More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2329 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2329  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 
436 aa  865    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000385102 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2596  hypothetical protein  81.55 
 
 
371 aa  554  1e-156  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  38.29 
 
 
529 aa  246  6.999999999999999e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09400  predicted permease  41.43 
 
 
357 aa  233  5e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.291782 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08230  predicted permease  44.5 
 
 
440 aa  221  3e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1793  hypothetical protein  39.12 
 
 
387 aa  212  1e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.116515  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8629  permease-like protein  35.77 
 
 
423 aa  206  7e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1694  permease-like protein  34.84 
 
 
443 aa  202  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111642  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0195  protein of unknown function UPF0118  35.38 
 
 
486 aa  192  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1247  protein of unknown function UPF0118  32.28 
 
 
388 aa  183  5.0000000000000004e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3997  hypothetical protein  31.64 
 
 
413 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00194517  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3615  hypothetical protein  34.07 
 
 
412 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7547  protein of unknown function UPF0118  34.66 
 
 
392 aa  167  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43907  normal  0.494892 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2284  protein of unknown function UPF0118  35.34 
 
 
406 aa  155  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00112442  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1608  hypothetical protein  33.61 
 
 
371 aa  149  7e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.55717  normal  0.0841628 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2868  protein of unknown function UPF0118  34.08 
 
 
400 aa  146  9e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6535  protein of unknown function UPF0118  28.03 
 
 
394 aa  145  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.278292  normal  0.0349253 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1731  protein of unknown function UPF0118  28.89 
 
 
373 aa  133  6.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2641  protein of unknown function UPF0118  33.88 
 
 
408 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.517547  normal  0.208528 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2165  hypothetical protein  32.48 
 
 
414 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.128502  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0209  protein of unknown function UPF0118  33.02 
 
 
399 aa  120  3.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0907  protein of unknown function UPF0118  34.36 
 
 
423 aa  120  7e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00600861  normal  0.0221352 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  27.8 
 
 
354 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0221  protein of unknown function UPF0118  30.31 
 
 
364 aa  114  3e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00795849 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4330  protein of unknown function UPF0118  29.87 
 
 
358 aa  114  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490644  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0322  hypothetical protein  32.19 
 
 
487 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.084246  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3466  protein of unknown function UPF0118  26.11 
 
 
448 aa  110  7.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.254752 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  31.49 
 
 
354 aa  109  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1485  protein of unknown function UPF0118  28.79 
 
 
455 aa  108  3e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.823858  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0279  hypothetical protein  30.87 
 
 
423 aa  106  7e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0267805 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4544  hypothetical protein  25.45 
 
 
381 aa  105  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  25.96 
 
 
361 aa  104  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  27.39 
 
 
361 aa  103  7e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  27.39 
 
 
361 aa  103  7e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  27.07 
 
 
361 aa  103  7e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  27.39 
 
 
348 aa  103  7e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  27.59 
 
 
402 aa  103  7e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  27.59 
 
 
402 aa  103  7e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  27.39 
 
 
361 aa  103  7e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  27.39 
 
 
361 aa  102  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  27.39 
 
 
348 aa  102  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2927  permease  27.3 
 
 
365 aa  102  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241708  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  27.39 
 
 
361 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  27.39 
 
 
373 aa  102  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15290  predicted permease  26.92 
 
 
415 aa  101  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  27.39 
 
 
361 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2478  hypothetical protein  27.04 
 
 
369 aa  101  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0518  protein of unknown function UPF0118  27.27 
 
 
397 aa  101  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.318359  normal  0.0533128 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2437  protein of unknown function UPF0118  25.93 
 
 
386 aa  100  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000151216  normal  0.0209402 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1315  protein of unknown function UPF0118  27.92 
 
 
369 aa  99.8  8e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.494628  normal  0.216518 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3393  protein of unknown function UPF0118  29.62 
 
 
426 aa  97.4  4e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.334585  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3369  protein of unknown function UPF0118  27.65 
 
 
344 aa  96.7  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  28.84 
 
 
370 aa  96.7  8e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3926  protein of unknown function UPF0118  27.19 
 
 
340 aa  96.7  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2392  hypothetical protein  25.52 
 
 
349 aa  96.7  8e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.89361 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0195  hypothetical protein  31.16 
 
 
384 aa  96.3  9e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566996  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2128  protein of unknown function UPF0118  28.96 
 
 
444 aa  96.3  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.813628  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3012  protein of unknown function UPF0118  26.54 
 
 
369 aa  96.3  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  24.26 
 
 
371 aa  95.9  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2742  protein of unknown function UPF0118  27.03 
 
 
344 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0922989  unclonable  0.00000000268058 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5351  protein of unknown function UPF0118  26.96 
 
 
364 aa  96.3  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0138969  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14120  predicted permease  29.29 
 
 
476 aa  95.5  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.209203  normal  0.521602 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0503  protein of unknown function UPF0118  28.32 
 
 
416 aa  95.5  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2491  protein of unknown function UPF0118  26.62 
 
 
353 aa  94  5e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0938  protein of unknown function UPF0118  31.48 
 
 
420 aa  93.6  6e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26240  predicted permease  27.65 
 
 
400 aa  93.6  6e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4060  hypothetical protein  26.79 
 
 
404 aa  93.2  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000137982  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1841  permease  27.17 
 
 
563 aa  92.4  1e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2050  hypothetical protein  28.44 
 
 
368 aa  92.8  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116574  hitchhiker  0.00000000347502 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2203  protein of unknown function UPF0118  26.69 
 
 
397 aa  91.7  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0681126  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0061  hypothetical protein  27.7 
 
 
383 aa  92  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  23.4 
 
 
405 aa  91.3  3e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2262  hypothetical protein  29.35 
 
 
381 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0141033  normal  0.407022 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1164  hypothetical protein  28.21 
 
 
457 aa  91.3  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.23073  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1252  hypothetical protein  27.55 
 
 
376 aa  90.9  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4216  hypothetical protein  35.8 
 
 
346 aa  90.1  7e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.329203  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5305  hypothetical protein  28.15 
 
 
464 aa  90.1  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.111321  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0340  hypothetical protein  29.35 
 
 
340 aa  89.7  9e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3424  hypothetical protein  25.87 
 
 
403 aa  89.7  9e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000157289  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0457  hypothetical protein  29.38 
 
 
383 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3786  protein of unknown function UPF0118  25.15 
 
 
386 aa  89.4  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.262236  normal  0.0203414 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3308  protein of unknown function UPF0118  26.05 
 
 
452 aa  89.4  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783017  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2554  hypothetical protein  27.61 
 
 
356 aa  89.4  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1984  hypothetical protein  29.35 
 
 
340 aa  88.6  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.372704  normal  0.185401 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0522  hypothetical protein  22.95 
 
 
377 aa  88.6  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.176917  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0956  hypothetical protein  27.24 
 
 
349 aa  89  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0392869 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10207  transmembrane protein  29.79 
 
 
367 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0779  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  27.51 
 
 
375 aa  88.2  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.770407  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0978  hypothetical protein  26.56 
 
 
452 aa  87.8  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.42646  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1226  hypothetical protein  27.14 
 
 
376 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1243  hypothetical protein  27.14 
 
 
376 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.597847 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2435  hypothetical protein  27.51 
 
 
358 aa  87.4  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0853714  normal  0.0537169 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2899  hypothetical protein  24.84 
 
 
344 aa  86.7  8e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0256984  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0716  hypothetical protein  23.71 
 
 
366 aa  86.3  9e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.073836  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2806  hypothetical protein  26.18 
 
 
372 aa  86.3  9e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.217461  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1056  hypothetical protein  26.54 
 
 
398 aa  85.9  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3129  hypothetical protein  28.16 
 
 
418 aa  86.3  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1556  hypothetical protein  26.1 
 
 
407 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0657  permease  26.99 
 
 
384 aa  85.1  0.000000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.036358  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  22.63 
 
 
349 aa  84.3  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>