12 
 
 		 368 aa  182  1e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.916675  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2203  protein of unknown function UPF0118  38.22 
 
 		 397 aa  181  2.9999999999999997e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0681126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0503  protein of unknown function UPF0118  34.24 
 
 		 416 aa  178  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3105  hypothetical protein  36.6 
 
 		 389 aa  172  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2128  protein of unknown function UPF0118  37.5 
 
 		 444 aa  171  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.813628  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14120  predicted permease  32.68 
 
 		 476 aa  169  1e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.209203  normal  0.521602 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2026  protein of unknown function UPF0118  36.15 
 
 		 398 aa  168  2e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1252  hypothetical protein  38.54 
 
 		 376 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2286  protein of unknown function UPF0118  35.18 
 
 		 418 aa  166  5.9999999999999996e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0673264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3823  protein of unknown function UPF0118  36.72 
 
 		 390 aa  165  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0609806  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1881  hypothetical protein  31.4 
 
 		 435 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2806  protein of unknown function UPF0118  38.55 
 
 		 387 aa  164  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00669184 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1226  hypothetical protein  39.2 
 
 		 376 aa  163  7e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1243  hypothetical protein  39.2 
 
 		 376 aa  163  7e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.597847 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4850  hypothetical protein  36.63 
 
 		 394 aa  161  3e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2803  protein of unknown function UPF0118  32.61 
 
 		 441 aa  160  4e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.168707  normal  0.0979616 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6766  permease-like protein  37.27 
 
 		 432 aa  159  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1050  protein of unknown function UPF0118  38.54 
 
 		 384 aa  154  4e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3110  protein of unknown function UPF0118  34.83 
 
 		 414 aa  145  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4624  protein of unknown function UPF0118  37.64 
 
 		 393 aa  144  4e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2613  protein of unknown function UPF0118  39.74 
 
 		 392 aa  123  9e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.047245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7599  hypothetical protein  32.56 
 
 		 355 aa  121  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0354819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6257  protein of unknown function UPF0118  33.33 
 
 		 389 aa  119  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.707833  normal  0.194644 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6357  protein of unknown function UPF0118  30.51 
 
 		 363 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  29.4 
 
 		 363 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3308  protein of unknown function UPF0118  25.81 
 
 		 452 aa  103  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783017  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1315  protein of unknown function UPF0118  33.02 
 
 		 369 aa  103  6e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.494628  normal  0.216518 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  29.49 
 
 		 371 aa  103  7e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3012  protein of unknown function UPF0118  28.92 
 
 		 369 aa  101  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  27.35 
 
 		 358 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  31.11 
 
 		 529 aa  101  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  30.65 
 
 		 344 aa  100  7e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  24.18 
 
 		 393 aa  99.8  1e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3462  hypothetical protein  29.52 
 
 		 418 aa  97.8  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0247174 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0120  protein of unknown function UPF0118  25 
 
 		 436 aa  96.7  7e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2732  hypothetical protein  26.81 
 
 		 345 aa  96.7  8e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  27.52 
 
 		 369 aa  95.9  1e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15290  predicted permease  25.61 
 
 		 415 aa  93.2  8e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0209  protein of unknown function UPF0118  28.8 
 
 		 399 aa  93.2  9e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  23.56 
 
 		 373 aa  92  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1781  protein of unknown function UPF0118  27.25 
 
 		 368 aa  91.7  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.836553  hitchhiker  0.00769603 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  26.89 
 
 		 341 aa  91.7  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  26.22 
 
 		 390 aa  91.3  3e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2050  hypothetical protein  27.78 
 
 		 368 aa  91.3  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116574  hitchhiker  0.00000000347502 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  23.56 
 
 		 361 aa  91.3  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  27.04 
 
 		 354 aa  90.9  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  23.45 
 
 		 361 aa  90.5  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  24.52 
 
 		 405 aa  89.7  9e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  24.08 
 
 		 348 aa  89.7  9e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0061  hypothetical protein  28.76 
 
 		 383 aa  89.7  9e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4013  protein of unknown function UPF0118  25.19 
 
 		 389 aa  89.7  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00579473  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  23.01 
 
 		 361 aa  88.6  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  23.01 
 
 		 361 aa  88.6  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  23.01 
 
 		 361 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2668  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  30.68 
 
 		 665 aa  87.8  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  22.89 
 
 		 392 aa  88.2  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4731  protein of unknown function UPF0118  28.17 
 
 		 649 aa  88.2  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0106944 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  24.25 
 
 		 402 aa  88.2  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  24.25 
 
 		 402 aa  88.2  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  30.43 
 
 		 370 aa  87.4  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  24.02 
 
 		 361 aa  87.8  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2596  hypothetical protein  29.06 
 
 		 371 aa  87.4  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  24.02 
 
 		 361 aa  87.8  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  23.51 
 
 		 348 aa  87.4  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02243  permease  28.27 
 
 		 388 aa  87.4  5e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0657  permease  25.16 
 
 		 384 aa  87.4  5e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.036358  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  24.44 
 
 		 396 aa  85.5  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1247  protein of unknown function UPF0118  25.56 
 
 		 388 aa  85.9  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2329  protein of unknown function UPF0118  28.21 
 
 		 436 aa  85.5  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000385102 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>