More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5305 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5305  hypothetical protein  100 
 
 		 464 aa  872    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.111321  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1161  hypothetical protein  81.53 
 
 		 415 aa  523  1e-147  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0322  hypothetical protein  47.01 
 
 		 487 aa  285  9e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.084246  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0279  hypothetical protein  45.11 
 
 		 423 aa  277  3e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0267805 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0169  hypothetical protein  46.27 
 
 		 381 aa  259  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0178  hypothetical protein  46.27 
 
 		 381 aa  259  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0159  hypothetical protein  46.27 
 
 		 381 aa  259  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0479062 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0457  hypothetical protein  44.99 
 
 		 383 aa  259  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1164  hypothetical protein  40.52 
 
 		 457 aa  254  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.23073  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0195  hypothetical protein  46.73 
 
 		 384 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0978  hypothetical protein  42.98 
 
 		 452 aa  253  7e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.42646  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0938  protein of unknown function UPF0118  43.8 
 
 		 420 aa  252  1e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2291  hypothetical protein  41.23 
 
 		 407 aa  243  7e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.370535  normal  0.257699 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1700  hypothetical protein  40.97 
 
 		 429 aa  241  2e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039584 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1236  protein of unknown function UPF0118  42.24 
 
 		 439 aa  240  4e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000518014 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4482  protein of unknown function UPF0118  42.61 
 
 		 390 aa  238  2e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255906  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7052  protein of unknown function UPF0118  43.22 
 
 		 402 aa  235  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10207  transmembrane protein  42.69 
 
 		 367 aa  231  1e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6766  permease-like protein  44.44 
 
 		 432 aa  228  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4772  protein of unknown function UPF0118  46.78 
 
 		 475 aa  224  4e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.808425  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0238  hypothetical protein  41.81 
 
 		 421 aa  223  7e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.817468 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08190  predicted permease  37.91 
 
 		 455 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0210651 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2637  protein of unknown function UPF0118  40.4 
 
 		 421 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1098  protein of unknown function UPF0118  44.44 
 
 		 396 aa  212  1e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.370016  normal  0.531721 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1895  protein of unknown function UPF0118  39.15 
 
 		 483 aa  211  2e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23100  predicted permease  37.36 
 
 		 477 aa  211  3e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.741637  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39490  predicted permease  43.8 
 
 		 403 aa  207  4e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.233759  normal  0.317185 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21060  predicted permease  35.76 
 
 		 436 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.152627  normal  0.29168 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05050  predicted permease  38.64 
 
 		 405 aa  186  8e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.187674  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2806  protein of unknown function UPF0118  40.76 
 
 		 387 aa  182  1e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00669184 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1468  protein of unknown function UPF0118  37.8 
 
 		 368 aa  181  2e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.916675  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2286  protein of unknown function UPF0118  35.61 
 
 		 418 aa  181  2.9999999999999997e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0673264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4624  protein of unknown function UPF0118  41.64 
 
 		 393 aa  179  9e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2026  protein of unknown function UPF0118  36.51 
 
 		 398 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3105  hypothetical protein  38.12 
 
 		 389 aa  174  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1252  hypothetical protein  38.36 
 
 		 376 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3393  protein of unknown function UPF0118  32.36 
 
 		 426 aa  173  5e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.334585  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0907  protein of unknown function UPF0118  35.55 
 
 		 423 aa  171  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00600861  normal  0.0221352 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14120  predicted permease  39.46 
 
 		 476 aa  171  2e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.209203  normal  0.521602 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0503  protein of unknown function UPF0118  34.79 
 
 		 416 aa  169  7e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2128  protein of unknown function UPF0118  37.35 
 
 		 444 aa  169  1e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.813628  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4850  hypothetical protein  37.15 
 
 		 394 aa  169  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08290  predicted permease  36.13 
 
 		 367 aa  168  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3823  protein of unknown function UPF0118  38.14 
 
 		 390 aa  168  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0609806  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1226  hypothetical protein  42.29 
 
 		 376 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1243  hypothetical protein  42.29 
 
 		 376 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.597847 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2203  protein of unknown function UPF0118  35.53 
 
 		 397 aa  167  5e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0681126  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1050  protein of unknown function UPF0118  41.75 
 
 		 384 aa  160  6e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2803  protein of unknown function UPF0118  33.82 
 
 		 441 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.168707  normal  0.0979616 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1881  hypothetical protein  31.32 
 
 		 435 aa  143  6e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2613  protein of unknown function UPF0118  36.08 
 
 		 392 aa  141  3e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.047245  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3110  protein of unknown function UPF0118  35.94 
 
 		 414 aa  137  4e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7599  hypothetical protein  36.1 
 
 		 355 aa  114  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0354819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6257  protein of unknown function UPF0118  37.73 
 
 		 389 aa  111  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.707833  normal  0.194644 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  28.34 
 
 		 529 aa  109  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0657  permease  30.54 
 
 		 384 aa  105  1e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.036358  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  30 
 
 		 354 aa  99.4  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2201  hypothetical protein  31.51 
 
 		 365 aa  98.6  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000750597  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0823  protein of unknown function UPF0118  27.89 
 
 		 358 aa  97.4  4e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74505  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2575  hypothetical protein  30.62 
 
 		 415 aa  96.7  8e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41372  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  26.36 
 
 		 390 aa  96.7  8e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1964  hypothetical protein  29.41 
 
 		 378 aa  93.6  7e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  24.85 
 
 		 343 aa  93.6  8e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  30.91 
 
 		 370 aa  92.8  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0518  protein of unknown function UPF0118  29.2 
 
 		 397 aa  92.8  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.318359  normal  0.0533128 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2482  hypothetical protein  25.98 
 
 		 359 aa  92.8  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0793  hypothetical protein  26.15 
 
 		 379 aa  92.4  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114477  normal  0.678459 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1757  hypothetical protein  29.57 
 
 		 360 aa  92  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.805933  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3615  hypothetical protein  28.24 
 
 		 412 aa  90.9  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1694  permease-like protein  26.54 
 
 		 443 aa  89.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111642  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  24.76 
 
 		 358 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4013  protein of unknown function UPF0118  26.4 
 
 		 389 aa  88.6  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00579473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  25.5 
 
 		 379 aa  88.2  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  25.16 
 
 		 392 aa  88.2  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1352  protein of unknown function UPF0118  27.52 
 
 		 438 aa  87.8  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  25.46 
 
 		 349 aa  87.8  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1056  hypothetical protein  28.75 
 
 		 398 aa  87.8  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  26.14 
 
 		 371 aa  87.8  4e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  26.4 
 
 		 402 aa  86.3  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  23.91 
 
 		 361 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  26.4 
 
 		 402 aa  86.3  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5162  hypothetical protein  30.15 
 
 		 382 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235316  normal  0.0183443 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1300  hypothetical protein  28.19 
 
 		 434 aa  85.9  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.493989  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3845  hypothetical protein  28.17 
 
 		 406 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.521345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3129  hypothetical protein  25 
 
 		 418 aa  85.1  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3116  membrane transporter  28.17 
 
 		 388 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  26.38 
 
 		 363 aa  85.9  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4060  hypothetical protein  25 
 
 		 404 aa  84.7  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000137982  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1649  hypothetical protein  28.95 
 
 		 360 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.673436  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  23.31 
 
 		 361 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2485  hypothetical protein  28.5 
 
 		 435 aa  84.7  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.957524  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  24 
 
 		 405 aa  84  0.000000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0061  hypothetical protein  26.46 
 
 		 383 aa  84  0.000000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2868  protein of unknown function UPF0118  28.91 
 
 		 400 aa  83.6  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  22.41 
 
 		 373 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  26.3 
 
 		 355 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  26.3 
 
 		 355 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  26.3 
 
 		 355 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  26.3 
 
 		 355 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6535  protein of unknown function UPF0118  26.32 
 
 		 394 aa  82.8  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.278292  normal  0.0349253 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>